Protein–RNA interactions for Protein: Q4KMQ1

TPRN, Taperin, humanhuman

Predictions only

Length 711 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TPRNQ4KMQ1 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
TPRNQ4KMQ1 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC21.59■■□□□ 1.05
TPRNQ4KMQ1 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
TPRNQ4KMQ1 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TPRNQ4KMQ1 PPP3CA-201ENST00000323055 4519 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TPRNQ4KMQ1 CAPN1-201ENST00000279247 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TPRNQ4KMQ1 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TPRNQ4KMQ1 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
TPRNQ4KMQ1 SALL3-202ENST00000537592 6555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
TPRNQ4KMQ1 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
TPRNQ4KMQ1 TP73-AS1-203ENST00000423764 2875 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
TPRNQ4KMQ1 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
TPRNQ4KMQ1 AC008969.1-201ENST00000550135 6438 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
TPRNQ4KMQ1 AHR-201ENST00000242057 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
TPRNQ4KMQ1 CDH24-204ENST00000487137 3438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
TPRNQ4KMQ1 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
TPRNQ4KMQ1 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
TPRNQ4KMQ1 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
TPRNQ4KMQ1 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
TPRNQ4KMQ1 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
TPRNQ4KMQ1 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
TPRNQ4KMQ1 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
TPRNQ4KMQ1 ZNF697-201ENST00000421812 5041 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.04
TPRNQ4KMQ1 CCT4-204ENST00000544079 2261 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
TPRNQ4KMQ1 PRR29-AS1-202ENST00000580942 2926 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
TPRNQ4KMQ1 ZBTB16-201ENST00000335953 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
TPRNQ4KMQ1 MAP4K3-202ENST00000341681 4271 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
TPRNQ4KMQ1 PARD3B-206ENST00000462231 2968 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TPRNQ4KMQ1 SCRIB-203ENST00000377533 5108 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TPRNQ4KMQ1 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TPRNQ4KMQ1 MAP7-209ENST00000618822 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
TPRNQ4KMQ1 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
TPRNQ4KMQ1 AP000997.3-201ENST00000623333 2250 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
TPRNQ4KMQ1 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
TPRNQ4KMQ1 IL27RA-201ENST00000263379 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TPRNQ4KMQ1 KAZN-201ENST00000361144 3838 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TPRNQ4KMQ1 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TPRNQ4KMQ1 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
TPRNQ4KMQ1 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
TPRNQ4KMQ1 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC21.57■■□□□ 1.04
TPRNQ4KMQ1 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
TPRNQ4KMQ1 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
TPRNQ4KMQ1 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
TPRNQ4KMQ1 PCBP3-205ENST00000400310 2168 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
TPRNQ4KMQ1 TJP3-201ENST00000539908 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
TPRNQ4KMQ1 RTKN-203ENST00000305557 2646 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
TPRNQ4KMQ1 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TPRNQ4KMQ1 ALDH16A1-201ENST00000293350 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TPRNQ4KMQ1 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TPRNQ4KMQ1 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TPRNQ4KMQ1 ELP5-214ENST00000574993 2209 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TPRNQ4KMQ1 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TPRNQ4KMQ1 MCM9-201ENST00000316068 2442 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TPRNQ4KMQ1 GAB1-201ENST00000262994 2648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TPRNQ4KMQ1 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
TPRNQ4KMQ1 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC21.56■■□□□ 1.04
TPRNQ4KMQ1 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TPRNQ4KMQ1 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
TPRNQ4KMQ1 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TPRNQ4KMQ1 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
TPRNQ4KMQ1 CBFB-203ENST00000561924 584 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
TPRNQ4KMQ1 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC21.56■■□□□ 1.04
TPRNQ4KMQ1 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TPRNQ4KMQ1 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
TPRNQ4KMQ1 FOXD4L1-201ENST00000306507 2491 ntAPPRIS P1 BASIC21.56■■□□□ 1.04
TPRNQ4KMQ1 ACYP2-203ENST00000406041 1913 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TPRNQ4KMQ1 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TPRNQ4KMQ1 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
TPRNQ4KMQ1 CACNA1A-221ENST00000636012 7500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
TPRNQ4KMQ1 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
TPRNQ4KMQ1 SETD3-202ENST00000331768 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TPRNQ4KMQ1 EIF2AK4-201ENST00000263791 5499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
TPRNQ4KMQ1 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
TPRNQ4KMQ1 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TPRNQ4KMQ1 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TPRNQ4KMQ1 PRRT2-212ENST00000636619 2065 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
TPRNQ4KMQ1 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TPRNQ4KMQ1 SLC22A3-201ENST00000275300 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TPRNQ4KMQ1 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TPRNQ4KMQ1 XRCC3-201ENST00000352127 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TPRNQ4KMQ1 ESYT2-206ENST00000613624 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
TPRNQ4KMQ1 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TPRNQ4KMQ1 HOTAIR-201ENST00000424518 2421 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
TPRNQ4KMQ1 GOLGA2P7-201ENST00000316967 2525 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
TPRNQ4KMQ1 C19orf54-203ENST00000470681 2521 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
TPRNQ4KMQ1 NSFL1C-206ENST00000476071 2800 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
TPRNQ4KMQ1 ZNF500-201ENST00000219478 5880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
TPRNQ4KMQ1 CCDC62-201ENST00000253079 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TPRNQ4KMQ1 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
TPRNQ4KMQ1 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
TPRNQ4KMQ1 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
TPRNQ4KMQ1 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
TPRNQ4KMQ1 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TPRNQ4KMQ1 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
TPRNQ4KMQ1 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
TPRNQ4KMQ1 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TPRNQ4KMQ1 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
TPRNQ4KMQ1 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
TPRNQ4KMQ1 ATP6V1G2-205ENST00000303892 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TPRNQ4KMQ1 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
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