Protein–RNA interactions for Protein: Q8WWF3

SSMEM1, Serine-rich single-pass membrane protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 244 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSMEM1Q8WWF3 WNT8B-201ENST00000343737 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SSMEM1Q8WWF3 FZD10-202ENST00000539839 3282 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
SSMEM1Q8WWF3 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SSMEM1Q8WWF3 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SSMEM1Q8WWF3 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SSMEM1Q8WWF3 FAM53C-211ENST00000513056 923 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SSMEM1Q8WWF3 EEF1D-243ENST00000532400 419 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SSMEM1Q8WWF3 AC132938.3-201ENST00000579095 357 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SSMEM1Q8WWF3 NT5C-210ENST00000582160 860 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SSMEM1Q8WWF3 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SSMEM1Q8WWF3 RNASET2-213ENST00000611959 1124 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SSMEM1Q8WWF3 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SSMEM1Q8WWF3 AC027682.6-202ENST00000621378 795 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SSMEM1Q8WWF3 SLC35A3-217ENST00000639807 2767 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SSMEM1Q8WWF3 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SSMEM1Q8WWF3 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SSMEM1Q8WWF3 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SSMEM1Q8WWF3 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SSMEM1Q8WWF3 HMGXB3-206ENST00000613459 5567 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SSMEM1Q8WWF3 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SSMEM1Q8WWF3 SERPINF2-202ENST00000382061 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SSMEM1Q8WWF3 MAN1B1-207ENST00000535144 2296 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SSMEM1Q8WWF3 NUMBL-202ENST00000540131 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SSMEM1Q8WWF3 NINL-201ENST00000278886 4969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SSMEM1Q8WWF3 KCNK3-201ENST00000302909 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SSMEM1Q8WWF3 CDC42EP3-201ENST00000295324 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SSMEM1Q8WWF3 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SSMEM1Q8WWF3 ISLR2-210ENST00000565540 2780 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SSMEM1Q8WWF3 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SSMEM1Q8WWF3 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SSMEM1Q8WWF3 ENPP1-201ENST00000360971 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SSMEM1Q8WWF3 SOCS3-201ENST00000330871 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SSMEM1Q8WWF3 AL133373.2-201ENST00000623187 2828 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
SSMEM1Q8WWF3 DNLZ-202ENST00000371739 2934 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SSMEM1Q8WWF3 PIF1-205ENST00000559239 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SSMEM1Q8WWF3 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SSMEM1Q8WWF3 UBL3-201ENST00000380680 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SSMEM1Q8WWF3 C16orf91-201ENST00000442039 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SSMEM1Q8WWF3 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SSMEM1Q8WWF3 FOSL1-203ENST00000531493 1200 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SSMEM1Q8WWF3 TCTN1-223ENST00000550703 2149 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SSMEM1Q8WWF3 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SSMEM1Q8WWF3 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SSMEM1Q8WWF3 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SSMEM1Q8WWF3 SPINK2-207ENST00000631082 392 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SSMEM1Q8WWF3 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SSMEM1Q8WWF3 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SSMEM1Q8WWF3 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SSMEM1Q8WWF3 DAPK1-207ENST00000469640 5899 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SSMEM1Q8WWF3 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SSMEM1Q8WWF3 AL031598.1-201ENST00000561511 1773 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
SSMEM1Q8WWF3 PACSIN2-203ENST00000402229 1883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SSMEM1Q8WWF3 ZNF395-211ENST00000523202 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SSMEM1Q8WWF3 SNAI3-AS1-202ENST00000563475 2081 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SSMEM1Q8WWF3 CACNA1A-253ENST00000637927 6847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SSMEM1Q8WWF3 ANKRD10-201ENST00000267339 2495 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SSMEM1Q8WWF3 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SSMEM1Q8WWF3 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SSMEM1Q8WWF3 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
SSMEM1Q8WWF3 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SSMEM1Q8WWF3 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SSMEM1Q8WWF3 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
SSMEM1Q8WWF3 AL031658.1-201ENST00000449519 2013 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SSMEM1Q8WWF3 PDE6B-202ENST00000429163 2120 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SSMEM1Q8WWF3 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SSMEM1Q8WWF3 WIPI2-201ENST00000288828 4476 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SSMEM1Q8WWF3 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SSMEM1Q8WWF3 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SSMEM1Q8WWF3 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SSMEM1Q8WWF3 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SSMEM1Q8WWF3 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SSMEM1Q8WWF3 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SSMEM1Q8WWF3 IER3-202ENST00000376377 1350 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
SSMEM1Q8WWF3 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SSMEM1Q8WWF3 GPX4-201ENST00000354171 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SSMEM1Q8WWF3 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SSMEM1Q8WWF3 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SSMEM1Q8WWF3 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
SSMEM1Q8WWF3 PCED1CP-201ENST00000419887 785 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
SSMEM1Q8WWF3 ZNF575-205ENST00000601282 1086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SSMEM1Q8WWF3 AC005906.2-206ENST00000638180 1029 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SSMEM1Q8WWF3 BEGAIN-211ENST00000637646 2911 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SSMEM1Q8WWF3 DNM1-211ENST00000627061 2724 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SSMEM1Q8WWF3 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SSMEM1Q8WWF3 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SSMEM1Q8WWF3 SGSM2-202ENST00000426855 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SSMEM1Q8WWF3 NCOA6-207ENST00000616167 3271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SSMEM1Q8WWF3 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SSMEM1Q8WWF3 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SSMEM1Q8WWF3 TMEM214-201ENST00000238788 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SSMEM1Q8WWF3 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SSMEM1Q8WWF3 HNRNPUL1-203ENST00000378215 2864 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SSMEM1Q8WWF3 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SSMEM1Q8WWF3 KDSR-202ENST00000406396 5447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SSMEM1Q8WWF3 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SSMEM1Q8WWF3 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SSMEM1Q8WWF3 KCNC4-203ENST00000413138 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SSMEM1Q8WWF3 HR-201ENST00000312841 5351 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SSMEM1Q8WWF3 IPMK-201ENST00000373935 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SSMEM1Q8WWF3 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.4 ms