Protein–RNA interactions for Protein: Q6P1M0

SLC27A4, Long-chain fatty acid transport protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 643 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC27A4Q6P1M0 HOTAIR-201ENST00000424518 2421 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SLC27A4Q6P1M0 RPS6KA3-201ENST00000379565 7918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SLC27A4Q6P1M0 TMSB4Y-201ENST00000284856 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SLC27A4Q6P1M0 OLA1-201ENST00000284719 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SLC27A4Q6P1M0 ENDOV-225ENST00000522751 1475 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SLC27A4Q6P1M0 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SLC27A4Q6P1M0 FAM234A-203ENST00000399932 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SLC27A4Q6P1M0 STRA6-209ENST00000563965 2565 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SLC27A4Q6P1M0 ARHGEF19-201ENST00000270747 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SLC27A4Q6P1M0 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SLC27A4Q6P1M0 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SLC27A4Q6P1M0 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SLC27A4Q6P1M0 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
SLC27A4Q6P1M0 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SLC27A4Q6P1M0 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SLC27A4Q6P1M0 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SLC27A4Q6P1M0 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SLC27A4Q6P1M0 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SLC27A4Q6P1M0 FZD10-201ENST00000229030 3281 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SLC27A4Q6P1M0 CAPN15-201ENST00000219611 4744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SLC27A4Q6P1M0 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SLC27A4Q6P1M0 KLHL21-202ENST00000377663 6445 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SLC27A4Q6P1M0 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SLC27A4Q6P1M0 CPEB3-203ENST00000614585 5789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SLC27A4Q6P1M0 CLDN9-201ENST00000445369 2050 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SLC27A4Q6P1M0 BCR-201ENST00000305877 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SLC27A4Q6P1M0 ARMC10-209ENST00000454559 2347 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SLC27A4Q6P1M0 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SLC27A4Q6P1M0 SLC5A10-204ENST00000395647 2140 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SLC27A4Q6P1M0 SATB2-203ENST00000428695 2135 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SLC27A4Q6P1M0 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SLC27A4Q6P1M0 NEU1-206ENST00000375631 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SLC27A4Q6P1M0 TBKBP1-204ENST00000622396 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SLC27A4Q6P1M0 SLC12A9-215ENST00000540482 2269 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SLC27A4Q6P1M0 C6orf106-202ENST00000374023 4418 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SLC27A4Q6P1M0 RNF166-203ENST00000541206 2419 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SLC27A4Q6P1M0 PIF1-201ENST00000268043 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SLC27A4Q6P1M0 ASPM-201ENST00000294732 6132 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SLC27A4Q6P1M0 PHKA1-201ENST00000339490 6121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SLC27A4Q6P1M0 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SLC27A4Q6P1M0 MINDY2-202ENST00000450403 4820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SLC27A4Q6P1M0 FBF1-205ENST00000586717 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SLC27A4Q6P1M0 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SLC27A4Q6P1M0 PPP1R7-202ENST00000272983 1954 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SLC27A4Q6P1M0 PGRMC2-208ENST00000613358 3783 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SLC27A4Q6P1M0 MED9-201ENST00000268711 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SLC27A4Q6P1M0 TMEM45B-201ENST00000281441 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SLC27A4Q6P1M0 C16orf59-204ENST00000563531 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SLC27A4Q6P1M0 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SLC27A4Q6P1M0 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SLC27A4Q6P1M0 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SLC27A4Q6P1M0 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SLC27A4Q6P1M0 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SLC27A4Q6P1M0 FAM207BP-201ENST00000447172 505 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
SLC27A4Q6P1M0 AC008771.1-201ENST00000508000 1151 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SLC27A4Q6P1M0 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SLC27A4Q6P1M0 AP5B1-201ENST00000532090 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SLC27A4Q6P1M0 AC005498.3-201ENST00000596587 2045 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SLC27A4Q6P1M0 SLC47A2-202ENST00000350657 2285 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SLC27A4Q6P1M0 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SLC27A4Q6P1M0 OGFOD2-212ENST00000538755 1949 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SLC27A4Q6P1M0 AC120049.1-201ENST00000592638 2065 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SLC27A4Q6P1M0 OARD1-202ENST00000424266 1337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SLC27A4Q6P1M0 JAG1-201ENST00000254958 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SLC27A4Q6P1M0 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SLC27A4Q6P1M0 VAV2-203ENST00000406606 4691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SLC27A4Q6P1M0 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SLC27A4Q6P1M0 PTPN6-204ENST00000456013 2389 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SLC27A4Q6P1M0 ELF3-201ENST00000359651 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SLC27A4Q6P1M0 CACNA1B-205ENST00000371363 9758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SLC27A4Q6P1M0 POLR1D-221ENST00000637180 2262 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SLC27A4Q6P1M0 STK4-201ENST00000372801 2038 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SLC27A4Q6P1M0 AMDHD2-203ENST00000413459 2049 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SLC27A4Q6P1M0 MFGE8-202ENST00000268151 1752 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SLC27A4Q6P1M0 CDC25A-201ENST00000302506 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SLC27A4Q6P1M0 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SLC27A4Q6P1M0 WHAMMP3-203ENST00000621139 4494 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SLC27A4Q6P1M0 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SLC27A4Q6P1M0 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SLC27A4Q6P1M0 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SLC27A4Q6P1M0 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SLC27A4Q6P1M0 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SLC27A4Q6P1M0 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
SLC27A4Q6P1M0 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SLC27A4Q6P1M0 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SLC27A4Q6P1M0 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SLC27A4Q6P1M0 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
SLC27A4Q6P1M0 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SLC27A4Q6P1M0 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SLC27A4Q6P1M0 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SLC27A4Q6P1M0 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SLC27A4Q6P1M0 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SLC27A4Q6P1M0 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SLC27A4Q6P1M0 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
SLC27A4Q6P1M0 ZBTB45-201ENST00000354590 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SLC27A4Q6P1M0 MRM2-203ENST00000440306 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SLC27A4Q6P1M0 TPGS2-219ENST00000593035 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SLC27A4Q6P1M0 ASXL1-202ENST00000375687 7031 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SLC27A4Q6P1M0 TCEA1-201ENST00000396401 2718 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SLC27A4Q6P1M0 ARNTL-201ENST00000389707 2776 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32 ms