Protein–RNA interactions for Protein: Q8NCQ3

LINC00301, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00301, humanhuman

Predictions only

Length 95 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00301Q8NCQ3 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC20.84■□□□□ 0.93
LINC00301Q8NCQ3 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
LINC00301Q8NCQ3 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
LINC00301Q8NCQ3 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
LINC00301Q8NCQ3 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
LINC00301Q8NCQ3 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
LINC00301Q8NCQ3 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
LINC00301Q8NCQ3 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
LINC00301Q8NCQ3 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
LINC00301Q8NCQ3 ZNF706-206ENST00000519744 785 ntTSL 3 BASIC20.84■□□□□ 0.93
LINC00301Q8NCQ3 EGLN1P1-201ENST00000531623 762 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
LINC00301Q8NCQ3 C14orf144-201ENST00000553757 537 ntTSL 4 BASIC20.84■□□□□ 0.93
LINC00301Q8NCQ3 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
LINC00301Q8NCQ3 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
LINC00301Q8NCQ3 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
LINC00301Q8NCQ3 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
LINC00301Q8NCQ3 ANKRD6-201ENST00000339746 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
LINC00301Q8NCQ3 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
LINC00301Q8NCQ3 CCDC137-201ENST00000329214 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
LINC00301Q8NCQ3 RABEP2-202ENST00000358201 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
LINC00301Q8NCQ3 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
LINC00301Q8NCQ3 CCDC120-204ENST00000597275 2752 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
LINC00301Q8NCQ3 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
LINC00301Q8NCQ3 ACVRL1-202ENST00000419526 1356 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
LINC00301Q8NCQ3 ZNF200-202ENST00000396870 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
LINC00301Q8NCQ3 TP73-AS1-203ENST00000423764 2875 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
LINC00301Q8NCQ3 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
LINC00301Q8NCQ3 TBKBP1-204ENST00000622396 2010 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
LINC00301Q8NCQ3 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
LINC00301Q8NCQ3 PIF1-201ENST00000268043 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
LINC00301Q8NCQ3 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
LINC00301Q8NCQ3 EIF3C-211ENST00000566866 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
LINC00301Q8NCQ3 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
LINC00301Q8NCQ3 ARPIN-202ENST00000460685 2145 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
LINC00301Q8NCQ3 PTPN12-201ENST00000248594 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
LINC00301Q8NCQ3 SLCO6A1-201ENST00000379807 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
LINC00301Q8NCQ3 WDR59-202ENST00000536050 1752 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
LINC00301Q8NCQ3 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
LINC00301Q8NCQ3 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
LINC00301Q8NCQ3 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.83■□□□□ 0.93
LINC00301Q8NCQ3 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
LINC00301Q8NCQ3 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
LINC00301Q8NCQ3 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC20.83■□□□□ 0.93
LINC00301Q8NCQ3 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC20.83■□□□□ 0.93
LINC00301Q8NCQ3 GOLGA2P7-201ENST00000316967 2525 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.92
LINC00301Q8NCQ3 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.92
LINC00301Q8NCQ3 C16orf59-204ENST00000563531 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.92
LINC00301Q8NCQ3 ACSS2-201ENST00000253382 2925 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.92
LINC00301Q8NCQ3 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.92
LINC00301Q8NCQ3 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.92
LINC00301Q8NCQ3 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.92
LINC00301Q8NCQ3 SLC27A5-207ENST00000601355 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.92
LINC00301Q8NCQ3 NFATC1-206ENST00000542384 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
LINC00301Q8NCQ3 CBX2-202ENST00000310942 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
LINC00301Q8NCQ3 STAMBPL1-203ENST00000371926 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
LINC00301Q8NCQ3 FXYD6-204ENST00000526014 2171 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
LINC00301Q8NCQ3 NEU1-206ENST00000375631 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
LINC00301Q8NCQ3 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
LINC00301Q8NCQ3 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
LINC00301Q8NCQ3 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
LINC00301Q8NCQ3 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
LINC00301Q8NCQ3 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
LINC00301Q8NCQ3 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
LINC00301Q8NCQ3 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
LINC00301Q8NCQ3 HDAC10-202ENST00000349505 1950 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
LINC00301Q8NCQ3 NFATC1-201ENST00000253506 4642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
LINC00301Q8NCQ3 TMEM198-201ENST00000344458 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
LINC00301Q8NCQ3 MARVELD3-202ENST00000299952 2214 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
LINC00301Q8NCQ3 TCF7-204ENST00000395029 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
LINC00301Q8NCQ3 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
LINC00301Q8NCQ3 ALAS2-203ENST00000396198 1936 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
LINC00301Q8NCQ3 ITGB5-201ENST00000296181 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
LINC00301Q8NCQ3 MRPL10-203ENST00000414011 1622 ntTSL 3 BASIC20.82■□□□□ 0.92
LINC00301Q8NCQ3 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
LINC00301Q8NCQ3 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
LINC00301Q8NCQ3 HDAC10-201ENST00000216271 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
LINC00301Q8NCQ3 THAP12-201ENST00000260045 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
LINC00301Q8NCQ3 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
LINC00301Q8NCQ3 PLD3-206ENST00000409587 2180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
LINC00301Q8NCQ3 AL355987.1-201ENST00000435202 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
LINC00301Q8NCQ3 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
LINC00301Q8NCQ3 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC20.81■□□□□ 0.92
LINC00301Q8NCQ3 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
LINC00301Q8NCQ3 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
LINC00301Q8NCQ3 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC20.81■□□□□ 0.92
LINC00301Q8NCQ3 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
LINC00301Q8NCQ3 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
LINC00301Q8NCQ3 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
LINC00301Q8NCQ3 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
LINC00301Q8NCQ3 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
LINC00301Q8NCQ3 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
LINC00301Q8NCQ3 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
LINC00301Q8NCQ3 CAPN1-201ENST00000279247 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
LINC00301Q8NCQ3 ISG20-201ENST00000306072 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
LINC00301Q8NCQ3 SULT1A1-204ENST00000395609 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
LINC00301Q8NCQ3 MTHFD2L-203ENST00000395759 2354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
LINC00301Q8NCQ3 KCNC4-204ENST00000438661 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
LINC00301Q8NCQ3 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
LINC00301Q8NCQ3 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
LINC00301Q8NCQ3 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.5 ms