Protein–RNA interactions for Protein: Q8NHV4

NEDD1, Protein NEDD1, humanhuman

Predictions only

Length 660 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEDD1Q8NHV4 C1QC-203ENST00000374640 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
NEDD1Q8NHV4 AC104819.1-201ENST00000504587 486 ntBASIC21.29■■□□□ 1
NEDD1Q8NHV4 SDHD-206ENST00000528182 754 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
NEDD1Q8NHV4 PNN-202ENST00000553331 656 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
NEDD1Q8NHV4 AC092338.2-202ENST00000567158 611 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
NEDD1Q8NHV4 ANAPC11-204ENST00000571024 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
NEDD1Q8NHV4 AC007220.1-201ENST00000572466 1055 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
NEDD1Q8NHV4 AC011840.4-201ENST00000578471 627 ntBASIC21.29■■□□□ 1
NEDD1Q8NHV4 ANAPC11-218ENST00000582222 523 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
NEDD1Q8NHV4 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
NEDD1Q8NHV4 RPL32-202ENST00000396953 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
NEDD1Q8NHV4 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
NEDD1Q8NHV4 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
NEDD1Q8NHV4 C6orf136-203ENST00000376473 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
NEDD1Q8NHV4 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
NEDD1Q8NHV4 AC120498.9-201ENST00000339021 3867 ntBASIC21.29■■□□□ 1
NEDD1Q8NHV4 SALRNA1-201ENST00000555871 2086 ntTSL 4 BASIC21.28■■□□□ 1
NEDD1Q8NHV4 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
NEDD1Q8NHV4 TOP1MT-218ENST00000523676 1982 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
NEDD1Q8NHV4 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
NEDD1Q8NHV4 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
NEDD1Q8NHV4 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
NEDD1Q8NHV4 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
NEDD1Q8NHV4 DYNLL1-209ENST00000550845 1376 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
NEDD1Q8NHV4 NT5E-202ENST00000369646 974 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
NEDD1Q8NHV4 NFIB-201ENST00000380921 1274 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
NEDD1Q8NHV4 KRTAP5-6-201ENST00000382160 561 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
NEDD1Q8NHV4 AKR7L-201ENST00000420396 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
NEDD1Q8NHV4 PHGR1-201ENST00000448599 436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
NEDD1Q8NHV4 AC008610.1-201ENST00000504573 393 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
NEDD1Q8NHV4 LINC02199-203ENST00000510229 496 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
NEDD1Q8NHV4 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
NEDD1Q8NHV4 AC074051.2-201ENST00000565115 352 ntBASIC21.28■■□□□ 1
NEDD1Q8NHV4 TBCB-205ENST00000585746 875 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
NEDD1Q8NHV4 BIRC5-207ENST00000590449 568 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
NEDD1Q8NHV4 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
NEDD1Q8NHV4 PPP1R7-202ENST00000272983 1954 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
NEDD1Q8NHV4 FBLN7-205ENST00000409903 1989 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
NEDD1Q8NHV4 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
NEDD1Q8NHV4 FYTTD1-205ENST00000424384 1758 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
NEDD1Q8NHV4 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
NEDD1Q8NHV4 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
NEDD1Q8NHV4 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
NEDD1Q8NHV4 AP001476.1-201ENST00000451618 2198 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
NEDD1Q8NHV4 TMED3-201ENST00000299705 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
NEDD1Q8NHV4 MRPS34-201ENST00000177742 1040 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
NEDD1Q8NHV4 S100A3-201ENST00000368712 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
NEDD1Q8NHV4 AC105202.1-201ENST00000517833 995 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
NEDD1Q8NHV4 AC064807.1-201ENST00000518942 816 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
NEDD1Q8NHV4 VASH1-204ENST00000554743 1096 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
NEDD1Q8NHV4 AL513523.2-201ENST00000633218 660 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
NEDD1Q8NHV4 HSP90B1-211ENST00000640977 1127 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
NEDD1Q8NHV4 DOC2A-208ENST00000564944 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
NEDD1Q8NHV4 PLEKHB2-204ENST00000409158 2277 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
NEDD1Q8NHV4 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
NEDD1Q8NHV4 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
NEDD1Q8NHV4 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
NEDD1Q8NHV4 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
NEDD1Q8NHV4 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
NEDD1Q8NHV4 CYR61-201ENST00000451137 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
NEDD1Q8NHV4 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
NEDD1Q8NHV4 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
NEDD1Q8NHV4 SDC1-203ENST00000403076 1523 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
NEDD1Q8NHV4 AC087457.1-201ENST00000503496 2727 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
NEDD1Q8NHV4 GNB1L-203ENST00000405009 1076 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
NEDD1Q8NHV4 AL645608.6-201ENST00000418300 402 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
NEDD1Q8NHV4 TSPY19P-201ENST00000418461 509 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
NEDD1Q8NHV4 MRPS24-203ENST00000418740 743 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
NEDD1Q8NHV4 KRT18P65-201ENST00000439811 1286 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
NEDD1Q8NHV4 TSPY18P-201ENST00000441642 509 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
NEDD1Q8NHV4 VENTXP7-201ENST00000475503 772 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
NEDD1Q8NHV4 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
NEDD1Q8NHV4 FASTK-202ENST00000353841 1402 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
NEDD1Q8NHV4 AC105285.1-202ENST00000499322 1866 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
NEDD1Q8NHV4 HOXC11-201ENST00000243082 2039 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
NEDD1Q8NHV4 POLD4-205ENST00000529704 1486 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
NEDD1Q8NHV4 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
NEDD1Q8NHV4 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
NEDD1Q8NHV4 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
NEDD1Q8NHV4 TOR2A-205ENST00000463577 2211 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
NEDD1Q8NHV4 CSF3-206ENST00000577675 1360 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
NEDD1Q8NHV4 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
NEDD1Q8NHV4 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
NEDD1Q8NHV4 MAN1B1-207ENST00000535144 2296 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
NEDD1Q8NHV4 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
NEDD1Q8NHV4 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
NEDD1Q8NHV4 MEF2B-202ENST00000409447 1297 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
NEDD1Q8NHV4 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
NEDD1Q8NHV4 POLR2M-203ENST00000464277 910 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
NEDD1Q8NHV4 BET1L-206ENST00000486280 665 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
NEDD1Q8NHV4 CDV3-207ENST00000508481 661 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
NEDD1Q8NHV4 REPIN1-217ENST00000518514 478 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
NEDD1Q8NHV4 ABR-204ENST00000543210 1049 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
NEDD1Q8NHV4 RNPS1-224ENST00000569598 918 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
NEDD1Q8NHV4 ABR-217ENST00000572441 563 ntTSL 4 BASIC21.25■□□□□ 0.99
NEDD1Q8NHV4 SRSF1-209ENST00000585096 568 ntTSL 4 BASIC21.25■□□□□ 0.99
NEDD1Q8NHV4 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
NEDD1Q8NHV4 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
NEDD1Q8NHV4 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
NEDD1Q8NHV4 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.7 ms