Protein–RNA interactions for Protein: Q6NTF9

RHBDD2, Rhomboid domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 364 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RHBDD2Q6NTF9 NDUFA6-204ENST00000617763 1183 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
RHBDD2Q6NTF9 POLD4-205ENST00000529704 1486 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
RHBDD2Q6NTF9 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
RHBDD2Q6NTF9 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
RHBDD2Q6NTF9 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
RHBDD2Q6NTF9 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
RHBDD2Q6NTF9 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
RHBDD2Q6NTF9 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
RHBDD2Q6NTF9 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
RHBDD2Q6NTF9 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
RHBDD2Q6NTF9 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
RHBDD2Q6NTF9 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
RHBDD2Q6NTF9 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
RHBDD2Q6NTF9 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.34
RHBDD2Q6NTF9 IFIH1-202ENST00000421365 1617 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
RHBDD2Q6NTF9 AC007192.1-201ENST00000593731 5142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
RHBDD2Q6NTF9 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
RHBDD2Q6NTF9 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
RHBDD2Q6NTF9 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
RHBDD2Q6NTF9 CCDC134-201ENST00000255784 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
RHBDD2Q6NTF9 FAAHP1-202ENST00000446499 1238 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
RHBDD2Q6NTF9 BET1L-206ENST00000486280 665 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
RHBDD2Q6NTF9 STK32A-AS1-201ENST00000504297 863 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
RHBDD2Q6NTF9 TSFM-208ENST00000543727 651 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
RHBDD2Q6NTF9 AC022150.1-201ENST00000599222 640 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
RHBDD2Q6NTF9 AC138894.3-201ENST00000603787 634 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
RHBDD2Q6NTF9 DEF8-211ENST00000563795 1767 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
RHBDD2Q6NTF9 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
RHBDD2Q6NTF9 CCT6P1-202ENST00000442266 1317 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
RHBDD2Q6NTF9 MAZ-212ENST00000568282 1593 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
RHBDD2Q6NTF9 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
RHBDD2Q6NTF9 LRRC27-201ENST00000344079 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
RHBDD2Q6NTF9 ACOT7-202ENST00000377842 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
RHBDD2Q6NTF9 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
RHBDD2Q6NTF9 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
RHBDD2Q6NTF9 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
RHBDD2Q6NTF9 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
RHBDD2Q6NTF9 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
RHBDD2Q6NTF9 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
RHBDD2Q6NTF9 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
RHBDD2Q6NTF9 EHMT1-204ENST00000462484 2707 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
RHBDD2Q6NTF9 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
RHBDD2Q6NTF9 SERPINE2-206ENST00000447280 1716 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
RHBDD2Q6NTF9 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
RHBDD2Q6NTF9 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
RHBDD2Q6NTF9 TMED3-201ENST00000299705 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
RHBDD2Q6NTF9 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
RHBDD2Q6NTF9 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
RHBDD2Q6NTF9 AMDHD2-203ENST00000413459 2049 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
RHBDD2Q6NTF9 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
RHBDD2Q6NTF9 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
RHBDD2Q6NTF9 ARMC12-202ENST00000373866 1254 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
RHBDD2Q6NTF9 CRELD2-202ENST00000403427 1242 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
RHBDD2Q6NTF9 MCFD2-203ENST00000409147 671 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
RHBDD2Q6NTF9 SBDSP1-202ENST00000423945 618 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
RHBDD2Q6NTF9 AC068134.1-202ENST00000439072 356 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
RHBDD2Q6NTF9 MINOS1P3-201ENST00000457048 203 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
RHBDD2Q6NTF9 ACP6-203ENST00000487562 1258 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
RHBDD2Q6NTF9 CUTA-210ENST00000488034 769 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
RHBDD2Q6NTF9 AP000721.2-201ENST00000537170 650 ntTSL 4 BASIC17.13■□□□□ 0.33
RHBDD2Q6NTF9 AC126763.1-201ENST00000552015 2118 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
RHBDD2Q6NTF9 FICD-205ENST00000552758 603 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
RHBDD2Q6NTF9 SNHG15-203ENST00000578968 982 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
RHBDD2Q6NTF9 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
RHBDD2Q6NTF9 SPINK2-205ENST00000616980 677 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
RHBDD2Q6NTF9 CCNC-219ENST00000627680 896 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
RHBDD2Q6NTF9 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
RHBDD2Q6NTF9 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
RHBDD2Q6NTF9 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
RHBDD2Q6NTF9 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
RHBDD2Q6NTF9 GSEC-201ENST00000626810 2289 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
RHBDD2Q6NTF9 FBLN7-205ENST00000409903 1989 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
RHBDD2Q6NTF9 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
RHBDD2Q6NTF9 PNMA8B-202ENST00000599531 5308 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
RHBDD2Q6NTF9 CTNNBL1-204ENST00000405275 2076 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
RHBDD2Q6NTF9 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
RHBDD2Q6NTF9 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
RHBDD2Q6NTF9 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
RHBDD2Q6NTF9 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
RHBDD2Q6NTF9 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
RHBDD2Q6NTF9 AC027097.1-202ENST00000592201 1954 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
RHBDD2Q6NTF9 EMB-204ENST00000508934 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
RHBDD2Q6NTF9 MRPS34-201ENST00000177742 1040 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
RHBDD2Q6NTF9 HBZ-201ENST00000252951 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
RHBDD2Q6NTF9 TPM1-203ENST00000317516 738 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
RHBDD2Q6NTF9 KLK12-202ENST00000319590 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
RHBDD2Q6NTF9 HDDC3-201ENST00000330334 1047 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
RHBDD2Q6NTF9 CMTM1-204ENST00000336328 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
RHBDD2Q6NTF9 INPP5F-203ENST00000369081 874 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
RHBDD2Q6NTF9 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
RHBDD2Q6NTF9 HYI-201ENST00000372425 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
RHBDD2Q6NTF9 POM121L3P-201ENST00000419331 1163 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
RHBDD2Q6NTF9 AC026396.1-201ENST00000419388 421 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
RHBDD2Q6NTF9 KRT18P65-201ENST00000439811 1286 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
RHBDD2Q6NTF9 CMTM1-213ENST00000529506 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
RHBDD2Q6NTF9 AL512357.1-201ENST00000557687 518 ntTSL 4 BASIC17.12■□□□□ 0.33
RHBDD2Q6NTF9 TPM1-218ENST00000559281 851 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
RHBDD2Q6NTF9 EML2-AS1-203ENST00000623430 886 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
RHBDD2Q6NTF9 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
RHBDD2Q6NTF9 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.4 ms