Protein–RNA interactions for Protein: Q8IXQ3

C9orf40, Uncharacterized protein C9orf40, humanhuman

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Length 194 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf40Q8IXQ3 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
C9orf40Q8IXQ3 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
C9orf40Q8IXQ3 PDLIM7-205ENST00000393551 1226 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
C9orf40Q8IXQ3 ZNF337-AS1-204ENST00000428254 817 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
C9orf40Q8IXQ3 AC022424.1-201ENST00000512155 889 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
C9orf40Q8IXQ3 ISCU-208ENST00000539593 1071 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
C9orf40Q8IXQ3 PAQR4-204ENST00000574988 869 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
C9orf40Q8IXQ3 AC016582.2-201ENST00000591908 446 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
C9orf40Q8IXQ3 AC008687.5-201ENST00000593746 558 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
C9orf40Q8IXQ3 AL390719.2-201ENST00000606993 987 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
C9orf40Q8IXQ3 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
C9orf40Q8IXQ3 UBE2I-207ENST00000406620 1842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
C9orf40Q8IXQ3 PIP4K2C-202ENST00000422156 1558 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
C9orf40Q8IXQ3 RPRD1A-201ENST00000357384 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
C9orf40Q8IXQ3 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
C9orf40Q8IXQ3 BANP-202ENST00000355022 2164 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
C9orf40Q8IXQ3 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
C9orf40Q8IXQ3 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
C9orf40Q8IXQ3 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
C9orf40Q8IXQ3 AC087500.1-202ENST00000571689 1715 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
C9orf40Q8IXQ3 CLK1-205ENST00000434813 2026 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
C9orf40Q8IXQ3 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
C9orf40Q8IXQ3 LONP1-215ENST00000593119 2918 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
C9orf40Q8IXQ3 MAFF-207ENST00000538999 2365 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
C9orf40Q8IXQ3 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
C9orf40Q8IXQ3 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
C9orf40Q8IXQ3 PSMD11-202ENST00000457654 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
C9orf40Q8IXQ3 HSD17B10-201ENST00000168216 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
C9orf40Q8IXQ3 GUCA1B-201ENST00000230361 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
C9orf40Q8IXQ3 HAAO-201ENST00000294973 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
C9orf40Q8IXQ3 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
C9orf40Q8IXQ3 NT5C2-211ENST00000470299 249 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
C9orf40Q8IXQ3 PPOX-214ENST00000535223 664 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
C9orf40Q8IXQ3 AC079031.1-201ENST00000542627 1035 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
C9orf40Q8IXQ3 AC009084.1-201ENST00000566869 317 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
C9orf40Q8IXQ3 AC004771.4-201ENST00000576752 474 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
C9orf40Q8IXQ3 AC132938.3-201ENST00000579095 357 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
C9orf40Q8IXQ3 GPR32P1-201ENST00000601788 811 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
C9orf40Q8IXQ3 AC124016.1-202ENST00000609575 619 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
C9orf40Q8IXQ3 AL807752.6-202ENST00000622933 765 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
C9orf40Q8IXQ3 CALM2-209ENST00000628793 1103 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
C9orf40Q8IXQ3 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
C9orf40Q8IXQ3 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
C9orf40Q8IXQ3 UBC-206ENST00000538617 1303 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
C9orf40Q8IXQ3 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
C9orf40Q8IXQ3 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
C9orf40Q8IXQ3 PRODH-205ENST00000420436 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
C9orf40Q8IXQ3 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
C9orf40Q8IXQ3 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
C9orf40Q8IXQ3 AC007192.1-201ENST00000593731 5142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
C9orf40Q8IXQ3 CCDC74B-202ENST00000392984 1353 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
C9orf40Q8IXQ3 AKR1A1-214ENST00000621846 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
C9orf40Q8IXQ3 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
C9orf40Q8IXQ3 ZCWPW1-201ENST00000360951 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
C9orf40Q8IXQ3 APBB1-215ENST00000608394 2128 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
C9orf40Q8IXQ3 APBB1-222ENST00000610474 2147 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
C9orf40Q8IXQ3 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
C9orf40Q8IXQ3 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
C9orf40Q8IXQ3 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
C9orf40Q8IXQ3 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
C9orf40Q8IXQ3 KCNN4-209ENST00000615047 2029 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
C9orf40Q8IXQ3 ZNF414-201ENST00000255616 1178 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
C9orf40Q8IXQ3 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
C9orf40Q8IXQ3 BAALC-202ENST00000306391 243 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
C9orf40Q8IXQ3 BAALC-204ENST00000330955 222 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
C9orf40Q8IXQ3 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
C9orf40Q8IXQ3 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
C9orf40Q8IXQ3 ISG15-201ENST00000379389 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
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C9orf40Q8IXQ3 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC16.86■□□□□ 0.29
C9orf40Q8IXQ3 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
C9orf40Q8IXQ3 MALAT1-215ENST00000619449 794 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
C9orf40Q8IXQ3 FMR1-206ENST00000370477 3437 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
C9orf40Q8IXQ3 TADA3-202ENST00000343450 2554 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
C9orf40Q8IXQ3 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
C9orf40Q8IXQ3 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
C9orf40Q8IXQ3 PHGDH-209ENST00000641074 1780 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
C9orf40Q8IXQ3 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
C9orf40Q8IXQ3 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
C9orf40Q8IXQ3 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
C9orf40Q8IXQ3 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
C9orf40Q8IXQ3 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
C9orf40Q8IXQ3 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
C9orf40Q8IXQ3 PLD3-205ENST00000409419 1966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
C9orf40Q8IXQ3 GORASP1-206ENST00000422110 2523 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
C9orf40Q8IXQ3 DPYSL4-202ENST00000368627 1545 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
C9orf40Q8IXQ3 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
C9orf40Q8IXQ3 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
C9orf40Q8IXQ3 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
C9orf40Q8IXQ3 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
C9orf40Q8IXQ3 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
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