Protein–RNA interactions for Protein: Q3SXZ7

TTLL9, Probable tubulin polyglutamylase TTLL9, humanhuman

Predictions only

Length 439 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTLL9Q3SXZ7 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
TTLL9Q3SXZ7 CASKIN2-205ENST00000581870 1612 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
TTLL9Q3SXZ7 ANKRD17-211ENST00000639793 3486 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
TTLL9Q3SXZ7 NMRK1-203ENST00000376811 2050 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
TTLL9Q3SXZ7 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
TTLL9Q3SXZ7 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
TTLL9Q3SXZ7 PCCA-203ENST00000376286 2481 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
TTLL9Q3SXZ7 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
TTLL9Q3SXZ7 WIPI1-202ENST00000546360 1575 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
TTLL9Q3SXZ7 MRAS-204ENST00000464896 1534 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
TTLL9Q3SXZ7 LUC7L-221ENST00000629543 1520 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
TTLL9Q3SXZ7 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TTLL9Q3SXZ7 TBC1D10C-201ENST00000312390 1497 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TTLL9Q3SXZ7 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TTLL9Q3SXZ7 MATN4-203ENST00000372754 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TTLL9Q3SXZ7 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TTLL9Q3SXZ7 CLEC10A-201ENST00000254868 1797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TTLL9Q3SXZ7 MAGI3-201ENST00000307546 6430 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TTLL9Q3SXZ7 RRN3-205ENST00000563559 2128 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TTLL9Q3SXZ7 SERPINE2-206ENST00000447280 1716 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TTLL9Q3SXZ7 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TTLL9Q3SXZ7 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TTLL9Q3SXZ7 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TTLL9Q3SXZ7 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TTLL9Q3SXZ7 SDHAP2-201ENST00000455183 2001 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
TTLL9Q3SXZ7 PRELID3A-209ENST00000592149 2001 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TTLL9Q3SXZ7 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
TTLL9Q3SXZ7 EHMT1-211ENST00000482340 691 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TTLL9Q3SXZ7 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TTLL9Q3SXZ7 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TTLL9Q3SXZ7 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TTLL9Q3SXZ7 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
TTLL9Q3SXZ7 AC141257.4-201ENST00000634557 245 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
TTLL9Q3SXZ7 AC136944.6-201ENST00000634818 245 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
TTLL9Q3SXZ7 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
TTLL9Q3SXZ7 EHMT1-204ENST00000462484 2707 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TTLL9Q3SXZ7 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TTLL9Q3SXZ7 RIMS4-201ENST00000372851 5203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TTLL9Q3SXZ7 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TTLL9Q3SXZ7 TMEM110-201ENST00000355083 4769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TTLL9Q3SXZ7 PDLIM7-203ENST00000359895 1567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TTLL9Q3SXZ7 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TTLL9Q3SXZ7 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TTLL9Q3SXZ7 CHD1L-204ENST00000431239 2907 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TTLL9Q3SXZ7 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TTLL9Q3SXZ7 MTSS1L-204ENST00000616026 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TTLL9Q3SXZ7 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TTLL9Q3SXZ7 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TTLL9Q3SXZ7 GPANK1-204ENST00000375900 1814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TTLL9Q3SXZ7 TMPRSS12-201ENST00000398458 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TTLL9Q3SXZ7 TTC22-201ENST00000371274 2149 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TTLL9Q3SXZ7 ARHGEF28-214ENST00000545377 6351 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TTLL9Q3SXZ7 UBL3-201ENST00000380680 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TTLL9Q3SXZ7 PRODH-205ENST00000420436 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
TTLL9Q3SXZ7 HEXB-207ENST00000511181 2021 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TTLL9Q3SXZ7 ACAP3-202ENST00000354700 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TTLL9Q3SXZ7 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TTLL9Q3SXZ7 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TTLL9Q3SXZ7 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TTLL9Q3SXZ7 APLP2-210ENST00000528499 2530 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TTLL9Q3SXZ7 CACNA2D2-201ENST00000266039 5476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TTLL9Q3SXZ7 SLBP-201ENST00000318386 1635 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
TTLL9Q3SXZ7 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TTLL9Q3SXZ7 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
TTLL9Q3SXZ7 PHF12-205ENST00000577226 7679 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TTLL9Q3SXZ7 RALGAPA1-219ENST00000637992 8512 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
TTLL9Q3SXZ7 DNM1-211ENST00000627061 2724 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
TTLL9Q3SXZ7 UROS-202ENST00000368778 1556 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
TTLL9Q3SXZ7 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TTLL9Q3SXZ7 OCIAD2-201ENST00000273860 636 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TTLL9Q3SXZ7 ROMO1-202ENST00000374072 350 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
TTLL9Q3SXZ7 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
TTLL9Q3SXZ7 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TTLL9Q3SXZ7 AC007563.2-201ENST00000447289 552 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
TTLL9Q3SXZ7 MAP3K13-213ENST00000454237 526 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
TTLL9Q3SXZ7 SLC9A3R2-208ENST00000566198 1199 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
TTLL9Q3SXZ7 OCIAD2-210ENST00000620187 697 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
TTLL9Q3SXZ7 WDSUB1-203ENST00000392796 1812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
TTLL9Q3SXZ7 FOXI3-201ENST00000428390 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
TTLL9Q3SXZ7 GSEC-201ENST00000626810 2289 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
TTLL9Q3SXZ7 DHRS2-201ENST00000250383 1705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TTLL9Q3SXZ7 NIFK-201ENST00000285814 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TTLL9Q3SXZ7 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
TTLL9Q3SXZ7 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TTLL9Q3SXZ7 TMEM206-201ENST00000261455 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TTLL9Q3SXZ7 RBM24-202ENST00000379052 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TTLL9Q3SXZ7 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
TTLL9Q3SXZ7 RGS20-203ENST00000344277 1667 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TTLL9Q3SXZ7 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TTLL9Q3SXZ7 PIF1-205ENST00000559239 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TTLL9Q3SXZ7 FIGNL2-202ENST00000618634 4812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
TTLL9Q3SXZ7 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TTLL9Q3SXZ7 RBM7-201ENST00000375490 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TTLL9Q3SXZ7 C8orf58-207ENST00000615223 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
TTLL9Q3SXZ7 PHRF1-205ENST00000533464 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TTLL9Q3SXZ7 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TTLL9Q3SXZ7 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TTLL9Q3SXZ7 YAP1-209ENST00000537274 5350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
TTLL9Q3SXZ7 ESPNP-201ENST00000270691 2015 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
TTLL9Q3SXZ7 CDK10-202ENST00000353379 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.2 ms