Protein–RNA interactions for Protein: Q92664

GTF3A, Transcription factor IIIA, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 365 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF3AQ92664 CBFB-203ENST00000561924 584 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
GTF3AQ92664 KRT8P50-201ENST00000562022 1438 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
GTF3AQ92664 AC087388.1-201ENST00000571370 1112 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
GTF3AQ92664 AC010422.3-201ENST00000597692 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
GTF3AQ92664 FBXL18-205ENST00000620087 2076 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
GTF3AQ92664 DFFB-212ENST00000625756 649 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
GTF3AQ92664 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
GTF3AQ92664 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
GTF3AQ92664 FAM117B-201ENST00000392238 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
GTF3AQ92664 SEC14L2-215ENST00000617837 2632 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
GTF3AQ92664 ARNT-202ENST00000358595 4887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
GTF3AQ92664 SEPHS1-202ENST00000378614 2387 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
GTF3AQ92664 MAFF-207ENST00000538999 2365 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
GTF3AQ92664 SERPINF2-202ENST00000382061 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
GTF3AQ92664 ZBP1-202ENST00000395822 2073 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
GTF3AQ92664 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
GTF3AQ92664 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
GTF3AQ92664 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
GTF3AQ92664 OSMR-202ENST00000502536 1740 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
GTF3AQ92664 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
GTF3AQ92664 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
GTF3AQ92664 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
GTF3AQ92664 WNK2-204ENST00000427277 6108 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
GTF3AQ92664 INTS11-249ENST00000618806 1523 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
GTF3AQ92664 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
GTF3AQ92664 FAM66C-209ENST00000544214 2623 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
GTF3AQ92664 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
GTF3AQ92664 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
GTF3AQ92664 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
GTF3AQ92664 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
GTF3AQ92664 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
GTF3AQ92664 ZNF706-206ENST00000519744 785 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
GTF3AQ92664 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
GTF3AQ92664 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
GTF3AQ92664 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
GTF3AQ92664 AC015961.2-201ENST00000589281 701 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
GTF3AQ92664 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
GTF3AQ92664 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
GTF3AQ92664 ZBTB47-202ENST00000505904 2456 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
GTF3AQ92664 PHF12-202ENST00000332830 4759 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
GTF3AQ92664 KRT86-202ENST00000423955 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
GTF3AQ92664 NPLOC4-201ENST00000331134 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
GTF3AQ92664 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
GTF3AQ92664 BANP-202ENST00000355022 2164 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
GTF3AQ92664 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
GTF3AQ92664 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
GTF3AQ92664 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
GTF3AQ92664 ZNF668-202ENST00000394983 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
GTF3AQ92664 SSUH2-202ENST00000341795 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
GTF3AQ92664 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
GTF3AQ92664 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
GTF3AQ92664 KIFC3-203ENST00000445690 3379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
GTF3AQ92664 CCNJL-203ENST00000393977 3320 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
GTF3AQ92664 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
GTF3AQ92664 LRRC25-201ENST00000339007 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
GTF3AQ92664 RABL2B-205ENST00000395595 2428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
GTF3AQ92664 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
GTF3AQ92664 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
GTF3AQ92664 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
GTF3AQ92664 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
GTF3AQ92664 ZNF446-203ENST00000594369 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
GTF3AQ92664 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
GTF3AQ92664 MED25-212ENST00000618715 1467 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
GTF3AQ92664 HOXB1-202ENST00000577092 1414 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
GTF3AQ92664 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
GTF3AQ92664 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
GTF3AQ92664 WDTC1-201ENST00000319394 4819 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
GTF3AQ92664 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
GTF3AQ92664 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
GTF3AQ92664 TCF25-225ENST00000614813 2047 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
GTF3AQ92664 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
GTF3AQ92664 AC114763.1-202ENST00000414911 867 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
GTF3AQ92664 SAPCD2P2-201ENST00000431719 1174 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
GTF3AQ92664 AC112907.2-201ENST00000448639 330 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
GTF3AQ92664 AC019068.1-202ENST00000483218 768 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
GTF3AQ92664 CCNG1-211ENST00000512163 919 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
GTF3AQ92664 RPL26L1-205ENST00000519974 695 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
GTF3AQ92664 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
GTF3AQ92664 C14orf144-201ENST00000553757 537 ntTSL 4 BASIC15.79■□□□□ 0.12
GTF3AQ92664 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC15.79■□□□□ 0.12
GTF3AQ92664 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
GTF3AQ92664 PSMD8-202ENST00000585598 541 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
GTF3AQ92664 YIPF2-209ENST00000590329 958 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
GTF3AQ92664 AC010240.3-201ENST00000607688 395 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
GTF3AQ92664 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
GTF3AQ92664 AKT1S1-207ENST00000391835 3075 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
GTF3AQ92664 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
GTF3AQ92664 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
GTF3AQ92664 NAP1L5-201ENST00000323061 2321 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
GTF3AQ92664 KSR1-201ENST00000268763 2806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
GTF3AQ92664 TES-201ENST00000358204 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
GTF3AQ92664 AC011416.4-201ENST00000639283 2195 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
GTF3AQ92664 PDE9A-209ENST00000398227 1606 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
GTF3AQ92664 CIRBP-202ENST00000413636 1606 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
GTF3AQ92664 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
GTF3AQ92664 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
GTF3AQ92664 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
GTF3AQ92664 GALNT10-201ENST00000297107 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
GTF3AQ92664 MADD-208ENST00000405573 1823 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
GTF3AQ92664 PRSS23-201ENST00000280258 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.5 ms