Protein–RNA interactions for Protein: Q86Y37

CACUL1, CDK2-associated and cullin domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 369 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACUL1Q86Y37 ZBTB4-201ENST00000311403 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CACUL1Q86Y37 BAG5-201ENST00000299204 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CACUL1Q86Y37 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CACUL1Q86Y37 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CACUL1Q86Y37 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CACUL1Q86Y37 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CACUL1Q86Y37 WDR88-202ENST00000361680 1835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CACUL1Q86Y37 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CACUL1Q86Y37 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CACUL1Q86Y37 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CACUL1Q86Y37 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CACUL1Q86Y37 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CACUL1Q86Y37 PTPDC1-202ENST00000375360 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CACUL1Q86Y37 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CACUL1Q86Y37 ADGRA3-202ENST00000334304 4566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CACUL1Q86Y37 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CACUL1Q86Y37 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CACUL1Q86Y37 MRPS15-201ENST00000373116 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CACUL1Q86Y37 AL611929.1-201ENST00000457340 449 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CACUL1Q86Y37 LINC01711-201ENST00000598340 967 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
CACUL1Q86Y37 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CACUL1Q86Y37 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CACUL1Q86Y37 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CACUL1Q86Y37 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CACUL1Q86Y37 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CACUL1Q86Y37 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CACUL1Q86Y37 AVPR1A-201ENST00000299178 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CACUL1Q86Y37 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CACUL1Q86Y37 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CACUL1Q86Y37 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CACUL1Q86Y37 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CACUL1Q86Y37 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CACUL1Q86Y37 SORCS3-202ENST00000369701 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CACUL1Q86Y37 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CACUL1Q86Y37 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CACUL1Q86Y37 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CACUL1Q86Y37 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CACUL1Q86Y37 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CACUL1Q86Y37 SLC9A6-201ENST00000370695 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CACUL1Q86Y37 SUSD4-203ENST00000344029 1056 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CACUL1Q86Y37 FAAHP1-202ENST00000446499 1238 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
CACUL1Q86Y37 MRPL52-210ENST00000555345 895 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CACUL1Q86Y37 AC099518.3-201ENST00000564808 809 ntAPPRIS P5 TSL 4 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CACUL1Q86Y37 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CACUL1Q86Y37 AL449423.1-201ENST00000578935 435 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CACUL1Q86Y37 ABHD17A-204ENST00000590661 1079 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CACUL1Q86Y37 C6orf48-210ENST00000614363 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CACUL1Q86Y37 MALAT1-215ENST00000619449 794 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CACUL1Q86Y37 MAGI3-201ENST00000307546 6430 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CACUL1Q86Y37 PDLIM2-206ENST00000409141 1463 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CACUL1Q86Y37 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CACUL1Q86Y37 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CACUL1Q86Y37 NSUN5P1-202ENST00000421140 1535 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
CACUL1Q86Y37 NSUN5P2-203ENST00000457352 1529 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
CACUL1Q86Y37 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CACUL1Q86Y37 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
CACUL1Q86Y37 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CACUL1Q86Y37 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CACUL1Q86Y37 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CACUL1Q86Y37 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CACUL1Q86Y37 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CACUL1Q86Y37 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CACUL1Q86Y37 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CACUL1Q86Y37 PRKCI-201ENST00000295797 4950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CACUL1Q86Y37 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CACUL1Q86Y37 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CACUL1Q86Y37 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CACUL1Q86Y37 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CACUL1Q86Y37 CD81-AS1-201ENST00000413483 1460 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CACUL1Q86Y37 LGALS1-201ENST00000215909 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CACUL1Q86Y37 C6orf15-201ENST00000259870 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CACUL1Q86Y37 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CACUL1Q86Y37 PHPT1-202ENST00000371661 985 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CACUL1Q86Y37 HYI-201ENST00000372425 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CACUL1Q86Y37 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
CACUL1Q86Y37 CST3-202ENST00000398409 832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CACUL1Q86Y37 MINOS1P3-201ENST00000457048 203 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
CACUL1Q86Y37 VENTXP7-201ENST00000475503 772 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
CACUL1Q86Y37 TRPC2-202ENST00000526541 1189 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CACUL1Q86Y37 ABR-204ENST00000543210 1049 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CACUL1Q86Y37 ABR-217ENST00000572441 563 ntTSL 4 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CACUL1Q86Y37 AC011511.2-201ENST00000592893 918 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CACUL1Q86Y37 FLT3LG-206ENST00000597551 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CACUL1Q86Y37 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CACUL1Q86Y37 FARSA-202ENST00000423140 1720 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CACUL1Q86Y37 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CACUL1Q86Y37 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CACUL1Q86Y37 BUB3-201ENST00000368858 1361 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CACUL1Q86Y37 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CACUL1Q86Y37 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CACUL1Q86Y37 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CACUL1Q86Y37 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CACUL1Q86Y37 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CACUL1Q86Y37 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CACUL1Q86Y37 AC009102.3-201ENST00000623118 1491 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
CACUL1Q86Y37 EFR3A-201ENST00000254624 5438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CACUL1Q86Y37 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CACUL1Q86Y37 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CACUL1Q86Y37 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CACUL1Q86Y37 TMEM150B-201ENST00000326652 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.3 ms