Protein–RNA interactions for Protein: Q92696

RABGGTA, Geranylgeranyl transferase type-2 subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 567 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGGTAQ92696 ZNF12-204ENST00000405858 5051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
RABGGTAQ92696 SH2D3C-203ENST00000373277 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
RABGGTAQ92696 CTSB-202ENST00000353047 3875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
RABGGTAQ92696 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
RABGGTAQ92696 AC139713.2-201ENST00000641328 2723 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
RABGGTAQ92696 CD276-203ENST00000537340 2439 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
RABGGTAQ92696 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
RABGGTAQ92696 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC20.35■□□□□ 0.85
RABGGTAQ92696 C8orf58-207ENST00000615223 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
RABGGTAQ92696 NOMO3-202ENST00000399336 4356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
RABGGTAQ92696 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
RABGGTAQ92696 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
RABGGTAQ92696 C17orf49-208ENST00000552402 760 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
RABGGTAQ92696 DFFB-212ENST00000625756 649 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
RABGGTAQ92696 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
RABGGTAQ92696 LTBP3-202ENST00000322147 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
RABGGTAQ92696 OBSL1-203ENST00000373876 5503 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
RABGGTAQ92696 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
RABGGTAQ92696 ARNTL-205ENST00000403510 2745 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
RABGGTAQ92696 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
RABGGTAQ92696 ADAM15-207ENST00000368413 1901 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
RABGGTAQ92696 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
RABGGTAQ92696 ATP2A2-201ENST00000308664 4453 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
RABGGTAQ92696 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
RABGGTAQ92696 POMT2-201ENST00000261534 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
RABGGTAQ92696 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
RABGGTAQ92696 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
RABGGTAQ92696 GSDMD-206ENST00000526406 2496 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
RABGGTAQ92696 TP73-AS1-203ENST00000423764 2875 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
RABGGTAQ92696 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
RABGGTAQ92696 EIF3B-201ENST00000360876 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
RABGGTAQ92696 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC20.34■□□□□ 0.85
RABGGTAQ92696 GAB1-201ENST00000262994 2648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
RABGGTAQ92696 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
RABGGTAQ92696 KLHL33-202ENST00000636854 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
RABGGTAQ92696 SUSD2-201ENST00000358321 3404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
RABGGTAQ92696 NOP9-202ENST00000396802 1942 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
RABGGTAQ92696 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
RABGGTAQ92696 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
RABGGTAQ92696 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
RABGGTAQ92696 AL671277.2-201ENST00000458060 996 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
RABGGTAQ92696 AF250324.1-201ENST00000506276 703 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
RABGGTAQ92696 NMU-205ENST00000511469 756 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
RABGGTAQ92696 MRPL46-202ENST00000558531 1002 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
RABGGTAQ92696 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
RABGGTAQ92696 RNASET2-213ENST00000611959 1124 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
RABGGTAQ92696 PRDM8-203ENST00000504452 3706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
RABGGTAQ92696 TRPV4-208ENST00000544971 2295 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
RABGGTAQ92696 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
RABGGTAQ92696 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
RABGGTAQ92696 ARHGAP22-203ENST00000374172 2380 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
RABGGTAQ92696 PRORSD1P-202ENST00000563365 2154 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
RABGGTAQ92696 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
RABGGTAQ92696 CLMP-201ENST00000448775 5072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
RABGGTAQ92696 MAPKAPK3-201ENST00000357955 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
RABGGTAQ92696 PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 2537 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
RABGGTAQ92696 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
RABGGTAQ92696 RILPL2-201ENST00000280571 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
RABGGTAQ92696 PHLDA1-202ENST00000602540 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
RABGGTAQ92696 SMC4-201ENST00000344722 5356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
RABGGTAQ92696 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
RABGGTAQ92696 ACTN3-203ENST00000513398 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
RABGGTAQ92696 FBXL15-201ENST00000224862 2362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
RABGGTAQ92696 GUCA1B-201ENST00000230361 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
RABGGTAQ92696 FAM86B2-202ENST00000309608 806 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
RABGGTAQ92696 ISCA1-202ENST00000326094 1264 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
RABGGTAQ92696 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
RABGGTAQ92696 AC004540.1-201ENST00000439120 891 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
RABGGTAQ92696 HOMER2P1-201ENST00000455653 964 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
RABGGTAQ92696 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
RABGGTAQ92696 FAM86EP-206ENST00000510506 987 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
RABGGTAQ92696 AF186192.2-201ENST00000524514 423 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
RABGGTAQ92696 KRTCAP3-207ENST00000543753 956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
RABGGTAQ92696 AC140504.1-202ENST00000568222 652 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
RABGGTAQ92696 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
RABGGTAQ92696 NFATC1-210ENST00000587635 2195 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
RABGGTAQ92696 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
RABGGTAQ92696 KDM1A-201ENST00000356634 3033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
RABGGTAQ92696 ALDH4A1-201ENST00000290597 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
RABGGTAQ92696 ZNF454-202ENST00000519564 2142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
RABGGTAQ92696 SLC35F5-201ENST00000245680 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
RABGGTAQ92696 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
RABGGTAQ92696 ADK-202ENST00000372734 2083 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
RABGGTAQ92696 GATB-213ENST00000515812 1893 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
RABGGTAQ92696 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
RABGGTAQ92696 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
RABGGTAQ92696 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
RABGGTAQ92696 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
RABGGTAQ92696 DCLK1-203ENST00000379892 2101 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
RABGGTAQ92696 PLEKHG5-201ENST00000340850 4715 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
RABGGTAQ92696 PLEKHG5-211ENST00000535355 4725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
RABGGTAQ92696 TMEM171-201ENST00000287773 1247 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
RABGGTAQ92696 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
RABGGTAQ92696 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
RABGGTAQ92696 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
RABGGTAQ92696 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
RABGGTAQ92696 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
RABGGTAQ92696 C16orf91-201ENST00000442039 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
RABGGTAQ92696 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
RABGGTAQ92696 NBPF14-202ENST00000593495 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 96.4 ms