Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z3V4

UBE3B, Ubiquitin-protein ligase E3B, humanhuman

Predictions only

Length 1,068 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE3BQ7Z3V4 SLC2A1-204ENST00000460369 541 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
UBE3BQ7Z3V4 BET1L-206ENST00000486280 665 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
UBE3BQ7Z3V4 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
UBE3BQ7Z3V4 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
UBE3BQ7Z3V4 LRRC27-201ENST00000344079 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
UBE3BQ7Z3V4 NSUN5P1-202ENST00000421140 1535 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
UBE3BQ7Z3V4 NSUN5P2-203ENST00000457352 1529 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
UBE3BQ7Z3V4 PSTK-201ENST00000368887 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
UBE3BQ7Z3V4 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
UBE3BQ7Z3V4 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
UBE3BQ7Z3V4 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
UBE3BQ7Z3V4 ALDH5A1-201ENST00000348925 2266 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
UBE3BQ7Z3V4 SIGLEC10-204ENST00000436984 1776 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
UBE3BQ7Z3V4 DEF8-211ENST00000563795 1767 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
UBE3BQ7Z3V4 TMEM234-202ENST00000344461 721 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
UBE3BQ7Z3V4 EMC9-202ENST00000419198 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
UBE3BQ7Z3V4 TSPY12P-201ENST00000421279 868 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
UBE3BQ7Z3V4 SBDSP1-202ENST00000423945 618 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
UBE3BQ7Z3V4 XYLT2-203ENST00000507602 2107 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
UBE3BQ7Z3V4 PDCD6-207ENST00000509581 1156 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
UBE3BQ7Z3V4 ABR-204ENST00000543210 1049 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
UBE3BQ7Z3V4 ABR-217ENST00000572441 563 ntTSL 4 BASIC22.77■■□□□ 1.24
UBE3BQ7Z3V4 AC011840.4-201ENST00000578471 627 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
UBE3BQ7Z3V4 SNHG15-203ENST00000578968 982 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
UBE3BQ7Z3V4 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
UBE3BQ7Z3V4 AC022150.1-201ENST00000599222 640 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
UBE3BQ7Z3V4 BCL2L12-210ENST00000611631 1259 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
UBE3BQ7Z3V4 HSP90B1-211ENST00000640977 1127 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
UBE3BQ7Z3V4 IFIH1-202ENST00000421365 1617 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
UBE3BQ7Z3V4 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
UBE3BQ7Z3V4 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
UBE3BQ7Z3V4 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
UBE3BQ7Z3V4 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
UBE3BQ7Z3V4 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
UBE3BQ7Z3V4 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
UBE3BQ7Z3V4 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
UBE3BQ7Z3V4 CIAO1-203ENST00000488633 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
UBE3BQ7Z3V4 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
UBE3BQ7Z3V4 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
UBE3BQ7Z3V4 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
UBE3BQ7Z3V4 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
UBE3BQ7Z3V4 TOP1MT-218ENST00000523676 1982 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
UBE3BQ7Z3V4 IRF3-202ENST00000377135 1442 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
UBE3BQ7Z3V4 MRPS34-201ENST00000177742 1040 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
UBE3BQ7Z3V4 AC131097.3-201ENST00000413820 1228 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
UBE3BQ7Z3V4 AC004975.2-201ENST00000442017 565 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
UBE3BQ7Z3V4 VENTXP7-201ENST00000475503 772 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
UBE3BQ7Z3V4 KRT18P31-201ENST00000506277 1292 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
UBE3BQ7Z3V4 AL353801.3-201ENST00000609898 542 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
UBE3BQ7Z3V4 AL121772.3-201ENST00000610840 674 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
UBE3BQ7Z3V4 C6orf141-206ENST00000529246 1450 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
UBE3BQ7Z3V4 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
UBE3BQ7Z3V4 RMND5B-201ENST00000313386 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
UBE3BQ7Z3V4 TSR2-201ENST00000375151 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
UBE3BQ7Z3V4 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
UBE3BQ7Z3V4 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
UBE3BQ7Z3V4 RABL2B-205ENST00000395595 2428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
UBE3BQ7Z3V4 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
UBE3BQ7Z3V4 DCTN3-201ENST00000259632 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
UBE3BQ7Z3V4 MRPL43-203ENST00000318364 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
UBE3BQ7Z3V4 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
UBE3BQ7Z3V4 MRPL43-204ENST00000342071 894 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
UBE3BQ7Z3V4 AC026396.1-201ENST00000419388 421 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
UBE3BQ7Z3V4 AC246785.2-201ENST00000432512 513 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
UBE3BQ7Z3V4 AC091304.2-201ENST00000564639 760 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
UBE3BQ7Z3V4 AC008738.3-201ENST00000589932 659 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
UBE3BQ7Z3V4 SSBP1-215ENST00000612337 884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
UBE3BQ7Z3V4 AL162497.1-201ENST00000615635 518 ntTSL 4 BASIC22.75■■□□□ 1.23
UBE3BQ7Z3V4 NDUFA6-204ENST00000617763 1183 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
UBE3BQ7Z3V4 MAZ-212ENST00000568282 1593 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
UBE3BQ7Z3V4 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
UBE3BQ7Z3V4 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
UBE3BQ7Z3V4 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
UBE3BQ7Z3V4 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
UBE3BQ7Z3V4 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
UBE3BQ7Z3V4 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
UBE3BQ7Z3V4 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
UBE3BQ7Z3V4 PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 2537 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
UBE3BQ7Z3V4 NFATC4-228ENST00000556759 2025 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
UBE3BQ7Z3V4 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
UBE3BQ7Z3V4 NPFFR2-202ENST00000344413 1234 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
UBE3BQ7Z3V4 BEX4-201ENST00000372691 1066 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
UBE3BQ7Z3V4 DYNLL1-203ENST00000392509 814 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
UBE3BQ7Z3V4 BIRC7-203ENST00000395306 593 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
UBE3BQ7Z3V4 LINC02247-201ENST00000417135 743 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
UBE3BQ7Z3V4 AC093459.1-201ENST00000444567 481 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
UBE3BQ7Z3V4 MIR3936HG-202ENST00000457998 733 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
UBE3BQ7Z3V4 POLR2M-203ENST00000464277 910 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
UBE3BQ7Z3V4 CDV3-207ENST00000508481 661 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
UBE3BQ7Z3V4 HDDC3-205ENST00000559898 1024 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
UBE3BQ7Z3V4 ANKRD20A8P-203ENST00000641373 517 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
UBE3BQ7Z3V4 AP001476.1-201ENST00000451618 2198 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
UBE3BQ7Z3V4 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
UBE3BQ7Z3V4 ASL-205ENST00000395332 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
UBE3BQ7Z3V4 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
UBE3BQ7Z3V4 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
UBE3BQ7Z3V4 ESPNP-201ENST00000270691 2015 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
UBE3BQ7Z3V4 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
UBE3BQ7Z3V4 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
UBE3BQ7Z3V4 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.7 ms