Protein–RNA interactions for Protein: Q71F56

MED13L, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 13-like, humanhuman

Predictions only

Length 2,210 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MED13LQ71F56 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
MED13LQ71F56 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
MED13LQ71F56 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
MED13LQ71F56 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
MED13LQ71F56 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
MED13LQ71F56 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
MED13LQ71F56 PARD3-205ENST00000374773 3420 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
MED13LQ71F56 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.07
MED13LQ71F56 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
MED13LQ71F56 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
MED13LQ71F56 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
MED13LQ71F56 C6orf99-202ENST00000367073 769 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
MED13LQ71F56 CSF3-203ENST00000394148 622 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.07
MED13LQ71F56 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.07
MED13LQ71F56 SYS1-203ENST00000414310 795 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.07
MED13LQ71F56 AL135791.1-201ENST00000429214 826 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
MED13LQ71F56 MIR503HG-203ENST00000441492 649 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
MED13LQ71F56 ZIC4-214ENST00000491672 925 ntTSL 4 BASIC15.52■□□□□ 0.07
MED13LQ71F56 TTLL12-204ENST00000494035 888 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
MED13LQ71F56 AC040169.1-201ENST00000565382 521 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
MED13LQ71F56 AC002347.1-201ENST00000569543 541 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
MED13LQ71F56 BNIP3P18-201ENST00000593976 575 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
MED13LQ71F56 GPR32P1-201ENST00000601788 811 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
MED13LQ71F56 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
MED13LQ71F56 KMT5B-206ENST00000405515 2869 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
MED13LQ71F56 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
MED13LQ71F56 AGPAT3-201ENST00000291572 5546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
MED13LQ71F56 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
MED13LQ71F56 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
MED13LQ71F56 MSL1-202ENST00000398532 4707 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
MED13LQ71F56 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
MED13LQ71F56 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
MED13LQ71F56 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
MED13LQ71F56 KRTCAP2-201ENST00000295682 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
MED13LQ71F56 NPFFR2-202ENST00000344413 1234 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
MED13LQ71F56 CSNK2B-203ENST00000375882 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
MED13LQ71F56 PRORY-201ENST00000382764 878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
MED13LQ71F56 AC023274.1-201ENST00000418278 595 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
MED13LQ71F56 AP006288.1-201ENST00000446065 395 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
MED13LQ71F56 BOC-211ENST00000484034 1286 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
MED13LQ71F56 MLF1-210ENST00000484955 1247 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
MED13LQ71F56 CFL1-202ENST00000524553 860 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
MED13LQ71F56 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
MED13LQ71F56 SMAD3-210ENST00000559092 584 ntTSL 4 BASIC15.51■□□□□ 0.07
MED13LQ71F56 AC124864.1-201ENST00000623408 392 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
MED13LQ71F56 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
MED13LQ71F56 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
MED13LQ71F56 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
MED13LQ71F56 ANKRD17-211ENST00000639793 3486 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
MED13LQ71F56 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
MED13LQ71F56 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
MED13LQ71F56 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
MED13LQ71F56 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
MED13LQ71F56 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
MED13LQ71F56 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
MED13LQ71F56 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
MED13LQ71F56 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
MED13LQ71F56 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
MED13LQ71F56 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
MED13LQ71F56 MRGPRF-202ENST00000320913 705 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
MED13LQ71F56 MRPS18A-201ENST00000372116 785 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
MED13LQ71F56 ZGLP1-201ENST00000403352 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
MED13LQ71F56 OST4-202ENST00000447619 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
MED13LQ71F56 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC15.51■□□□□ 0.07
MED13LQ71F56 AC009061.1-201ENST00000567261 475 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
MED13LQ71F56 AC097376.2-204ENST00000609359 627 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
MED13LQ71F56 DLC1-203ENST00000358919 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
MED13LQ71F56 TLE4-205ENST00000376544 4871 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
MED13LQ71F56 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
MED13LQ71F56 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
MED13LQ71F56 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
MED13LQ71F56 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
MED13LQ71F56 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
MED13LQ71F56 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
MED13LQ71F56 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
MED13LQ71F56 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
MED13LQ71F56 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
MED13LQ71F56 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
MED13LQ71F56 TM2D1-201ENST00000294613 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
MED13LQ71F56 PFDN6-201ENST00000374606 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
MED13LQ71F56 PAX9-204ENST00000554201 1289 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
MED13LQ71F56 CEMP1-201ENST00000565480 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
MED13LQ71F56 CCDC61-202ENST00000594087 1017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
MED13LQ71F56 AL591684.3-201ENST00000605187 298 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
MED13LQ71F56 TM2D1-212ENST00000606498 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
MED13LQ71F56 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
MED13LQ71F56 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
MED13LQ71F56 MAIP1-202ENST00000392290 1386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
MED13LQ71F56 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
MED13LQ71F56 SMN1-204ENST00000506163 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
MED13LQ71F56 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
MED13LQ71F56 QKI-205ENST00000392127 7911 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
MED13LQ71F56 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
MED13LQ71F56 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
MED13LQ71F56 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
MED13LQ71F56 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
MED13LQ71F56 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
MED13LQ71F56 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
MED13LQ71F56 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
MED13LQ71F56 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.6 ms