Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZR62

RTL4, Retrotransposon Gag-like protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 310 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTL4Q6ZR62 ZDHHC23-201ENST00000330212 3778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RTL4Q6ZR62 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
RTL4Q6ZR62 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RTL4Q6ZR62 PHRF1-205ENST00000533464 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RTL4Q6ZR62 DAPK1-207ENST00000469640 5899 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
RTL4Q6ZR62 PNPO-201ENST00000225573 2256 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RTL4Q6ZR62 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RTL4Q6ZR62 CASKIN2-205ENST00000581870 1612 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
RTL4Q6ZR62 SIGLEC10-204ENST00000436984 1776 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
RTL4Q6ZR62 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RTL4Q6ZR62 CACNA2D2-201ENST00000266039 5476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RTL4Q6ZR62 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RTL4Q6ZR62 TMEM214-201ENST00000238788 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RTL4Q6ZR62 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RTL4Q6ZR62 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
RTL4Q6ZR62 ZBTB8A-201ENST00000316459 1943 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RTL4Q6ZR62 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RTL4Q6ZR62 DNM1-206ENST00000475805 2710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
RTL4Q6ZR62 UBFD1-201ENST00000395878 5110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
RTL4Q6ZR62 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RTL4Q6ZR62 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
RTL4Q6ZR62 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
RTL4Q6ZR62 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RTL4Q6ZR62 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
RTL4Q6ZR62 RNF146-204ENST00000476956 884 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
RTL4Q6ZR62 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
RTL4Q6ZR62 EEF2KMT-206ENST00000587133 873 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
RTL4Q6ZR62 YIPF2-209ENST00000590329 958 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
RTL4Q6ZR62 GEMIN7-203ENST00000591607 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
RTL4Q6ZR62 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
RTL4Q6ZR62 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
RTL4Q6ZR62 ZSWIM8-223ENST00000605216 6004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RTL4Q6ZR62 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
RTL4Q6ZR62 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RTL4Q6ZR62 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
RTL4Q6ZR62 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RTL4Q6ZR62 METTL21A-203ENST00000411432 4805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
RTL4Q6ZR62 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RTL4Q6ZR62 SMPD4-202ENST00000409031 4896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RTL4Q6ZR62 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RTL4Q6ZR62 LUC7L2-210ENST00000619796 2783 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RTL4Q6ZR62 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
RTL4Q6ZR62 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RTL4Q6ZR62 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RTL4Q6ZR62 ADGRB2-201ENST00000373655 5400 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RTL4Q6ZR62 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
RTL4Q6ZR62 TLK2-203ENST00000346027 3449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RTL4Q6ZR62 AC087457.1-201ENST00000503496 2727 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
RTL4Q6ZR62 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
RTL4Q6ZR62 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RTL4Q6ZR62 NIPAL2-201ENST00000341166 4581 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
RTL4Q6ZR62 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
RTL4Q6ZR62 AC114763.1-202ENST00000414911 867 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
RTL4Q6ZR62 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RTL4Q6ZR62 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
RTL4Q6ZR62 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
RTL4Q6ZR62 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
RTL4Q6ZR62 REPS2-201ENST00000303843 7771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RTL4Q6ZR62 PCDHA7-202ENST00000525929 5221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RTL4Q6ZR62 ATPAF1-214ENST00000576409 4158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RTL4Q6ZR62 NUTM2F-202ENST00000341207 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
RTL4Q6ZR62 NUTM2G-202ENST00000372322 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
RTL4Q6ZR62 BANP-223ENST00000538234 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RTL4Q6ZR62 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RTL4Q6ZR62 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RTL4Q6ZR62 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
RTL4Q6ZR62 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RTL4Q6ZR62 LENG8-202ENST00000376514 5146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
RTL4Q6ZR62 ITGB4-201ENST00000200181 5919 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RTL4Q6ZR62 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RTL4Q6ZR62 LONP1-215ENST00000593119 2918 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
RTL4Q6ZR62 HEXDC-203ENST00000577944 1820 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
RTL4Q6ZR62 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RTL4Q6ZR62 TCP11-201ENST00000244645 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RTL4Q6ZR62 CNNM3-202ENST00000377060 3308 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
RTL4Q6ZR62 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RTL4Q6ZR62 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RTL4Q6ZR62 SLC5A10-203ENST00000395645 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RTL4Q6ZR62 WDR90-215ENST00000549091 5589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
RTL4Q6ZR62 GTPBP2-202ENST00000307126 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RTL4Q6ZR62 BAIAP2-203ENST00000416299 1442 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
RTL4Q6ZR62 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RTL4Q6ZR62 SEC14L2-215ENST00000617837 2632 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
RTL4Q6ZR62 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RTL4Q6ZR62 ABCD1-202ENST00000370129 1016 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
RTL4Q6ZR62 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
RTL4Q6ZR62 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RTL4Q6ZR62 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RTL4Q6ZR62 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
RTL4Q6ZR62 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RTL4Q6ZR62 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RTL4Q6ZR62 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RTL4Q6ZR62 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RTL4Q6ZR62 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RTL4Q6ZR62 AL359075.1-203ENST00000462729 1002 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
RTL4Q6ZR62 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
RTL4Q6ZR62 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
RTL4Q6ZR62 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
RTL4Q6ZR62 MTMR1-208ENST00000445323 4516 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RTL4Q6ZR62 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.8 ms