Protein–RNA interactions for Protein: Q4ZIN3

TMEM259, Membralin, humanhuman

Predictions only

Length 620 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM259Q4ZIN3 CDK11B-209ENST00000629312 2496 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
TMEM259Q4ZIN3 RPS6KA1-204ENST00000374168 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
TMEM259Q4ZIN3 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
TMEM259Q4ZIN3 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
TMEM259Q4ZIN3 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
TMEM259Q4ZIN3 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
TMEM259Q4ZIN3 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
TMEM259Q4ZIN3 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
TMEM259Q4ZIN3 AANAT-202ENST00000392492 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
TMEM259Q4ZIN3 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC18.65■□□□□ 0.58
TMEM259Q4ZIN3 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
TMEM259Q4ZIN3 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
TMEM259Q4ZIN3 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
TMEM259Q4ZIN3 PDZD7-203ENST00000470414 1057 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
TMEM259Q4ZIN3 NMU-205ENST00000511469 756 ntTSL 3 BASIC18.65■□□□□ 0.58
TMEM259Q4ZIN3 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC18.65■□□□□ 0.58
TMEM259Q4ZIN3 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC18.65■□□□□ 0.58
TMEM259Q4ZIN3 FXYD7-203ENST00000586063 456 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.65■□□□□ 0.58
TMEM259Q4ZIN3 DAG1-220ENST00000539901 5665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
TMEM259Q4ZIN3 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
TMEM259Q4ZIN3 ZNF385A-202ENST00000352268 2076 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
TMEM259Q4ZIN3 AKIRIN1-201ENST00000372984 1330 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
TMEM259Q4ZIN3 ICA1-206ENST00000402384 2458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
TMEM259Q4ZIN3 MCU-201ENST00000357157 2874 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
TMEM259Q4ZIN3 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
TMEM259Q4ZIN3 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
TMEM259Q4ZIN3 CLDN5-202ENST00000406028 2548 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
TMEM259Q4ZIN3 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
TMEM259Q4ZIN3 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
TMEM259Q4ZIN3 ACY1-206ENST00000476351 1409 ntTSL 3 BASIC18.65■□□□□ 0.58
TMEM259Q4ZIN3 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
TMEM259Q4ZIN3 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
TMEM259Q4ZIN3 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.58
TMEM259Q4ZIN3 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
TMEM259Q4ZIN3 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
TMEM259Q4ZIN3 AAED1-201ENST00000375234 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
TMEM259Q4ZIN3 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
TMEM259Q4ZIN3 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
TMEM259Q4ZIN3 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC18.64■□□□□ 0.57
TMEM259Q4ZIN3 NOMO3-201ENST00000263012 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
TMEM259Q4ZIN3 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
TMEM259Q4ZIN3 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
TMEM259Q4ZIN3 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
TMEM259Q4ZIN3 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
TMEM259Q4ZIN3 DTX2-211ENST00000446600 2281 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
TMEM259Q4ZIN3 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
TMEM259Q4ZIN3 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
TMEM259Q4ZIN3 NMRK1-202ENST00000376808 1121 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
TMEM259Q4ZIN3 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC18.64■□□□□ 0.57
TMEM259Q4ZIN3 KLHL21-204ENST00000467612 1056 ntTSL 3 BASIC18.64■□□□□ 0.57
TMEM259Q4ZIN3 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
TMEM259Q4ZIN3 RAB6A-207ENST00000541588 758 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
TMEM259Q4ZIN3 FAM90A1-201ENST00000307435 2342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
TMEM259Q4ZIN3 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
TMEM259Q4ZIN3 DOC2B-203ENST00000613549 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
TMEM259Q4ZIN3 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
TMEM259Q4ZIN3 MMAB-204ENST00000537236 1342 ntTSL 3 BASIC18.64■□□□□ 0.57
TMEM259Q4ZIN3 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
TMEM259Q4ZIN3 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
TMEM259Q4ZIN3 CCNJL-203ENST00000393977 3320 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
TMEM259Q4ZIN3 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
TMEM259Q4ZIN3 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
TMEM259Q4ZIN3 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
TMEM259Q4ZIN3 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
TMEM259Q4ZIN3 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
TMEM259Q4ZIN3 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
TMEM259Q4ZIN3 PLA2R1-202ENST00000392771 5160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
TMEM259Q4ZIN3 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
TMEM259Q4ZIN3 PHF20L1-209ENST00000395386 6237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
TMEM259Q4ZIN3 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
TMEM259Q4ZIN3 NSMAF-202ENST00000427130 3371 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
TMEM259Q4ZIN3 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
TMEM259Q4ZIN3 SPAST-202ENST00000345662 5116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
TMEM259Q4ZIN3 CCDC120-204ENST00000597275 2752 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
TMEM259Q4ZIN3 PXMP4-201ENST00000217398 979 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
TMEM259Q4ZIN3 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
TMEM259Q4ZIN3 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
TMEM259Q4ZIN3 TAP1-201ENST00000354258 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
TMEM259Q4ZIN3 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
TMEM259Q4ZIN3 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
TMEM259Q4ZIN3 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
TMEM259Q4ZIN3 AL807752.6-202ENST00000622933 765 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
TMEM259Q4ZIN3 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
TMEM259Q4ZIN3 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
TMEM259Q4ZIN3 FIGNL2-202ENST00000618634 4812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
TMEM259Q4ZIN3 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
TMEM259Q4ZIN3 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
TMEM259Q4ZIN3 GRIN3B-201ENST00000234389 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
TMEM259Q4ZIN3 THAP12-201ENST00000260045 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
TMEM259Q4ZIN3 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
TMEM259Q4ZIN3 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
TMEM259Q4ZIN3 NOTCH3-201ENST00000263388 8666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
TMEM259Q4ZIN3 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
TMEM259Q4ZIN3 CPEB3-203ENST00000614585 5789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
TMEM259Q4ZIN3 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
TMEM259Q4ZIN3 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
TMEM259Q4ZIN3 HNRNPD-201ENST00000313899 3033 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
TMEM259Q4ZIN3 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
TMEM259Q4ZIN3 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
TMEM259Q4ZIN3 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.8 ms