Protein–RNA interactions for Protein: Q68D86

CCDC102B, Coiled-coil domain-containing protein 102B, humanhuman

Predictions only

Length 513 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC102BQ68D86 C6orf136-203ENST00000376473 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCDC102BQ68D86 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCDC102BQ68D86 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCDC102BQ68D86 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCDC102BQ68D86 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CCDC102BQ68D86 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CCDC102BQ68D86 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CCDC102BQ68D86 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CCDC102BQ68D86 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CCDC102BQ68D86 RBM14-RBM4-203ENST00000500635 829 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CCDC102BQ68D86 AC105202.1-201ENST00000517833 995 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CCDC102BQ68D86 TMEM41B-203ENST00000527813 803 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CCDC102BQ68D86 PNN-202ENST00000553331 656 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CCDC102BQ68D86 AP005901.3-202ENST00000581653 237 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
CCDC102BQ68D86 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CCDC102BQ68D86 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CCDC102BQ68D86 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CCDC102BQ68D86 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CCDC102BQ68D86 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CCDC102BQ68D86 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CCDC102BQ68D86 IGF2-207ENST00000434045 1583 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CCDC102BQ68D86 MRPL4-203ENST00000393733 1620 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CCDC102BQ68D86 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CCDC102BQ68D86 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CCDC102BQ68D86 GTF2H4-202ENST00000376316 1673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CCDC102BQ68D86 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCDC102BQ68D86 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCDC102BQ68D86 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCDC102BQ68D86 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCDC102BQ68D86 KLK12-201ENST00000250351 882 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCDC102BQ68D86 AC093585.1-201ENST00000425183 428 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCDC102BQ68D86 SNHG7-203ENST00000436596 509 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCDC102BQ68D86 AC092338.2-202ENST00000567158 611 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCDC102BQ68D86 ZNF688-207ENST00000567855 540 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCDC102BQ68D86 RBFA-202ENST00000306735 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCDC102BQ68D86 CRYL1-202ENST00000382812 1581 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCDC102BQ68D86 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCDC102BQ68D86 PSTK-201ENST00000368887 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCDC102BQ68D86 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCDC102BQ68D86 UBE2I-207ENST00000406620 1842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCDC102BQ68D86 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCDC102BQ68D86 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCDC102BQ68D86 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCDC102BQ68D86 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCDC102BQ68D86 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCDC102BQ68D86 ALDH5A1-201ENST00000348925 2266 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCDC102BQ68D86 LRRC27-201ENST00000344079 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCDC102BQ68D86 ARHGEF2-204ENST00000368315 1645 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCDC102BQ68D86 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCDC102BQ68D86 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
CCDC102BQ68D86 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCDC102BQ68D86 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCDC102BQ68D86 NFIB-201ENST00000380921 1274 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCDC102BQ68D86 MEF2B-202ENST00000409447 1297 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCDC102BQ68D86 PHGR1-201ENST00000448599 436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCDC102BQ68D86 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCDC102BQ68D86 TBCB-205ENST00000585746 875 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCDC102BQ68D86 AL513523.2-201ENST00000633218 660 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCDC102BQ68D86 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCDC102BQ68D86 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCDC102BQ68D86 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCDC102BQ68D86 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCDC102BQ68D86 NFATC4-228ENST00000556759 2025 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCDC102BQ68D86 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCDC102BQ68D86 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCDC102BQ68D86 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCDC102BQ68D86 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCDC102BQ68D86 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCDC102BQ68D86 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCDC102BQ68D86 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCDC102BQ68D86 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCDC102BQ68D86 DDT-202ENST00000398344 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCDC102BQ68D86 CST3-202ENST00000398409 832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCDC102BQ68D86 DDT-203ENST00000403754 569 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCDC102BQ68D86 IGHV3-47-201ENST00000425060 335 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
CCDC102BQ68D86 DDT-206ENST00000430101 573 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCDC102BQ68D86 XYLT2-203ENST00000507602 2107 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCDC102BQ68D86 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCDC102BQ68D86 AC074051.2-201ENST00000565115 352 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
CCDC102BQ68D86 ANAPC11-204ENST00000571024 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCDC102BQ68D86 ANAPC11-218ENST00000582222 523 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCDC102BQ68D86 C19orf25-204ENST00000586564 1265 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCDC102BQ68D86 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCDC102BQ68D86 AL353801.3-201ENST00000609898 542 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
CCDC102BQ68D86 IRF5-214ENST00000613821 595 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCDC102BQ68D86 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCDC102BQ68D86 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCDC102BQ68D86 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCDC102BQ68D86 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCDC102BQ68D86 AC120498.9-201ENST00000339021 3867 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
CCDC102BQ68D86 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCDC102BQ68D86 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCDC102BQ68D86 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCDC102BQ68D86 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCDC102BQ68D86 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCDC102BQ68D86 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCDC102BQ68D86 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCDC102BQ68D86 CIAO1-203ENST00000488633 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCDC102BQ68D86 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCDC102BQ68D86 PDLIM2-206ENST00000409141 1463 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.9 ms