Protein–RNA interactions for Protein: Q8WUD4

CCDC12, Coiled-coil domain-containing protein 12, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 166 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC12Q8WUD4 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CCDC12Q8WUD4 SHANK1-202ENST00000359082 6459 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CCDC12Q8WUD4 RAP1GAP-204ENST00000374761 3318 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CCDC12Q8WUD4 ZNF12-204ENST00000405858 5051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CCDC12Q8WUD4 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CCDC12Q8WUD4 HAUS8-202ENST00000448593 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CCDC12Q8WUD4 ZNF274-212ENST00000617501 2538 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CCDC12Q8WUD4 GSDMD-201ENST00000262580 1762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CCDC12Q8WUD4 PSTK-201ENST00000368887 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CCDC12Q8WUD4 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CCDC12Q8WUD4 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CCDC12Q8WUD4 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CCDC12Q8WUD4 MAN1B1-207ENST00000535144 2296 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CCDC12Q8WUD4 FIGNL2-201ENST00000564840 4693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CCDC12Q8WUD4 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CCDC12Q8WUD4 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CCDC12Q8WUD4 SLBP-201ENST00000318386 1635 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CCDC12Q8WUD4 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CCDC12Q8WUD4 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CCDC12Q8WUD4 NOP14-204ENST00000502735 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CCDC12Q8WUD4 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CCDC12Q8WUD4 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CCDC12Q8WUD4 AC112907.2-201ENST00000448639 330 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
CCDC12Q8WUD4 KRT18P38-201ENST00000449496 1282 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
CCDC12Q8WUD4 PEX5L-206ENST00000465751 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CCDC12Q8WUD4 AL136038.4-201ENST00000603606 1261 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
CCDC12Q8WUD4 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
CCDC12Q8WUD4 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CCDC12Q8WUD4 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CCDC12Q8WUD4 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CCDC12Q8WUD4 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CCDC12Q8WUD4 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CCDC12Q8WUD4 WNK2-202ENST00000395477 6834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CCDC12Q8WUD4 PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 2537 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CCDC12Q8WUD4 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CCDC12Q8WUD4 TMEM255B-202ENST00000375353 6100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CCDC12Q8WUD4 AC087457.1-201ENST00000503496 2727 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CCDC12Q8WUD4 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CCDC12Q8WUD4 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CCDC12Q8WUD4 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CCDC12Q8WUD4 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CCDC12Q8WUD4 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CCDC12Q8WUD4 AC090164.3-201ENST00000610780 2143 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
CCDC12Q8WUD4 INTS10-201ENST00000397977 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CCDC12Q8WUD4 LRRC27-201ENST00000344079 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CCDC12Q8WUD4 CYB561-205ENST00000542042 1302 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CCDC12Q8WUD4 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CCDC12Q8WUD4 AC005332.8-201ENST00000622750 2735 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
CCDC12Q8WUD4 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CCDC12Q8WUD4 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CCDC12Q8WUD4 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CCDC12Q8WUD4 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CCDC12Q8WUD4 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
CCDC12Q8WUD4 LTBP3-202ENST00000322147 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CCDC12Q8WUD4 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CCDC12Q8WUD4 MED25-212ENST00000618715 1467 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CCDC12Q8WUD4 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CCDC12Q8WUD4 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CCDC12Q8WUD4 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CCDC12Q8WUD4 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CCDC12Q8WUD4 THOP1-205ENST00000586677 1872 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CCDC12Q8WUD4 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CCDC12Q8WUD4 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CCDC12Q8WUD4 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CCDC12Q8WUD4 CABIN1-202ENST00000337989 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CCDC12Q8WUD4 GMCL1P1-201ENST00000463439 1581 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
CCDC12Q8WUD4 DOC2A-208ENST00000564944 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CCDC12Q8WUD4 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CCDC12Q8WUD4 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CCDC12Q8WUD4 LUC7L-221ENST00000629543 1520 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CCDC12Q8WUD4 NIFK-201ENST00000285814 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CCDC12Q8WUD4 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CCDC12Q8WUD4 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CCDC12Q8WUD4 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CCDC12Q8WUD4 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CCDC12Q8WUD4 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CCDC12Q8WUD4 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CCDC12Q8WUD4 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CCDC12Q8WUD4 AL035541.1-201ENST00000424850 823 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CCDC12Q8WUD4 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CCDC12Q8WUD4 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CCDC12Q8WUD4 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CCDC12Q8WUD4 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CCDC12Q8WUD4 AGO4-201ENST00000373210 7116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CCDC12Q8WUD4 AC104581.1-202ENST00000635932 2618 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
CCDC12Q8WUD4 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CCDC12Q8WUD4 CDK5R1-201ENST00000313401 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CCDC12Q8WUD4 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
CCDC12Q8WUD4 HYOU1-212ENST00000532519 2162 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CCDC12Q8WUD4 SEPT11-201ENST00000264893 5593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CCDC12Q8WUD4 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CCDC12Q8WUD4 AL445433.2-201ENST00000425113 2544 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CCDC12Q8WUD4 INO80E-207ENST00000563197 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CCDC12Q8WUD4 AC254629.1-202ENST00000618276 2112 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CCDC12Q8WUD4 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CCDC12Q8WUD4 ZBTB8A-201ENST00000316459 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CCDC12Q8WUD4 TMEM177-204ENST00000424086 1738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CCDC12Q8WUD4 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CCDC12Q8WUD4 CIAO1-203ENST00000488633 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CCDC12Q8WUD4 RAB11FIP2-202ENST00000369199 6119 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38 ms