Protein–RNA interactions for Protein: Q8N6U2

LINC00612, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00612, humanhuman

Predictions only

Length 182 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00612Q8N6U2 FBXL20-205ENST00000583610 1739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
LINC00612Q8N6U2 MMD2-202ENST00000404774 2415 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
LINC00612Q8N6U2 MED25-212ENST00000618715 1467 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
LINC00612Q8N6U2 FDXR-205ENST00000544854 1827 ntTSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
LINC00612Q8N6U2 AL390961.4-201ENST00000623958 2535 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
LINC00612Q8N6U2 AC132938.6-201ENST00000623828 1655 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
LINC00612Q8N6U2 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
LINC00612Q8N6U2 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
LINC00612Q8N6U2 CCDC7-203ENST00000362006 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
LINC00612Q8N6U2 LPAR2-201ENST00000407877 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
LINC00612Q8N6U2 MON1B-202ENST00000439557 1759 ntTSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
LINC00612Q8N6U2 CD248-201ENST00000311330 2558 ntAPPRIS P1 BASIC12.89□□□□□ -0.35
LINC00612Q8N6U2 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
LINC00612Q8N6U2 SOST-201ENST00000301691 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
LINC00612Q8N6U2 SHISA3-201ENST00000319234 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
LINC00612Q8N6U2 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
LINC00612Q8N6U2 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC12.89□□□□□ -0.35
LINC00612Q8N6U2 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
LINC00612Q8N6U2 DCST1-204ENST00000423025 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
LINC00612Q8N6U2 WWOX-203ENST00000406884 1701 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
LINC00612Q8N6U2 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
LINC00612Q8N6U2 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
LINC00612Q8N6U2 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
LINC00612Q8N6U2 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
LINC00612Q8N6U2 AC004540.1-201ENST00000439120 891 ntTSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
LINC00612Q8N6U2 AC092159.3-201ENST00000439196 571 ntTSL 4 BASIC12.89□□□□□ -0.35
LINC00612Q8N6U2 FNDC5-205ENST00000496770 837 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
LINC00612Q8N6U2 AC116353.4-201ENST00000507279 576 ntTSL 4 BASIC12.89□□□□□ -0.35
LINC00612Q8N6U2 AP000777.3-201ENST00000538705 491 ntTSL 3 BASIC12.89□□□□□ -0.35
LINC00612Q8N6U2 AC092118.1-202ENST00000568697 718 ntTSL 3 BASIC12.89□□□□□ -0.35
LINC00612Q8N6U2 NAA38-203ENST00000575071 553 ntTSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
LINC00612Q8N6U2 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
LINC00612Q8N6U2 GPR32P1-201ENST00000601788 811 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
LINC00612Q8N6U2 C1QTNF8-202ENST00000621771 897 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
LINC00612Q8N6U2 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
LINC00612Q8N6U2 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
LINC00612Q8N6U2 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
LINC00612Q8N6U2 CCDC74B-202ENST00000392984 1353 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
LINC00612Q8N6U2 WIPF1-206ENST00000409891 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
LINC00612Q8N6U2 SLC23A3-207ENST00000455516 2048 ntTSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
LINC00612Q8N6U2 MAP2K5-202ENST00000340972 1491 ntTSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
LINC00612Q8N6U2 KCNQ2-205ENST00000360480 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
LINC00612Q8N6U2 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
LINC00612Q8N6U2 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC12.89□□□□□ -0.35
LINC00612Q8N6U2 TPRA1-204ENST00000450633 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
LINC00612Q8N6U2 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
LINC00612Q8N6U2 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
LINC00612Q8N6U2 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
LINC00612Q8N6U2 CYP4F2-201ENST00000011989 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
LINC00612Q8N6U2 FASTK-202ENST00000353841 1402 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
LINC00612Q8N6U2 RRP7BP-201ENST00000357802 2375 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
LINC00612Q8N6U2 ECE1-203ENST00000374893 2484 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
LINC00612Q8N6U2 NPNT-203ENST00000427316 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
LINC00612Q8N6U2 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
LINC00612Q8N6U2 MYO19-225ENST00000621344 1640 ntTSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
LINC00612Q8N6U2 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
LINC00612Q8N6U2 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
LINC00612Q8N6U2 MFSD2A-203ENST00000420632 1914 ntTSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
LINC00612Q8N6U2 SP100-208ENST00000427101 1922 ntTSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
LINC00612Q8N6U2 NPEPL1-204ENST00000525967 1917 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
LINC00612Q8N6U2 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
LINC00612Q8N6U2 DNM1-211ENST00000627061 2724 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
LINC00612Q8N6U2 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
LINC00612Q8N6U2 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
LINC00612Q8N6U2 BAALC-202ENST00000306391 243 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
LINC00612Q8N6U2 BAALC-204ENST00000330955 222 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
LINC00612Q8N6U2 TBPL1-203ENST00000367871 808 ntTSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
LINC00612Q8N6U2 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
LINC00612Q8N6U2 KRT18P65-201ENST00000439811 1286 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
LINC00612Q8N6U2 AP001625.2-201ENST00000442605 575 ntTSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
LINC00612Q8N6U2 DMKN-212ENST00000443640 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
LINC00612Q8N6U2 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
LINC00612Q8N6U2 LINC02106-201ENST00000506534 606 ntTSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
LINC00612Q8N6U2 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
LINC00612Q8N6U2 AC079031.1-201ENST00000542627 1035 ntTSL 3 BASIC12.88□□□□□ -0.35
LINC00612Q8N6U2 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC12.88□□□□□ -0.35
LINC00612Q8N6U2 VASH1-204ENST00000554743 1096 ntTSL 3 BASIC12.88□□□□□ -0.35
LINC00612Q8N6U2 CLDN7-204ENST00000571881 735 ntTSL 3 BASIC12.88□□□□□ -0.35
LINC00612Q8N6U2 AL390719.2-201ENST00000606993 987 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
LINC00612Q8N6U2 SYNE4-201ENST00000324444 1354 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
LINC00612Q8N6U2 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
LINC00612Q8N6U2 GPAT2P1-202ENST00000471661 1569 ntTSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
LINC00612Q8N6U2 TMSB4Y-201ENST00000284856 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
LINC00612Q8N6U2 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
LINC00612Q8N6U2 ARSE-201ENST00000381134 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
LINC00612Q8N6U2 PNMA6E-201ENST00000445091 2192 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
LINC00612Q8N6U2 STRA6-209ENST00000563965 2565 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
LINC00612Q8N6U2 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
LINC00612Q8N6U2 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
LINC00612Q8N6U2 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
LINC00612Q8N6U2 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
LINC00612Q8N6U2 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
LINC00612Q8N6U2 ACTN4-202ENST00000390009 2102 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
LINC00612Q8N6U2 TCP11-228ENST00000611141 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
LINC00612Q8N6U2 RGN-204ENST00000457380 2041 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
LINC00612Q8N6U2 C12orf65-202ENST00000366329 1901 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
LINC00612Q8N6U2 AC138028.4-201ENST00000564984 1845 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
LINC00612Q8N6U2 ARHGEF2-204ENST00000368315 1645 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
LINC00612Q8N6U2 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC12.88□□□□□ -0.35
LINC00612Q8N6U2 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.6 ms