Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZT52

FAM43B, Protein FAM43B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 329 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM43BQ6ZT52 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
FAM43BQ6ZT52 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
FAM43BQ6ZT52 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
FAM43BQ6ZT52 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
FAM43BQ6ZT52 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
FAM43BQ6ZT52 AL139384.1-201ENST00000612143 3047 ntBASIC19.79■□□□□ 0.76
FAM43BQ6ZT52 MAZ-212ENST00000568282 1593 ntTSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
FAM43BQ6ZT52 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
FAM43BQ6ZT52 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
FAM43BQ6ZT52 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
FAM43BQ6ZT52 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
FAM43BQ6ZT52 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
FAM43BQ6ZT52 AL049795.1-201ENST00000373604 642 ntTSL 3 BASIC19.79■□□□□ 0.76
FAM43BQ6ZT52 NUS1P2-201ENST00000417358 873 ntBASIC19.79■□□□□ 0.76
FAM43BQ6ZT52 KRT18P67-201ENST00000432816 1264 ntBASIC19.79■□□□□ 0.76
FAM43BQ6ZT52 PQLC2L-205ENST00000461040 563 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.79■□□□□ 0.76
FAM43BQ6ZT52 AF186996.4-201ENST00000467186 377 ntBASIC19.79■□□□□ 0.76
FAM43BQ6ZT52 TRMT112-203ENST00000535750 823 ntTSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
FAM43BQ6ZT52 AL773604.1-201ENST00000617417 272 ntBASIC19.79■□□□□ 0.76
FAM43BQ6ZT52 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
FAM43BQ6ZT52 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
FAM43BQ6ZT52 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
FAM43BQ6ZT52 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
FAM43BQ6ZT52 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
FAM43BQ6ZT52 AQP8-201ENST00000219660 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
FAM43BQ6ZT52 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
FAM43BQ6ZT52 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
FAM43BQ6ZT52 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
FAM43BQ6ZT52 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
FAM43BQ6ZT52 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
FAM43BQ6ZT52 SKOR1-203ENST00000554054 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
FAM43BQ6ZT52 BBC3-201ENST00000300880 1347 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
FAM43BQ6ZT52 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
FAM43BQ6ZT52 BAIAP2-203ENST00000416299 1442 ntTSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
FAM43BQ6ZT52 CRTC3-208ENST00000560098 1421 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
FAM43BQ6ZT52 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
FAM43BQ6ZT52 CCZ1-207ENST00000628813 2218 ntTSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
FAM43BQ6ZT52 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
FAM43BQ6ZT52 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
FAM43BQ6ZT52 TLE1-202ENST00000376484 666 ntTSL 3 BASIC19.78■□□□□ 0.76
FAM43BQ6ZT52 SERF1B-202ENST00000380751 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
FAM43BQ6ZT52 CTNS-203ENST00000399306 803 ntTSL 3 BASIC19.78■□□□□ 0.76
FAM43BQ6ZT52 AL022342.1-201ENST00000400363 863 ntBASIC19.78■□□□□ 0.76
FAM43BQ6ZT52 SCARNA2-201ENST00000458748 420 ntBASIC19.78■□□□□ 0.76
FAM43BQ6ZT52 AC093909.1-201ENST00000504731 1122 ntBASIC19.78■□□□□ 0.76
FAM43BQ6ZT52 COX5A-202ENST00000562233 441 ntTSL 3 BASIC19.78■□□□□ 0.76
FAM43BQ6ZT52 ATP6V0C-202ENST00000564973 1081 ntTSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
FAM43BQ6ZT52 MRPL21-208ENST00000567045 932 ntTSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
FAM43BQ6ZT52 AP001005.1-201ENST00000571755 1248 ntBASIC19.78■□□□□ 0.76
FAM43BQ6ZT52 GZMM-202ENST00000592501 941 ntTSL 3 BASIC19.78■□□□□ 0.76
FAM43BQ6ZT52 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
FAM43BQ6ZT52 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
FAM43BQ6ZT52 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC19.78■□□□□ 0.76
FAM43BQ6ZT52 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
FAM43BQ6ZT52 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
FAM43BQ6ZT52 NOC2LP1-202ENST00000452600 2235 ntBASIC19.78■□□□□ 0.76
FAM43BQ6ZT52 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
FAM43BQ6ZT52 MTMR1-208ENST00000445323 4516 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
FAM43BQ6ZT52 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
FAM43BQ6ZT52 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
FAM43BQ6ZT52 CABP4-202ENST00000438189 1426 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
FAM43BQ6ZT52 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
FAM43BQ6ZT52 GUCA1A-205ENST00000541991 1921 ntTSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
FAM43BQ6ZT52 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
FAM43BQ6ZT52 SDHAP2-201ENST00000455183 2001 ntBASIC19.77■□□□□ 0.76
FAM43BQ6ZT52 NUDT6-201ENST00000304430 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
FAM43BQ6ZT52 RPS2P28-201ENST00000314255 741 ntBASIC19.77■□□□□ 0.76
FAM43BQ6ZT52 EXOSC4-201ENST00000316052 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
FAM43BQ6ZT52 GYG2P1-201ENST00000357871 623 ntTSL 3 BASIC19.77■□□□□ 0.76
FAM43BQ6ZT52 CD9-202ENST00000382515 1229 ntTSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
FAM43BQ6ZT52 AC007834.1-201ENST00000446473 728 ntTSL 3 BASIC19.77■□□□□ 0.76
FAM43BQ6ZT52 AC234772.2-201ENST00000456532 375 ntTSL 3 BASIC19.77■□□□□ 0.76
FAM43BQ6ZT52 C1QB-203ENST00000509305 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
FAM43BQ6ZT52 HDDC3-205ENST00000559898 1024 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
FAM43BQ6ZT52 YPEL3-209ENST00000566595 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
FAM43BQ6ZT52 AC087289.1-201ENST00000586808 890 ntTSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
FAM43BQ6ZT52 AC020934.1-201ENST00000588469 739 ntTSL 3 BASIC19.77■□□□□ 0.76
FAM43BQ6ZT52 AC011467.2-201ENST00000598425 242 ntBASIC19.77■□□□□ 0.76
FAM43BQ6ZT52 SCN5A-214ENST00000612060 714 ntTSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
FAM43BQ6ZT52 AL355877.3-201ENST00000622820 899 ntBASIC19.77■□□□□ 0.76
FAM43BQ6ZT52 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
FAM43BQ6ZT52 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
FAM43BQ6ZT52 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
FAM43BQ6ZT52 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.75
FAM43BQ6ZT52 RSRC1-211ENST00000480820 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
FAM43BQ6ZT52 FAM9A-202ENST00000543214 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
FAM43BQ6ZT52 ARHGEF2-204ENST00000368315 1645 ntTSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
FAM43BQ6ZT52 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
FAM43BQ6ZT52 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
FAM43BQ6ZT52 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
FAM43BQ6ZT52 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
FAM43BQ6ZT52 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
FAM43BQ6ZT52 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
FAM43BQ6ZT52 SEPT9-211ENST00000585930 1387 ntTSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
FAM43BQ6ZT52 AC005329.3-201ENST00000626781 1366 ntTSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
FAM43BQ6ZT52 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
FAM43BQ6ZT52 ART5-201ENST00000359918 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
FAM43BQ6ZT52 CD1E-209ENST00000368164 869 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
FAM43BQ6ZT52 BIRC7-203ENST00000395306 593 ntTSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
FAM43BQ6ZT52 CAPG-203ENST00000409670 1183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.1 ms