Protein–RNA interactions for Protein: Q59H18

TNNI3K, Serine/threonine-protein kinase TNNI3K, humanhuman

Predictions only

Length 835 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNNI3KQ59H18 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TNNI3KQ59H18 APBB1-215ENST00000608394 2128 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TNNI3KQ59H18 APBB1-222ENST00000610474 2147 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TNNI3KQ59H18 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TNNI3KQ59H18 CLN8-211ENST00000636934 1790 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TNNI3KQ59H18 PRELID3A-203ENST00000587735 1694 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TNNI3KQ59H18 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TNNI3KQ59H18 CHCHD2P8-201ENST00000429873 447 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
TNNI3KQ59H18 ATP5G2P1-201ENST00000433580 426 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
TNNI3KQ59H18 DYDC2-206ENST00000444807 1173 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TNNI3KQ59H18 ANAPC11-217ENST00000579978 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TNNI3KQ59H18 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TNNI3KQ59H18 AP003774.1-201ENST00000316124 2340 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TNNI3KQ59H18 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TNNI3KQ59H18 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TNNI3KQ59H18 GBGT1-208ENST00000540636 1934 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TNNI3KQ59H18 KCNQ2-205ENST00000360480 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TNNI3KQ59H18 BANP-202ENST00000355022 2164 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TNNI3KQ59H18 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TNNI3KQ59H18 AC093677.2-201ENST00000600169 1863 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
TNNI3KQ59H18 CRYL1-202ENST00000382812 1581 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TNNI3KQ59H18 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TNNI3KQ59H18 ZCWPW1-201ENST00000360951 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TNNI3KQ59H18 SOD2-206ENST00000452684 2045 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TNNI3KQ59H18 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TNNI3KQ59H18 RBFADN-201ENST00000562391 1350 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TNNI3KQ59H18 ATP5J-203ENST00000400090 647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TNNI3KQ59H18 MIR3180-1-201ENST00000580374 94 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
TNNI3KQ59H18 MIR3180-3-201ENST00000584616 94 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
TNNI3KQ59H18 TXNDC12-205ENST00000610127 806 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TNNI3KQ59H18 ARHGEF2-204ENST00000368315 1645 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TNNI3KQ59H18 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
TNNI3KQ59H18 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TNNI3KQ59H18 TADA3-202ENST00000343450 2554 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TNNI3KQ59H18 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TNNI3KQ59H18 SHBG-201ENST00000340624 1311 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TNNI3KQ59H18 SEPT8-216ENST00000620483 4335 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TNNI3KQ59H18 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TNNI3KQ59H18 TBC1D3I-202ENST00000618620 1900 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TNNI3KQ59H18 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TNNI3KQ59H18 GPANK1-204ENST00000375900 1814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TNNI3KQ59H18 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TNNI3KQ59H18 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TNNI3KQ59H18 AC008687.8-201ENST00000599795 1748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TNNI3KQ59H18 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TNNI3KQ59H18 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TNNI3KQ59H18 AC135776.1-201ENST00000319817 2481 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
TNNI3KQ59H18 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TNNI3KQ59H18 KIRREL3-AS3-201ENST00000404882 831 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
TNNI3KQ59H18 MEAF6-205ENST00000448519 666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TNNI3KQ59H18 MIR3936HG-202ENST00000457998 733 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TNNI3KQ59H18 AL161669.1-201ENST00000559843 386 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TNNI3KQ59H18 CHRNB1-207ENST00000575379 1095 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TNNI3KQ59H18 GXYLT1P4-201ENST00000613576 1192 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
TNNI3KQ59H18 MAFF-207ENST00000538999 2365 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TNNI3KQ59H18 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TNNI3KQ59H18 CLK1-205ENST00000434813 2026 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TNNI3KQ59H18 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TNNI3KQ59H18 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TNNI3KQ59H18 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TNNI3KQ59H18 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TNNI3KQ59H18 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TNNI3KQ59H18 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TNNI3KQ59H18 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TNNI3KQ59H18 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
TNNI3KQ59H18 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TNNI3KQ59H18 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TNNI3KQ59H18 RGS20-203ENST00000344277 1667 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TNNI3KQ59H18 SPEG-204ENST00000396689 1274 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TNNI3KQ59H18 LAMTOR4-205ENST00000468582 621 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
TNNI3KQ59H18 RN7SL606P-201ENST00000472779 293 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
TNNI3KQ59H18 MTG1-205ENST00000477902 1283 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
TNNI3KQ59H18 AC073111.4-202ENST00000486297 585 ntTSL 4 BASIC22.28■■□□□ 1.16
TNNI3KQ59H18 RBM14-RBM4-203ENST00000500635 829 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
TNNI3KQ59H18 FOXP3-205ENST00000518685 1213 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TNNI3KQ59H18 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TNNI3KQ59H18 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TNNI3KQ59H18 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TNNI3KQ59H18 TOP1MT-218ENST00000523676 1982 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
TNNI3KQ59H18 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TNNI3KQ59H18 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
TNNI3KQ59H18 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
TNNI3KQ59H18 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
TNNI3KQ59H18 FAM131A-202ENST00000340957 2421 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TNNI3KQ59H18 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
TNNI3KQ59H18 AC105285.1-202ENST00000499322 1866 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TNNI3KQ59H18 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TNNI3KQ59H18 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
TNNI3KQ59H18 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TNNI3KQ59H18 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TNNI3KQ59H18 AC132938.6-201ENST00000623828 1655 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
TNNI3KQ59H18 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
TNNI3KQ59H18 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TNNI3KQ59H18 EFCAB2-203ENST00000366523 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
TNNI3KQ59H18 AC004080.2-201ENST00000523331 556 ntTSL 4 BASIC22.27■■□□□ 1.16
TNNI3KQ59H18 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TNNI3KQ59H18 METTL23-204ENST00000586752 904 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
TNNI3KQ59H18 AP002414.4-201ENST00000589764 1148 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
TNNI3KQ59H18 LONP1-215ENST00000593119 2918 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
TNNI3KQ59H18 LCE1C-202ENST00000607093 644 ntAPPRIS P2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.3 ms