Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZW31

SYDE1, Rho GTPase-activating protein SYDE1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 735 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYDE1Q6ZW31 C18orf8-201ENST00000269221 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
SYDE1Q6ZW31 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
SYDE1Q6ZW31 ANKS1A-201ENST00000360359 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
SYDE1Q6ZW31 PLCG1-201ENST00000244007 5285 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
SYDE1Q6ZW31 CTSB-232ENST00000534510 1989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
SYDE1Q6ZW31 HCK-210ENST00000629881 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
SYDE1Q6ZW31 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
SYDE1Q6ZW31 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
SYDE1Q6ZW31 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
SYDE1Q6ZW31 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
SYDE1Q6ZW31 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
SYDE1Q6ZW31 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
SYDE1Q6ZW31 AC091153.3-201ENST00000497885 472 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
SYDE1Q6ZW31 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
SYDE1Q6ZW31 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
SYDE1Q6ZW31 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
SYDE1Q6ZW31 EIF3C-211ENST00000566866 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
SYDE1Q6ZW31 SLCO6A1-202ENST00000389019 2340 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
SYDE1Q6ZW31 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
SYDE1Q6ZW31 INVS-203ENST00000374921 1654 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
SYDE1Q6ZW31 PRSS53-201ENST00000280606 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
SYDE1Q6ZW31 SLC27A2-202ENST00000380902 2181 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
SYDE1Q6ZW31 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
SYDE1Q6ZW31 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
SYDE1Q6ZW31 KRT8P7-201ENST00000533003 1432 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
SYDE1Q6ZW31 HOXB1-202ENST00000577092 1414 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
SYDE1Q6ZW31 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
SYDE1Q6ZW31 PPP1R16A-202ENST00000435887 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
SYDE1Q6ZW31 KIAA1549-201ENST00000422774 6283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
SYDE1Q6ZW31 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
SYDE1Q6ZW31 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
SYDE1Q6ZW31 SENP2-201ENST00000296257 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
SYDE1Q6ZW31 ISLR2-201ENST00000361742 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
SYDE1Q6ZW31 HECTD2-203ENST00000371681 2175 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
SYDE1Q6ZW31 FMR1-206ENST00000370477 3437 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
SYDE1Q6ZW31 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.84■□□□□ 0.61
SYDE1Q6ZW31 NME9-203ENST00000383180 2133 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
SYDE1Q6ZW31 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
SYDE1Q6ZW31 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
SYDE1Q6ZW31 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
SYDE1Q6ZW31 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC18.84■□□□□ 0.61
SYDE1Q6ZW31 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
SYDE1Q6ZW31 RPN2-201ENST00000237530 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
SYDE1Q6ZW31 RNF2-201ENST00000367509 1677 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
SYDE1Q6ZW31 BFSP1-201ENST00000377868 2063 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
SYDE1Q6ZW31 BPGM-202ENST00000393132 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
SYDE1Q6ZW31 SKOR1-204ENST00000554240 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
SYDE1Q6ZW31 SPTBN4-204ENST00000392025 8671 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
SYDE1Q6ZW31 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
SYDE1Q6ZW31 UROS-202ENST00000368778 1556 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
SYDE1Q6ZW31 EIF2B4-210ENST00000493344 1949 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
SYDE1Q6ZW31 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
SYDE1Q6ZW31 GPSM2-201ENST00000264126 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
SYDE1Q6ZW31 EML3-212ENST00000494176 2901 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
SYDE1Q6ZW31 EML3-216ENST00000529309 2909 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
SYDE1Q6ZW31 BPIFB4-201ENST00000375483 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
SYDE1Q6ZW31 AC060780.1-201ENST00000635600 1782 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
SYDE1Q6ZW31 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
SYDE1Q6ZW31 WWC1-201ENST00000265293 7130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
SYDE1Q6ZW31 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
SYDE1Q6ZW31 TMEM131-201ENST00000186436 6640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
SYDE1Q6ZW31 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.61
SYDE1Q6ZW31 CDH22-203ENST00000537909 3902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.61
SYDE1Q6ZW31 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
SYDE1Q6ZW31 DNM1P34-201ENST00000567292 2276 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
SYDE1Q6ZW31 EXTL3-201ENST00000220562 6483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
SYDE1Q6ZW31 AANAT-201ENST00000250615 1913 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
SYDE1Q6ZW31 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC18.83■□□□□ 0.6
SYDE1Q6ZW31 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC18.83■□□□□ 0.6
SYDE1Q6ZW31 MFAP1P1-201ENST00000442257 1255 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
SYDE1Q6ZW31 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
SYDE1Q6ZW31 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
SYDE1Q6ZW31 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
SYDE1Q6ZW31 HIC1-202ENST00000399849 3156 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
SYDE1Q6ZW31 PP7080-201ENST00000342584 1876 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
SYDE1Q6ZW31 ARHGEF18-201ENST00000319670 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
SYDE1Q6ZW31 SLC5A10-204ENST00000395647 2140 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
SYDE1Q6ZW31 MCM9-201ENST00000316068 2442 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
SYDE1Q6ZW31 UBE3A-201ENST00000232165 5051 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
SYDE1Q6ZW31 N4BP3-201ENST00000274605 6080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
SYDE1Q6ZW31 AZU1-202ENST00000592205 1713 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
SYDE1Q6ZW31 LRCH3-201ENST00000334859 2258 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
SYDE1Q6ZW31 ZNF140-207ENST00000440550 1663 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
SYDE1Q6ZW31 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
SYDE1Q6ZW31 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
SYDE1Q6ZW31 TAF4B-201ENST00000269142 5260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
SYDE1Q6ZW31 ZNF280D-205ENST00000559000 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
SYDE1Q6ZW31 DMRTA2-201ENST00000404795 3137 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
SYDE1Q6ZW31 AL645608.8-201ENST00000606034 2086 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
SYDE1Q6ZW31 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
SYDE1Q6ZW31 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
SYDE1Q6ZW31 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
SYDE1Q6ZW31 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
SYDE1Q6ZW31 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC18.82■□□□□ 0.6
SYDE1Q6ZW31 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
SYDE1Q6ZW31 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
SYDE1Q6ZW31 NEIL1-221ENST00000569035 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
SYDE1Q6ZW31 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
SYDE1Q6ZW31 TXNRD2-218ENST00000542719 2024 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
SYDE1Q6ZW31 FBXL17-201ENST00000359660 4510 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.5 ms