Protein–RNA interactions for Protein: Q3KP44

ANKRD55, Ankyrin repeat domain-containing protein 55, humanhuman

Predictions only

Length 614 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD55Q3KP44 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ANKRD55Q3KP44 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ANKRD55Q3KP44 PPP1R7-202ENST00000272983 1954 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ANKRD55Q3KP44 SEMA6C-209ENST00000613223 1950 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ANKRD55Q3KP44 TACC3-201ENST00000313288 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ANKRD55Q3KP44 DAG1-201ENST00000308775 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ANKRD55Q3KP44 MRPL10-203ENST00000414011 1622 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ANKRD55Q3KP44 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ANKRD55Q3KP44 LPAR2-201ENST00000407877 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ANKRD55Q3KP44 CXorf67-201ENST00000342995 1929 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ANKRD55Q3KP44 RAB43-201ENST00000315150 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ANKRD55Q3KP44 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ANKRD55Q3KP44 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ANKRD55Q3KP44 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
ANKRD55Q3KP44 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ANKRD55Q3KP44 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
ANKRD55Q3KP44 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ANKRD55Q3KP44 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ANKRD55Q3KP44 PTPRA-205ENST00000399903 3337 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ANKRD55Q3KP44 CLYBL-203ENST00000376355 6771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ANKRD55Q3KP44 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ANKRD55Q3KP44 OSMR-202ENST00000502536 1740 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ANKRD55Q3KP44 BPGM-203ENST00000418040 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ANKRD55Q3KP44 ZSWIM8-213ENST00000603114 5919 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ANKRD55Q3KP44 ASIC2-201ENST00000225823 3443 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ANKRD55Q3KP44 GALNT17-201ENST00000333538 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ANKRD55Q3KP44 RAD1-202ENST00000341754 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ANKRD55Q3KP44 RSPH6A-201ENST00000221538 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ANKRD55Q3KP44 PJA1-201ENST00000361478 2755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ANKRD55Q3KP44 FAM120AOS-201ENST00000375412 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ANKRD55Q3KP44 SIPA1-209ENST00000534313 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ANKRD55Q3KP44 CEBPG-201ENST00000284000 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ANKRD55Q3KP44 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ANKRD55Q3KP44 SLC22A11-202ENST00000377581 1975 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ANKRD55Q3KP44 WWTR1-201ENST00000360632 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ANKRD55Q3KP44 FAM13C-204ENST00000468840 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ANKRD55Q3KP44 ADAMTSL5-201ENST00000330475 2857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ANKRD55Q3KP44 FBXO18-203ENST00000397269 3640 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ANKRD55Q3KP44 NOMO2-211ENST00000621364 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ANKRD55Q3KP44 MARVELD3-202ENST00000299952 2214 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
ANKRD55Q3KP44 PCGF6-202ENST00000369847 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ANKRD55Q3KP44 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ANKRD55Q3KP44 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
ANKRD55Q3KP44 MINOS1-NBL1-204ENST00000602662 1623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
ANKRD55Q3KP44 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
ANKRD55Q3KP44 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
ANKRD55Q3KP44 CCDC62-201ENST00000253079 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ANKRD55Q3KP44 AL731569.1-201ENST00000428940 3058 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
ANKRD55Q3KP44 GGA1-203ENST00000343632 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ANKRD55Q3KP44 KLHL21-202ENST00000377663 6445 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ANKRD55Q3KP44 ARHGEF28-212ENST00000513042 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
ANKRD55Q3KP44 MAP3K6-201ENST00000357582 4136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ANKRD55Q3KP44 KCNB1-203ENST00000635465 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ANKRD55Q3KP44 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ANKRD55Q3KP44 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
ANKRD55Q3KP44 MNT-208ENST00000575394 606 ntTSL 4 BASIC15.21■□□□□ 0.03
ANKRD55Q3KP44 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ANKRD55Q3KP44 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
ANKRD55Q3KP44 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
ANKRD55Q3KP44 RNPS1-205ENST00000561718 1806 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
ANKRD55Q3KP44 SLC29A2-206ENST00000546034 2509 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
ANKRD55Q3KP44 PLEKHM2-201ENST00000375793 4004 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
ANKRD55Q3KP44 L1CAM-205ENST00000370060 5113 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
ANKRD55Q3KP44 C5orf30-201ENST00000319933 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
ANKRD55Q3KP44 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
ANKRD55Q3KP44 HNRNPM-217ENST00000620401 2458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
ANKRD55Q3KP44 RBBP7-203ENST00000380087 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
ANKRD55Q3KP44 RIC8A-201ENST00000325207 2702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
ANKRD55Q3KP44 MFSD2A-201ENST00000372809 2173 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
ANKRD55Q3KP44 AP001094.4-201ENST00000579008 2176 ntBASIC15.21■□□□□ 0.02
ANKRD55Q3KP44 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
ANKRD55Q3KP44 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
ANKRD55Q3KP44 CCNYL1-201ENST00000295414 3767 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
ANKRD55Q3KP44 YARS2-201ENST00000324868 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ANKRD55Q3KP44 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ANKRD55Q3KP44 PCDHA8-202ENST00000531613 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ANKRD55Q3KP44 IL6R-202ENST00000368485 5914 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ANKRD55Q3KP44 HCK-210ENST00000629881 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ANKRD55Q3KP44 DDHD1-201ENST00000323669 5503 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ANKRD55Q3KP44 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ANKRD55Q3KP44 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ANKRD55Q3KP44 STRN4-204ENST00000539396 2608 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ANKRD55Q3KP44 GPANK1-202ENST00000375895 1800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ANKRD55Q3KP44 ENPP1-201ENST00000360971 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ANKRD55Q3KP44 ARHGEF28-214ENST00000545377 6351 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ANKRD55Q3KP44 BLCAP-201ENST00000373537 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ANKRD55Q3KP44 HHIPL1-201ENST00000330710 7390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ANKRD55Q3KP44 LENG8-202ENST00000376514 5146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ANKRD55Q3KP44 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ANKRD55Q3KP44 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ANKRD55Q3KP44 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ANKRD55Q3KP44 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ANKRD55Q3KP44 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ANKRD55Q3KP44 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
ANKRD55Q3KP44 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ANKRD55Q3KP44 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ANKRD55Q3KP44 UNC13A-206ENST00000552293 5314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ANKRD55Q3KP44 AC104809.2-201ENST00000418218 2274 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ANKRD55Q3KP44 COQ6-201ENST00000334571 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ANKRD55Q3KP44 MAFB-201ENST00000373313 3393 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.9 ms