Protein–RNA interactions for Protein: Q4LDR2

CTXN3, Cortexin-3, humanhuman

Predictions only

Length 81 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTXN3Q4LDR2 STX8-201ENST00000306357 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
CTXN3Q4LDR2 NPFFR2-202ENST00000344413 1234 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
CTXN3Q4LDR2 MINOS1P3-201ENST00000457048 203 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
CTXN3Q4LDR2 EMBP1-201ENST00000458200 901 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
CTXN3Q4LDR2 POLR2M-203ENST00000464277 910 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
CTXN3Q4LDR2 RPP14-206ENST00000466547 805 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.34■□□□□ 0.69
CTXN3Q4LDR2 RBM14-RBM4-203ENST00000500635 829 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
CTXN3Q4LDR2 ENDOV-205ENST00000518644 625 ntTSL 4 BASIC19.34■□□□□ 0.69
CTXN3Q4LDR2 AC007220.1-201ENST00000572466 1055 ntTSL 3 BASIC19.34■□□□□ 0.69
CTXN3Q4LDR2 MIF4GD-205ENST00000578305 569 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
CTXN3Q4LDR2 AC012366.1-201ENST00000615411 473 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
CTXN3Q4LDR2 AL162497.1-201ENST00000615635 518 ntTSL 4 BASIC19.34■□□□□ 0.69
CTXN3Q4LDR2 ANKRD20A8P-203ENST00000641373 517 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
CTXN3Q4LDR2 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
CTXN3Q4LDR2 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
CTXN3Q4LDR2 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
CTXN3Q4LDR2 TSR2-201ENST00000375151 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
CTXN3Q4LDR2 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
CTXN3Q4LDR2 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
CTXN3Q4LDR2 OSTM1-201ENST00000193322 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
CTXN3Q4LDR2 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.69
CTXN3Q4LDR2 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
CTXN3Q4LDR2 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
CTXN3Q4LDR2 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
CTXN3Q4LDR2 UBE2I-207ENST00000406620 1842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.69
CTXN3Q4LDR2 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
CTXN3Q4LDR2 MYO9A-214ENST00000566885 5111 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
CTXN3Q4LDR2 CCDC134-201ENST00000255784 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
CTXN3Q4LDR2 BOLA1-201ENST00000369150 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.33■□□□□ 0.68
CTXN3Q4LDR2 BEX4-201ENST00000372691 1066 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
CTXN3Q4LDR2 SEC61G-203ENST00000415949 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
CTXN3Q4LDR2 SBDSP1-202ENST00000423945 618 ntTSL 3 BASIC19.33■□□□□ 0.68
CTXN3Q4LDR2 AC093459.1-201ENST00000444567 481 ntTSL 3 BASIC19.33■□□□□ 0.68
CTXN3Q4LDR2 AL611929.1-201ENST00000457340 449 ntTSL 3 BASIC19.33■□□□□ 0.68
CTXN3Q4LDR2 BET1L-206ENST00000486280 665 ntTSL 3 BASIC19.33■□□□□ 0.68
CTXN3Q4LDR2 AC135586.2-201ENST00000537262 567 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.33■□□□□ 0.68
CTXN3Q4LDR2 BCL2L12-210ENST00000611631 1259 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
CTXN3Q4LDR2 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
CTXN3Q4LDR2 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
CTXN3Q4LDR2 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
CTXN3Q4LDR2 ARHGEF2-204ENST00000368315 1645 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
CTXN3Q4LDR2 DHRS4L2-201ENST00000335125 1370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CTXN3Q4LDR2 CSF3-206ENST00000577675 1360 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CTXN3Q4LDR2 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
CTXN3Q4LDR2 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CTXN3Q4LDR2 CCT6P1-202ENST00000442266 1317 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
CTXN3Q4LDR2 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
CTXN3Q4LDR2 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CTXN3Q4LDR2 NIFK-201ENST00000285814 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CTXN3Q4LDR2 TPM1-203ENST00000317516 738 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CTXN3Q4LDR2 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CTXN3Q4LDR2 CMTM1-204ENST00000336328 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CTXN3Q4LDR2 S100A3-201ENST00000368712 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
CTXN3Q4LDR2 HYI-201ENST00000372425 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CTXN3Q4LDR2 CDKN1C-201ENST00000380725 1220 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
CTXN3Q4LDR2 MIR3936HG-202ENST00000457998 733 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
CTXN3Q4LDR2 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CTXN3Q4LDR2 CMTM1-213ENST00000529506 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CTXN3Q4LDR2 AP003555.3-201ENST00000534086 432 ntTSL 4 BASIC19.32■□□□□ 0.68
CTXN3Q4LDR2 TPM1-218ENST00000559281 851 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
CTXN3Q4LDR2 KLK8-205ENST00000593490 267 ntTSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
CTXN3Q4LDR2 PLAUR-214ENST00000601723 1205 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CTXN3Q4LDR2 EML2-AS1-203ENST00000623430 886 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CTXN3Q4LDR2 NUDT4-202ENST00000415493 4839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CTXN3Q4LDR2 SAMD11-216ENST00000620200 1874 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
CTXN3Q4LDR2 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CTXN3Q4LDR2 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CTXN3Q4LDR2 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CTXN3Q4LDR2 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
CTXN3Q4LDR2 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
CTXN3Q4LDR2 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CTXN3Q4LDR2 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CTXN3Q4LDR2 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CTXN3Q4LDR2 NDN-201ENST00000331837 1931 ntAPPRIS P1 BASIC19.31■□□□□ 0.68
CTXN3Q4LDR2 RGS3-231ENST00000613049 1726 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CTXN3Q4LDR2 LUC7L-221ENST00000629543 1520 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
CTXN3Q4LDR2 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CTXN3Q4LDR2 OARD1-202ENST00000424266 1337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
CTXN3Q4LDR2 DLK1-202ENST00000341267 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CTXN3Q4LDR2 NMRK1-203ENST00000376811 2050 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
CTXN3Q4LDR2 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CTXN3Q4LDR2 NUS1P2-201ENST00000417358 873 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
CTXN3Q4LDR2 AL591212.1-201ENST00000433646 615 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
CTXN3Q4LDR2 CDV3-207ENST00000508481 661 ntTSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
CTXN3Q4LDR2 FICD-205ENST00000552758 603 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
CTXN3Q4LDR2 CTDNEP1-207ENST00000572043 857 ntTSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
CTXN3Q4LDR2 EMB-204ENST00000508934 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
CTXN3Q4LDR2 BAIAP2-203ENST00000416299 1442 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
CTXN3Q4LDR2 GSDMD-201ENST00000262580 1762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CTXN3Q4LDR2 TMEM177-204ENST00000424086 1738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
CTXN3Q4LDR2 SEPT9-211ENST00000585930 1387 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
CTXN3Q4LDR2 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CTXN3Q4LDR2 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
CTXN3Q4LDR2 ASZ1-201ENST00000284629 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CTXN3Q4LDR2 CHRNA4-207ENST00000615287 5643 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
CTXN3Q4LDR2 CELF6-204ENST00000543764 1676 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CTXN3Q4LDR2 KLF6-204ENST00000469435 2169 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CTXN3Q4LDR2 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CTXN3Q4LDR2 TLE3-226ENST00000627388 5742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CTXN3Q4LDR2 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29 ms