Protein–RNA interactions for Protein: Q502W7

CCDC38, Coiled-coil domain-containing protein 38, humanhuman

Predictions only

Length 563 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC38Q502W7 NEXN-AS1-201ENST00000421331 2292 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CCDC38Q502W7 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CCDC38Q502W7 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CCDC38Q502W7 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CCDC38Q502W7 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CCDC38Q502W7 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CCDC38Q502W7 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CCDC38Q502W7 TLCD1-202ENST00000394933 784 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CCDC38Q502W7 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CCDC38Q502W7 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CCDC38Q502W7 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
CCDC38Q502W7 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CCDC38Q502W7 AHRR-209ENST00000512529 1912 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CCDC38Q502W7 USP18-201ENST00000215794 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CCDC38Q502W7 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CCDC38Q502W7 DBN1-201ENST00000292385 3072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CCDC38Q502W7 BNIP2-213ENST00000612191 2515 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CCDC38Q502W7 SSC5D-202ENST00000587166 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CCDC38Q502W7 PNMA6E-201ENST00000445091 2192 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
CCDC38Q502W7 SAAL1-201ENST00000300013 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
CCDC38Q502W7 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CCDC38Q502W7 ZSWIM8-213ENST00000603114 5919 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
CCDC38Q502W7 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
CCDC38Q502W7 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
CCDC38Q502W7 RPS6KA3-201ENST00000379565 7918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CCDC38Q502W7 TRIM15-207ENST00000376694 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CCDC38Q502W7 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CCDC38Q502W7 STAMBPL1-203ENST00000371926 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CCDC38Q502W7 ST8SIA5-201ENST00000315087 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CCDC38Q502W7 GYG2P1-201ENST00000357871 623 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
CCDC38Q502W7 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
CCDC38Q502W7 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CCDC38Q502W7 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CCDC38Q502W7 AC008771.1-201ENST00000508000 1151 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
CCDC38Q502W7 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
CCDC38Q502W7 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
CCDC38Q502W7 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC19■□□□□ 0.63
CCDC38Q502W7 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
CCDC38Q502W7 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC19■□□□□ 0.63
CCDC38Q502W7 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CCDC38Q502W7 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
CCDC38Q502W7 CDK10-202ENST00000353379 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CCDC38Q502W7 PCBP4-210ENST00000471622 1784 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
CCDC38Q502W7 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
CCDC38Q502W7 KRT16P6-201ENST00000417510 1873 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
CCDC38Q502W7 MIB2-201ENST00000355826 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CCDC38Q502W7 TCF3-204ENST00000453954 3585 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
CCDC38Q502W7 FBXO33-201ENST00000298097 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CCDC38Q502W7 UBFD1-201ENST00000395878 5110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
CCDC38Q502W7 ADO-201ENST00000373783 3627 ntAPPRIS P1 BASIC19■□□□□ 0.63
CCDC38Q502W7 CDK11A-203ENST00000357760 2446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CCDC38Q502W7 CDK11A-204ENST00000358779 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CCDC38Q502W7 CDK11A-206ENST00000378638 2429 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
CCDC38Q502W7 CDK11A-208ENST00000404249 2449 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CCDC38Q502W7 FDXR-202ENST00000413947 1809 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
CCDC38Q502W7 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CCDC38Q502W7 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
CCDC38Q502W7 CHRD-202ENST00000348986 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CCDC38Q502W7 C6orf47-202ENST00000375911 2475 ntAPPRIS P1 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CCDC38Q502W7 SUZ12-204ENST00000580398 3977 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CCDC38Q502W7 ARNTL-205ENST00000403510 2745 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CCDC38Q502W7 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CCDC38Q502W7 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CCDC38Q502W7 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CCDC38Q502W7 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CCDC38Q502W7 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CCDC38Q502W7 AC003982.1-201ENST00000477404 484 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CCDC38Q502W7 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CCDC38Q502W7 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CCDC38Q502W7 WSCD1-209ENST00000574232 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CCDC38Q502W7 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
CCDC38Q502W7 POLR1D-220ENST00000637071 1943 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CCDC38Q502W7 ADCY9-201ENST00000294016 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CCDC38Q502W7 HR-201ENST00000312841 5351 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CCDC38Q502W7 SPTBN4-212ENST00000598249 8070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CCDC38Q502W7 MYZAP-201ENST00000267853 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CCDC38Q502W7 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CCDC38Q502W7 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CCDC38Q502W7 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CCDC38Q502W7 AC112777.1-201ENST00000540175 1423 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
CCDC38Q502W7 C1orf159-204ENST00000379339 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CCDC38Q502W7 THOP1-205ENST00000586677 1872 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CCDC38Q502W7 PTPDC1-202ENST00000375360 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CCDC38Q502W7 EFCAB14-201ENST00000371933 5767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CCDC38Q502W7 CLIC6-201ENST00000349499 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CCDC38Q502W7 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CCDC38Q502W7 PRR29-AS1-202ENST00000580942 2926 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CCDC38Q502W7 KLHL21-202ENST00000377663 6445 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CCDC38Q502W7 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
CCDC38Q502W7 CLSTN1-202ENST00000377298 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CCDC38Q502W7 AP001273.2-201ENST00000638767 2993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CCDC38Q502W7 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CCDC38Q502W7 ITGA8-201ENST00000378076 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CCDC38Q502W7 MOAP1-201ENST00000298894 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CCDC38Q502W7 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CCDC38Q502W7 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CCDC38Q502W7 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CCDC38Q502W7 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CCDC38Q502W7 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CCDC38Q502W7 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.4 ms