Protein–RNA interactions for Protein: Q587J7

TDRD12, Putative ATP-dependent RNA helicase TDRD12, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,177 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TDRD12Q587J7 PNLDC1-207ENST00000610273 1940 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
TDRD12Q587J7 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
TDRD12Q587J7 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
TDRD12Q587J7 AC091153.3-201ENST00000497885 472 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
TDRD12Q587J7 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC19.85■□□□□ 0.77
TDRD12Q587J7 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC19.85■□□□□ 0.77
TDRD12Q587J7 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.85■□□□□ 0.77
TDRD12Q587J7 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC19.85■□□□□ 0.77
TDRD12Q587J7 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
TDRD12Q587J7 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
TDRD12Q587J7 SGSM2-202ENST00000426855 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
TDRD12Q587J7 PLA2G12A-201ENST00000243501 5226 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
TDRD12Q587J7 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
TDRD12Q587J7 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
TDRD12Q587J7 TSLP-203ENST00000420978 2621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
TDRD12Q587J7 SPC24-206ENST00000592540 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
TDRD12Q587J7 AMDHD2-203ENST00000413459 2049 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
TDRD12Q587J7 PNPO-201ENST00000225573 2256 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
TDRD12Q587J7 FOXO3-202ENST00000406360 7341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
TDRD12Q587J7 PPRC1-201ENST00000278070 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
TDRD12Q587J7 RABL6-201ENST00000311502 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
TDRD12Q587J7 AC134043.2-201ENST00000624206 2238 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
TDRD12Q587J7 CCDC120-204ENST00000597275 2752 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
TDRD12Q587J7 ZSWIM8-223ENST00000605216 6004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
TDRD12Q587J7 DDX17-211ENST00000640332 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
TDRD12Q587J7 DDX17-212ENST00000640668 2196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
TDRD12Q587J7 AC034236.2-201ENST00000606662 1610 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
TDRD12Q587J7 DDX31-201ENST00000310532 2408 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
TDRD12Q587J7 ZNF500-202ENST00000545009 2440 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
TDRD12Q587J7 WSCD1-209ENST00000574232 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
TDRD12Q587J7 ZNF416-201ENST00000196489 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
TDRD12Q587J7 ANKRD6-201ENST00000339746 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
TDRD12Q587J7 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
TDRD12Q587J7 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
TDRD12Q587J7 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
TDRD12Q587J7 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC19.84■□□□□ 0.77
TDRD12Q587J7 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
TDRD12Q587J7 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
TDRD12Q587J7 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC19.84■□□□□ 0.77
TDRD12Q587J7 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
TDRD12Q587J7 GNA13-201ENST00000439174 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
TDRD12Q587J7 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
TDRD12Q587J7 AC090206.1-201ENST00000615734 1678 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
TDRD12Q587J7 REPS1-202ENST00000367663 2607 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
TDRD12Q587J7 TBX2-201ENST00000240328 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
TDRD12Q587J7 GABRB1-201ENST00000295454 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
TDRD12Q587J7 RHOBTB1-201ENST00000337910 4473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
TDRD12Q587J7 RIC8A-208ENST00000527696 2565 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
TDRD12Q587J7 CYP4F2-201ENST00000011989 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
TDRD12Q587J7 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
TDRD12Q587J7 AC005833.1-201ENST00000280684 4237 ntAPPRIS P1 BASIC19.83■□□□□ 0.77
TDRD12Q587J7 DDHD1-201ENST00000323669 5503 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
TDRD12Q587J7 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
TDRD12Q587J7 FHL1-205ENST00000370690 2441 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
TDRD12Q587J7 SH3BP4-202ENST00000392011 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
TDRD12Q587J7 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
TDRD12Q587J7 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
TDRD12Q587J7 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
TDRD12Q587J7 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC19.83■□□□□ 0.77
TDRD12Q587J7 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
TDRD12Q587J7 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC19.83■□□□□ 0.77
TDRD12Q587J7 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
TDRD12Q587J7 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC19.83■□□□□ 0.77
TDRD12Q587J7 ADAM23-201ENST00000264377 6330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
TDRD12Q587J7 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.76
TDRD12Q587J7 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
TDRD12Q587J7 OLFM2-203ENST00000590841 1665 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.76
TDRD12Q587J7 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
TDRD12Q587J7 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC19.83■□□□□ 0.76
TDRD12Q587J7 COL4A2-201ENST00000360467 6281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.76
TDRD12Q587J7 MED9-201ENST00000268711 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
TDRD12Q587J7 SLX1B-SULT1A4-201ENST00000344620 2424 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.76
TDRD12Q587J7 NEURL1B-201ENST00000369800 6424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
TDRD12Q587J7 ACOXL-205ENST00000439055 2373 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.76
TDRD12Q587J7 EIPR1-201ENST00000382125 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
TDRD12Q587J7 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
TDRD12Q587J7 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
TDRD12Q587J7 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
TDRD12Q587J7 GATAD2A-202ENST00000360315 5671 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
TDRD12Q587J7 XXYLT1-201ENST00000310380 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
TDRD12Q587J7 ADPGK-AS1-201ENST00000563592 2730 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
TDRD12Q587J7 PCDH7-206ENST00000543491 4457 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
TDRD12Q587J7 TTLL8-201ENST00000266182 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
TDRD12Q587J7 STX3-201ENST00000337979 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
TDRD12Q587J7 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
TDRD12Q587J7 KCNC2-203ENST00000393288 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
TDRD12Q587J7 NMRK1-203ENST00000376811 2050 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
TDRD12Q587J7 AC012615.6-201ENST00000593201 1697 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
TDRD12Q587J7 ENDOV-225ENST00000522751 1475 ntTSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
TDRD12Q587J7 SLC43A1-201ENST00000278426 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
TDRD12Q587J7 FO681492.1-201ENST00000623662 5321 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
TDRD12Q587J7 GPANK1-204ENST00000375900 1814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
TDRD12Q587J7 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
TDRD12Q587J7 SNCG-201ENST00000348795 684 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
TDRD12Q587J7 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
TDRD12Q587J7 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC19.82■□□□□ 0.76
TDRD12Q587J7 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
TDRD12Q587J7 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
TDRD12Q587J7 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC19.82■□□□□ 0.76
TDRD12Q587J7 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.4 ms