Protein–RNA interactions for Protein: Q6AI12

ANKRD40, Ankyrin repeat domain-containing protein 40, humanhuman

Predictions only

Length 368 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD40Q6AI12 ZCCHC24-202ENST00000372336 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ANKRD40Q6AI12 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ANKRD40Q6AI12 SEPT2-208ENST00000407971 3267 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
ANKRD40Q6AI12 ARHGEF18-202ENST00000359920 5733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
ANKRD40Q6AI12 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ANKRD40Q6AI12 GATA2-203ENST00000487848 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ANKRD40Q6AI12 SORCS3-201ENST00000369699 5530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ANKRD40Q6AI12 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ANKRD40Q6AI12 OLFM2-203ENST00000590841 1665 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ANKRD40Q6AI12 SCARB1-203ENST00000415380 2731 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ANKRD40Q6AI12 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ANKRD40Q6AI12 PRMT2-203ENST00000355680 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ANKRD40Q6AI12 C3orf18-201ENST00000357203 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ANKRD40Q6AI12 REPS1-202ENST00000367663 2607 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ANKRD40Q6AI12 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ANKRD40Q6AI12 RAB4B-EGLN2-201ENST00000594136 2554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ANKRD40Q6AI12 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ANKRD40Q6AI12 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ANKRD40Q6AI12 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ANKRD40Q6AI12 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ANKRD40Q6AI12 SPAST-203ENST00000615843 5212 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ANKRD40Q6AI12 ZXDB-201ENST00000374888 5894 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ANKRD40Q6AI12 LTBP3-202ENST00000322147 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ANKRD40Q6AI12 AC134043.2-201ENST00000624206 2238 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
ANKRD40Q6AI12 KDM1A-202ENST00000400181 3059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ANKRD40Q6AI12 PCBP3-205ENST00000400310 2168 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ANKRD40Q6AI12 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ANKRD40Q6AI12 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ANKRD40Q6AI12 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ANKRD40Q6AI12 AC131097.3-201ENST00000413820 1228 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ANKRD40Q6AI12 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
ANKRD40Q6AI12 AC009947.2-201ENST00000444014 672 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
ANKRD40Q6AI12 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ANKRD40Q6AI12 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
ANKRD40Q6AI12 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ANKRD40Q6AI12 MIR3180-4-201ENST00000582223 153 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
ANKRD40Q6AI12 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ANKRD40Q6AI12 AC010240.3-201ENST00000607688 395 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
ANKRD40Q6AI12 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ANKRD40Q6AI12 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ANKRD40Q6AI12 PRSS36-201ENST00000268281 2840 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ANKRD40Q6AI12 GTF2IP4-202ENST00000544802 3609 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ANKRD40Q6AI12 WDR25-202ENST00000402312 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ANKRD40Q6AI12 AL024508.2-201ENST00000607749 1894 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
ANKRD40Q6AI12 ANXA6-201ENST00000354546 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ANKRD40Q6AI12 CBX2-202ENST00000310942 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ANKRD40Q6AI12 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ANKRD40Q6AI12 GTF2H4-201ENST00000259895 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ANKRD40Q6AI12 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ANKRD40Q6AI12 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ANKRD40Q6AI12 TRIM15-207ENST00000376694 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ANKRD40Q6AI12 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ANKRD40Q6AI12 PTTG1IP-201ENST00000330938 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ANKRD40Q6AI12 AGER-205ENST00000375069 1538 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ANKRD40Q6AI12 ZNF487-202ENST00000437590 2111 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ANKRD40Q6AI12 XKR8-201ENST00000373884 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ANKRD40Q6AI12 DUS1L-201ENST00000306796 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ANKRD40Q6AI12 ZNF416-201ENST00000196489 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ANKRD40Q6AI12 TTLL8-201ENST00000266182 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ANKRD40Q6AI12 NETO1-201ENST00000327305 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ANKRD40Q6AI12 ZNF500-202ENST00000545009 2440 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ANKRD40Q6AI12 CD14-201ENST00000302014 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ANKRD40Q6AI12 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ANKRD40Q6AI12 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ANKRD40Q6AI12 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ANKRD40Q6AI12 PRKCI-201ENST00000295797 4950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ANKRD40Q6AI12 PSTPIP1-201ENST00000379595 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ANKRD40Q6AI12 TRMT6-201ENST00000203001 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ANKRD40Q6AI12 ZDHHC8P1-204ENST00000433168 2309 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ANKRD40Q6AI12 AC138430.1-201ENST00000586064 5409 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ANKRD40Q6AI12 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ANKRD40Q6AI12 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ANKRD40Q6AI12 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ANKRD40Q6AI12 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ANKRD40Q6AI12 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ANKRD40Q6AI12 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ANKRD40Q6AI12 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ANKRD40Q6AI12 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ANKRD40Q6AI12 SLC25A6P5-201ENST00000435663 894 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
ANKRD40Q6AI12 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ANKRD40Q6AI12 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ANKRD40Q6AI12 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ANKRD40Q6AI12 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ANKRD40Q6AI12 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ANKRD40Q6AI12 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ANKRD40Q6AI12 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
ANKRD40Q6AI12 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
ANKRD40Q6AI12 PPT2-247ENST00000375143 1754 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ANKRD40Q6AI12 CSAD-209ENST00000453446 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ANKRD40Q6AI12 PSRC1-201ENST00000369903 1710 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ANKRD40Q6AI12 PSRC1-206ENST00000409267 1730 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ANKRD40Q6AI12 BECN1-201ENST00000361523 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ANKRD40Q6AI12 TAP1-201ENST00000354258 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ANKRD40Q6AI12 PLD3-205ENST00000409419 1966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ANKRD40Q6AI12 MYZAP-201ENST00000267853 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ANKRD40Q6AI12 FARP2-202ENST00000373287 2580 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ANKRD40Q6AI12 NR2C2-206ENST00000425241 2494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ANKRD40Q6AI12 SDHA-204ENST00000504309 2067 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ANKRD40Q6AI12 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ANKRD40Q6AI12 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.9 ms