Protein–RNA interactions for Protein: Q6XXX2

LINC00114, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00114, humanhuman

Predictions only

Length 140 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00114Q6XXX2 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
LINC00114Q6XXX2 LGI4-201ENST00000310123 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
LINC00114Q6XXX2 DPAGT1-203ENST00000409993 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
LINC00114Q6XXX2 NFATC1-206ENST00000542384 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
LINC00114Q6XXX2 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
LINC00114Q6XXX2 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
LINC00114Q6XXX2 ARMC10-209ENST00000454559 2347 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
LINC00114Q6XXX2 KIFC3-201ENST00000379655 3427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
LINC00114Q6XXX2 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC16.52■□□□□ 0.23
LINC00114Q6XXX2 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
LINC00114Q6XXX2 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
LINC00114Q6XXX2 MARVELD3-202ENST00000299952 2214 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
LINC00114Q6XXX2 PHF1-201ENST00000374512 2224 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
LINC00114Q6XXX2 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
LINC00114Q6XXX2 HDAC10-202ENST00000349505 1950 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
LINC00114Q6XXX2 FMR1-206ENST00000370477 3437 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
LINC00114Q6XXX2 ZNF419-204ENST00000415379 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
LINC00114Q6XXX2 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
LINC00114Q6XXX2 PANX1-201ENST00000227638 2769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
LINC00114Q6XXX2 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
LINC00114Q6XXX2 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
LINC00114Q6XXX2 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
LINC00114Q6XXX2 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
LINC00114Q6XXX2 PABPC1L-217ENST00000537323 1910 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
LINC00114Q6XXX2 ZNF454-202ENST00000519564 2142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
LINC00114Q6XXX2 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
LINC00114Q6XXX2 QPRT-202ENST00000395384 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
LINC00114Q6XXX2 ZDHHC8P1-204ENST00000433168 2309 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
LINC00114Q6XXX2 AKT1S1-207ENST00000391835 3075 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
LINC00114Q6XXX2 THEG-201ENST00000342640 1877 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
LINC00114Q6XXX2 C16orf59-204ENST00000563531 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
LINC00114Q6XXX2 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
LINC00114Q6XXX2 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
LINC00114Q6XXX2 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
LINC00114Q6XXX2 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
LINC00114Q6XXX2 AC006942.1-201ENST00000600669 520 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
LINC00114Q6XXX2 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
LINC00114Q6XXX2 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
LINC00114Q6XXX2 WNT5B-203ENST00000537031 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
LINC00114Q6XXX2 MUS81-215ENST00000533035 2180 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
LINC00114Q6XXX2 PIGZ-202ENST00000412723 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
LINC00114Q6XXX2 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
LINC00114Q6XXX2 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
LINC00114Q6XXX2 ZNF500-202ENST00000545009 2440 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
LINC00114Q6XXX2 SULT1A1-204ENST00000395609 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
LINC00114Q6XXX2 INVS-203ENST00000374921 1654 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
LINC00114Q6XXX2 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
LINC00114Q6XXX2 C18orf8-208ENST00000590868 2002 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
LINC00114Q6XXX2 FXYD6-204ENST00000526014 2171 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
LINC00114Q6XXX2 SLC27A5-207ENST00000601355 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
LINC00114Q6XXX2 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
LINC00114Q6XXX2 CCNJL-203ENST00000393977 3320 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
LINC00114Q6XXX2 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
LINC00114Q6XXX2 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
LINC00114Q6XXX2 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
LINC00114Q6XXX2 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
LINC00114Q6XXX2 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
LINC00114Q6XXX2 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
LINC00114Q6XXX2 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
LINC00114Q6XXX2 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
LINC00114Q6XXX2 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
LINC00114Q6XXX2 ERI1-203ENST00000519292 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
LINC00114Q6XXX2 CMTM3-210ENST00000565666 769 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
LINC00114Q6XXX2 AC064834.1-201ENST00000606986 503 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
LINC00114Q6XXX2 AC254629.1-202ENST00000618276 2112 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
LINC00114Q6XXX2 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
LINC00114Q6XXX2 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
LINC00114Q6XXX2 CMIP-209ENST00000566513 2288 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
LINC00114Q6XXX2 CSK-201ENST00000220003 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
LINC00114Q6XXX2 ZNF74-201ENST00000357502 2788 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
LINC00114Q6XXX2 C16orf45-201ENST00000300006 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
LINC00114Q6XXX2 RAB4B-EGLN2-201ENST00000594136 2554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
LINC00114Q6XXX2 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
LINC00114Q6XXX2 AC006116.8-202ENST00000587620 1550 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
LINC00114Q6XXX2 MYZAP-201ENST00000267853 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
LINC00114Q6XXX2 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
LINC00114Q6XXX2 FAM213B-205ENST00000444521 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
LINC00114Q6XXX2 B3GALT5-206ENST00000615480 2617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
LINC00114Q6XXX2 CLPB-212ENST00000543042 2133 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
LINC00114Q6XXX2 DTNB-209ENST00000407038 2294 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
LINC00114Q6XXX2 NEXN-AS1-201ENST00000421331 2292 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
LINC00114Q6XXX2 APMAP-201ENST00000217456 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
LINC00114Q6XXX2 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
LINC00114Q6XXX2 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
LINC00114Q6XXX2 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
LINC00114Q6XXX2 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
LINC00114Q6XXX2 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
LINC00114Q6XXX2 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
LINC00114Q6XXX2 PRSS53-201ENST00000280606 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
LINC00114Q6XXX2 TSPAN14-202ENST00000341863 1037 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
LINC00114Q6XXX2 FCGRT-202ENST00000426395 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
LINC00114Q6XXX2 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
LINC00114Q6XXX2 PVRIG2P-201ENST00000435460 978 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
LINC00114Q6XXX2 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
LINC00114Q6XXX2 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
LINC00114Q6XXX2 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
LINC00114Q6XXX2 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
LINC00114Q6XXX2 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
LINC00114Q6XXX2 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
LINC00114Q6XXX2 BORCS6-201ENST00000389017 2575 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24 ms