Protein–RNA interactions for Protein: Q56UQ5

TPT1-like protein, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q56UQ5 PLPPR4-202ENST00000370185 5369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Q56UQ5 MLEC-201ENST00000228506 6626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Q56UQ5 VAV1-204ENST00000596764 2775 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Q56UQ5 ATP6V1G2-205ENST00000303892 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Q56UQ5 ACTN4-201ENST00000252699 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Q56UQ5 PCDHA1-203ENST00000504120 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Q56UQ5 WASF1-202ENST00000359451 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Q56UQ5 TTLL12-201ENST00000216129 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Q56UQ5 DDHD1-202ENST00000357758 5603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Q56UQ5 CCNI2-201ENST00000378731 2355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Q56UQ5 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Q56UQ5 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Q56UQ5 AC126763.1-201ENST00000552015 2118 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Q56UQ5 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Q56UQ5 NUMBL-202ENST00000540131 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.07
Q56UQ5 NFYC-AS1-201ENST00000606277 1687 ntBASIC14.58□□□□□ -0.07
Q56UQ5 SQSTM1-202ENST00000389805 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Q56UQ5 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
Q56UQ5 CLN3-204ENST00000357857 1720 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.07
Q56UQ5 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Q56UQ5 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Q56UQ5 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Q56UQ5 GABBR1-205ENST00000377034 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Q56UQ5 NR2F1-201ENST00000327111 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Q56UQ5 ZNF200-202ENST00000396870 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Q56UQ5 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Q56UQ5 AC091153.3-201ENST00000497885 472 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Q56UQ5 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Q56UQ5 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Q56UQ5 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Q56UQ5 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Q56UQ5 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Q56UQ5 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Q56UQ5 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Q56UQ5 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Q56UQ5 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Q56UQ5 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Q56UQ5 GOLGA6L2-204ENST00000567107 3030 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Q56UQ5 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Q56UQ5 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Q56UQ5 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Q56UQ5 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Q56UQ5 ZNF74-201ENST00000357502 2788 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Q56UQ5 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Q56UQ5 ZNF420-201ENST00000304239 1945 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Q56UQ5 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Q56UQ5 LRRN4CL-201ENST00000317449 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Q56UQ5 MDGA2-202ENST00000399232 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Q56UQ5 HNF1A-202ENST00000400024 2337 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Q56UQ5 CLK1-205ENST00000434813 2026 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Q56UQ5 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Q56UQ5 AC139713.2-201ENST00000641328 2723 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Q56UQ5 PDE6B-202ENST00000429163 2120 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Q56UQ5 SBNO2-204ENST00000587024 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Q56UQ5 PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 2537 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Q56UQ5 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Q56UQ5 NOMO2-211ENST00000621364 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Q56UQ5 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Q56UQ5 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Q56UQ5 AC022916.1-201ENST00000590478 2658 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Q56UQ5 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Q56UQ5 MCMBP-201ENST00000360003 4169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Q56UQ5 MXRA8-209ENST00000477278 2728 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Q56UQ5 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Q56UQ5 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Q56UQ5 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Q56UQ5 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Q56UQ5 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Q56UQ5 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Q56UQ5 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Q56UQ5 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Q56UQ5 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Q56UQ5 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Q56UQ5 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Q56UQ5 SLCO6A1-201ENST00000379807 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Q56UQ5 UBR3-201ENST00000272793 8005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Q56UQ5 ANTXR1-201ENST00000303714 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Q56UQ5 ZBTB10-203ENST00000430430 10132 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Q56UQ5 C19orf54-203ENST00000470681 2521 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Q56UQ5 APLP2-210ENST00000528499 2530 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Q56UQ5 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Q56UQ5 RNF121-201ENST00000361756 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Q56UQ5 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Q56UQ5 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Q56UQ5 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Q56UQ5 SLC12A5-201ENST00000243964 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Q56UQ5 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Q56UQ5 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Q56UQ5 SAAL1-201ENST00000300013 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Q56UQ5 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Q56UQ5 XKR4-203ENST00000622811 3907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Q56UQ5 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Q56UQ5 MANSC1-202ENST00000535902 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Q56UQ5 PPP1R3G-201ENST00000405617 4907 ntAPPRIS P1 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Q56UQ5 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Q56UQ5 OVCH1-AS1-204ENST00000641955 5529 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Q56UQ5 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Q56UQ5 VHL-202ENST00000345392 2696 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Q56UQ5 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Q56UQ5 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
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