Protein–RNA interactions for Protein: Q8TDI8

TMC1, Transmembrane channel-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 760 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMC1Q8TDI8 CNPY2-201ENST00000273308 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
TMC1Q8TDI8 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
TMC1Q8TDI8 SKP2-204ENST00000508514 821 ntTSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
TMC1Q8TDI8 KRT18P41-201ENST00000518924 1277 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
TMC1Q8TDI8 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
TMC1Q8TDI8 MPI-205ENST00000562606 1052 ntTSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
TMC1Q8TDI8 YPEL3-204ENST00000563788 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
TMC1Q8TDI8 PRR29-207ENST00000580752 458 ntTSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
TMC1Q8TDI8 AL390719.2-201ENST00000606993 987 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
TMC1Q8TDI8 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
TMC1Q8TDI8 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
TMC1Q8TDI8 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
TMC1Q8TDI8 NRXN1-208ENST00000405472 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
TMC1Q8TDI8 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
TMC1Q8TDI8 ARHGAP22-203ENST00000374172 2380 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
TMC1Q8TDI8 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
TMC1Q8TDI8 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
TMC1Q8TDI8 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
TMC1Q8TDI8 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
TMC1Q8TDI8 WIZP1-201ENST00000531444 2299 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
TMC1Q8TDI8 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
TMC1Q8TDI8 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
TMC1Q8TDI8 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
TMC1Q8TDI8 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
TMC1Q8TDI8 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
TMC1Q8TDI8 ANO7L1-203ENST00000602586 1720 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
TMC1Q8TDI8 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
TMC1Q8TDI8 S100A14-201ENST00000344616 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
TMC1Q8TDI8 CGB7-201ENST00000377280 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
TMC1Q8TDI8 PP7080-204ENST00000510714 601 ntTSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
TMC1Q8TDI8 SIDT2-217ENST00000532062 2143 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
TMC1Q8TDI8 PRELID1P1-202ENST00000567272 903 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
TMC1Q8TDI8 LIMD2-211ENST00000583211 1298 ntTSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
TMC1Q8TDI8 AC008567.3-202ENST00000619671 859 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
TMC1Q8TDI8 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
TMC1Q8TDI8 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
TMC1Q8TDI8 PLEKHB2-204ENST00000409158 2277 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
TMC1Q8TDI8 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC25.44■■□□□ 1.66
TMC1Q8TDI8 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
TMC1Q8TDI8 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
TMC1Q8TDI8 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
TMC1Q8TDI8 YDJC-201ENST00000292778 1351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
TMC1Q8TDI8 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
TMC1Q8TDI8 OSMR-202ENST00000502536 1740 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
TMC1Q8TDI8 AGER-205ENST00000375069 1538 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
TMC1Q8TDI8 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
TMC1Q8TDI8 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
TMC1Q8TDI8 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
TMC1Q8TDI8 NBPF9-209ENST00000621645 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
TMC1Q8TDI8 AC104581.1-202ENST00000635932 2618 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
TMC1Q8TDI8 DISP3-202ENST00000304391 1495 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
TMC1Q8TDI8 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
TMC1Q8TDI8 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
TMC1Q8TDI8 FMN2-201ENST00000319653 6434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
TMC1Q8TDI8 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
TMC1Q8TDI8 BAALC-202ENST00000306391 243 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
TMC1Q8TDI8 BAALC-204ENST00000330955 222 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
TMC1Q8TDI8 SNHG7-203ENST00000436596 509 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
TMC1Q8TDI8 AC009065.1-201ENST00000564055 1225 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
TMC1Q8TDI8 TEN1-204ENST00000588202 862 ntTSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
TMC1Q8TDI8 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
TMC1Q8TDI8 AC011247.3-202ENST00000605062 570 ntTSL 4 BASIC25.43■■□□□ 1.66
TMC1Q8TDI8 C10orf142-202ENST00000623589 1010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
TMC1Q8TDI8 TP53I11-223ENST00000627720 195 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
TMC1Q8TDI8 RBFA-202ENST00000306735 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
TMC1Q8TDI8 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
TMC1Q8TDI8 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
TMC1Q8TDI8 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
TMC1Q8TDI8 PAX1-205ENST00000613128 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
TMC1Q8TDI8 ENTPD8-202ENST00000371506 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
TMC1Q8TDI8 AL499627.1-201ENST00000569373 2188 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
TMC1Q8TDI8 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
TMC1Q8TDI8 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
TMC1Q8TDI8 TP53I3-202ENST00000335934 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
TMC1Q8TDI8 RGS9BP-201ENST00000334176 2894 ntAPPRIS P1 BASIC25.42■■□□□ 1.66
TMC1Q8TDI8 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
TMC1Q8TDI8 RASGRP2-208ENST00000394428 444 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
TMC1Q8TDI8 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
TMC1Q8TDI8 LINC00265-3P-201ENST00000447588 903 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
TMC1Q8TDI8 ISCU-208ENST00000539593 1071 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
TMC1Q8TDI8 TPSP2-201ENST00000561760 610 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
TMC1Q8TDI8 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
TMC1Q8TDI8 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
TMC1Q8TDI8 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
TMC1Q8TDI8 CARHSP1-219ENST00000618335 2972 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.42■■□□□ 1.66
TMC1Q8TDI8 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
TMC1Q8TDI8 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
TMC1Q8TDI8 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
TMC1Q8TDI8 LGI2-201ENST00000382114 6428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
TMC1Q8TDI8 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
TMC1Q8TDI8 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
TMC1Q8TDI8 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
TMC1Q8TDI8 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
TMC1Q8TDI8 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
TMC1Q8TDI8 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
TMC1Q8TDI8 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
TMC1Q8TDI8 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
TMC1Q8TDI8 DUSP15-203ENST00000375966 1077 ntTSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
TMC1Q8TDI8 IGHGP-201ENST00000390555 1178 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
TMC1Q8TDI8 AP001625.2-201ENST00000442605 575 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.4 ms