Protein–RNA interactions for Protein: Q8NCD3

HJURP, Holliday junction recognition protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 748 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HJURPQ8NCD3 AC113382.1-201ENST00000500267 1253 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
HJURPQ8NCD3 CIB2-208ENST00000560618 804 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
HJURPQ8NCD3 TPSP2-201ENST00000561760 610 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
HJURPQ8NCD3 ZNF549-203ENST00000594943 556 ntTSL 4 BASIC18.71■□□□□ 0.59
HJURPQ8NCD3 KISS1R-203ENST00000606939 964 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
HJURPQ8NCD3 AL117335.1-203ENST00000619200 948 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
HJURPQ8NCD3 BEAN1-211ENST00000622872 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
HJURPQ8NCD3 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
HJURPQ8NCD3 PSTK-201ENST00000368887 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
HJURPQ8NCD3 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
HJURPQ8NCD3 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
HJURPQ8NCD3 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
HJURPQ8NCD3 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
HJURPQ8NCD3 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
HJURPQ8NCD3 COQ9-210ENST00000567072 1482 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
HJURPQ8NCD3 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
HJURPQ8NCD3 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
HJURPQ8NCD3 OBSL1-203ENST00000373876 5503 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
HJURPQ8NCD3 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
HJURPQ8NCD3 UBE2I-207ENST00000406620 1842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
HJURPQ8NCD3 AC027097.1-202ENST00000592201 1954 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
HJURPQ8NCD3 AC138028.1-201ENST00000333666 2137 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
HJURPQ8NCD3 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
HJURPQ8NCD3 ISCU-201ENST00000311893 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
HJURPQ8NCD3 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
HJURPQ8NCD3 IPPK-202ENST00000375522 882 ntTSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
HJURPQ8NCD3 LENG8-AS1-201ENST00000416022 582 ntTSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
HJURPQ8NCD3 DECR2-202ENST00000424398 1012 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
HJURPQ8NCD3 AC093585.1-201ENST00000425183 428 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
HJURPQ8NCD3 NDUFB9-202ENST00000517367 636 ntTSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
HJURPQ8NCD3 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
HJURPQ8NCD3 PRSS23-209ENST00000533902 2043 ntTSL 4 BASIC18.7■□□□□ 0.58
HJURPQ8NCD3 NFATC4-228ENST00000556759 2025 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
HJURPQ8NCD3 YPEL3-204ENST00000563788 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
HJURPQ8NCD3 CLEC4GP1-201ENST00000596555 870 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
HJURPQ8NCD3 GNAS-AS1-203ENST00000598163 548 ntTSL 4 BASIC18.7■□□□□ 0.58
HJURPQ8NCD3 DHRS4L2-211ENST00000621761 1049 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
HJURPQ8NCD3 RBL2-201ENST00000262133 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
HJURPQ8NCD3 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
HJURPQ8NCD3 EHMT1-204ENST00000462484 2707 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
HJURPQ8NCD3 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
HJURPQ8NCD3 C6orf223-202ENST00000439969 2757 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
HJURPQ8NCD3 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC18.69■□□□□ 0.58
HJURPQ8NCD3 DYNLL1-209ENST00000550845 1376 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
HJURPQ8NCD3 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
HJURPQ8NCD3 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
HJURPQ8NCD3 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
HJURPQ8NCD3 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
HJURPQ8NCD3 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
HJURPQ8NCD3 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
HJURPQ8NCD3 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
HJURPQ8NCD3 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
HJURPQ8NCD3 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
HJURPQ8NCD3 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
HJURPQ8NCD3 PPIH-202ENST00000372549 327 ntTSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
HJURPQ8NCD3 CGB7-201ENST00000377280 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
HJURPQ8NCD3 ENO1-AS1-201ENST00000442636 456 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
HJURPQ8NCD3 AGBL5-AS1-201ENST00000444217 407 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
HJURPQ8NCD3 LINC00265-3P-201ENST00000447588 903 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
HJURPQ8NCD3 CHCHD3-203ENST00000448878 1038 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
HJURPQ8NCD3 PDCD6-207ENST00000509581 1156 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
HJURPQ8NCD3 MIR3652-201ENST00000579335 131 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
HJURPQ8NCD3 TMIGD2-202ENST00000595645 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
HJURPQ8NCD3 ANKRD20A8P-203ENST00000641373 517 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
HJURPQ8NCD3 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
HJURPQ8NCD3 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
HJURPQ8NCD3 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
HJURPQ8NCD3 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
HJURPQ8NCD3 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
HJURPQ8NCD3 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
HJURPQ8NCD3 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
HJURPQ8NCD3 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
HJURPQ8NCD3 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
HJURPQ8NCD3 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
HJURPQ8NCD3 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
HJURPQ8NCD3 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
HJURPQ8NCD3 SERPINE2-206ENST00000447280 1716 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
HJURPQ8NCD3 IFRD2-204ENST00000436390 2275 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
HJURPQ8NCD3 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
HJURPQ8NCD3 INO80E-207ENST00000563197 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
HJURPQ8NCD3 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
HJURPQ8NCD3 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC18.68■□□□□ 0.58
HJURPQ8NCD3 AMDHD2-203ENST00000413459 2049 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
HJURPQ8NCD3 UFD1-202ENST00000399523 1007 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
HJURPQ8NCD3 KIRREL3-AS3-201ENST00000404882 831 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
HJURPQ8NCD3 TSPY12P-201ENST00000421279 868 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
HJURPQ8NCD3 AC069368.1-202ENST00000437723 750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
HJURPQ8NCD3 TOB2P1-201ENST00000469761 992 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
HJURPQ8NCD3 RN7SL606P-201ENST00000472779 293 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
HJURPQ8NCD3 SELENOH-204ENST00000534355 818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
HJURPQ8NCD3 ZNF524-203ENST00000591046 1260 ntAPPRIS P1 BASIC18.68■□□□□ 0.58
HJURPQ8NCD3 AC124864.1-201ENST00000623408 392 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
HJURPQ8NCD3 C6orf141-206ENST00000529246 1450 ntAPPRIS P1 BASIC18.68■□□□□ 0.58
HJURPQ8NCD3 GSEC-201ENST00000626810 2289 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
HJURPQ8NCD3 UBXN2A-201ENST00000309033 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
HJURPQ8NCD3 RNF167-205ENST00000571816 1728 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
HJURPQ8NCD3 SRSF1-208ENST00000584773 1317 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
HJURPQ8NCD3 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
HJURPQ8NCD3 DAG1-221ENST00000541308 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
HJURPQ8NCD3 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.6 ms