Protein–RNA interactions for Protein: Q8TDC3

BRSK1, Serine/threonine-protein kinase BRSK1, humanhuman

Predictions only

Length 778 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRSK1Q8TDC3 AC008687.8-201ENST00000599795 1748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
BRSK1Q8TDC3 EVX1-202ENST00000496902 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
BRSK1Q8TDC3 C8orf58-207ENST00000615223 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
BRSK1Q8TDC3 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
BRSK1Q8TDC3 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
BRSK1Q8TDC3 BCL7A-203ENST00000538010 6247 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
BRSK1Q8TDC3 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
BRSK1Q8TDC3 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
BRSK1Q8TDC3 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
BRSK1Q8TDC3 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC18.38■□□□□ 0.53
BRSK1Q8TDC3 HAGLR-204ENST00000425005 623 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
BRSK1Q8TDC3 SLC52A2-205ENST00000526752 710 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
BRSK1Q8TDC3 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
BRSK1Q8TDC3 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
BRSK1Q8TDC3 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
BRSK1Q8TDC3 AC011498.2-201ENST00000588798 540 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
BRSK1Q8TDC3 AC011558.1-201ENST00000623459 338 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
BRSK1Q8TDC3 AL157888.1-201ENST00000631930 593 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
BRSK1Q8TDC3 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
BRSK1Q8TDC3 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
BRSK1Q8TDC3 RAVER1-207ENST00000615032 1952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
BRSK1Q8TDC3 UBXN2A-201ENST00000309033 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
BRSK1Q8TDC3 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
BRSK1Q8TDC3 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
BRSK1Q8TDC3 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
BRSK1Q8TDC3 RNFT2-202ENST00000319176 2180 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
BRSK1Q8TDC3 EWSR1-207ENST00000406548 2207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
BRSK1Q8TDC3 PCDHA2-203ENST00000526136 5254 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
BRSK1Q8TDC3 LONRF1-208ENST00000533751 3043 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
BRSK1Q8TDC3 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
BRSK1Q8TDC3 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
BRSK1Q8TDC3 PRKCI-201ENST00000295797 4950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
BRSK1Q8TDC3 EMC8-201ENST00000253457 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
BRSK1Q8TDC3 HOXA13-201ENST00000222753 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
BRSK1Q8TDC3 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
BRSK1Q8TDC3 MTSS1L-204ENST00000616026 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
BRSK1Q8TDC3 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
BRSK1Q8TDC3 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
BRSK1Q8TDC3 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.37■□□□□ 0.53
BRSK1Q8TDC3 PVRIG2P-201ENST00000435460 978 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
BRSK1Q8TDC3 HOMER2P1-201ENST00000455653 964 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
BRSK1Q8TDC3 LY6E-210ENST00000521182 1079 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
BRSK1Q8TDC3 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
BRSK1Q8TDC3 AL441883.1-201ENST00000566170 1045 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
BRSK1Q8TDC3 RBM42-202ENST00000586618 771 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
BRSK1Q8TDC3 AC015961.2-201ENST00000589281 701 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
BRSK1Q8TDC3 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
BRSK1Q8TDC3 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
BRSK1Q8TDC3 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
BRSK1Q8TDC3 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
BRSK1Q8TDC3 PHGDH-209ENST00000641074 1780 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
BRSK1Q8TDC3 MBD1-208ENST00000398493 1845 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
BRSK1Q8TDC3 ZNF419-207ENST00000442920 1857 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
BRSK1Q8TDC3 FLYWCH1P1-201ENST00000460917 1874 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
BRSK1Q8TDC3 A4GALT-201ENST00000249005 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
BRSK1Q8TDC3 MYH7B-201ENST00000262873 6293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
BRSK1Q8TDC3 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
BRSK1Q8TDC3 APBB1-215ENST00000608394 2128 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
BRSK1Q8TDC3 APBB1-222ENST00000610474 2147 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
BRSK1Q8TDC3 SOST-201ENST00000301691 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
BRSK1Q8TDC3 C2CD2L-205ENST00000528586 2320 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
BRSK1Q8TDC3 KIF1BP-204ENST00000626493 2337 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
BRSK1Q8TDC3 SHKBP1-201ENST00000291842 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
BRSK1Q8TDC3 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
BRSK1Q8TDC3 STX6-201ENST00000258301 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
BRSK1Q8TDC3 MAPT-209ENST00000446361 5345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
BRSK1Q8TDC3 MED9-201ENST00000268711 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
BRSK1Q8TDC3 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
BRSK1Q8TDC3 SPPL2C-201ENST00000329196 2238 ntAPPRIS P1 BASIC18.36■□□□□ 0.53
BRSK1Q8TDC3 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC18.36■□□□□ 0.53
BRSK1Q8TDC3 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
BRSK1Q8TDC3 PJA1-202ENST00000374571 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
BRSK1Q8TDC3 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
BRSK1Q8TDC3 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
BRSK1Q8TDC3 EIPR1-201ENST00000382125 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
BRSK1Q8TDC3 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
BRSK1Q8TDC3 NOP9-202ENST00000396802 1942 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
BRSK1Q8TDC3 AC142086.1-202ENST00000398669 1839 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
BRSK1Q8TDC3 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
BRSK1Q8TDC3 MSI2-203ENST00000416426 1714 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
BRSK1Q8TDC3 KRT86-202ENST00000423955 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
BRSK1Q8TDC3 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
BRSK1Q8TDC3 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
BRSK1Q8TDC3 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
BRSK1Q8TDC3 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
BRSK1Q8TDC3 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
BRSK1Q8TDC3 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC18.36■□□□□ 0.53
BRSK1Q8TDC3 DAPK2-205ENST00000558069 1473 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
BRSK1Q8TDC3 AL049597.2-201ENST00000565575 961 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
BRSK1Q8TDC3 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
BRSK1Q8TDC3 AL024508.2-201ENST00000607749 1894 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
BRSK1Q8TDC3 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
BRSK1Q8TDC3 KCTD12-201ENST00000377474 6225 ntAPPRIS P1 BASIC18.36■□□□□ 0.53
BRSK1Q8TDC3 QSOX2-201ENST00000358701 4530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
BRSK1Q8TDC3 RIN1-205ENST00000530056 2122 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
BRSK1Q8TDC3 AC254629.1-202ENST00000618276 2112 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
BRSK1Q8TDC3 SLC39A5-201ENST00000266980 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
BRSK1Q8TDC3 LRP3-201ENST00000253193 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
BRSK1Q8TDC3 APOA5-201ENST00000227665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
BRSK1Q8TDC3 PRDM5-201ENST00000264808 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.2 ms