Protein–RNA interactions for Protein: Q3B726

TWISTNB, DNA-directed RNA polymerase I subunit RPA43, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 338 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TWISTNBQ3B726 EEF1D-205ENST00000442189 2207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
TWISTNBQ3B726 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.35
TWISTNBQ3B726 AC093677.2-201ENST00000600169 1863 ntBASIC23.45■■□□□ 1.35
TWISTNBQ3B726 RGS9BP-201ENST00000334176 2894 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.34
TWISTNBQ3B726 GUCA1B-201ENST00000230361 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TWISTNBQ3B726 ZNF414-201ENST00000255616 1178 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TWISTNBQ3B726 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
TWISTNBQ3B726 TSPY22P-201ENST00000427496 604 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
TWISTNBQ3B726 LEF1-AS1-201ENST00000436413 1045 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TWISTNBQ3B726 AC092159.3-201ENST00000439196 571 ntTSL 4 BASIC23.45■■□□□ 1.34
TWISTNBQ3B726 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
TWISTNBQ3B726 AC004771.4-201ENST00000576752 474 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
TWISTNBQ3B726 AC132938.3-201ENST00000579095 357 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
TWISTNBQ3B726 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.34
TWISTNBQ3B726 AC008687.5-201ENST00000593746 558 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
TWISTNBQ3B726 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
TWISTNBQ3B726 AL807752.6-202ENST00000622933 765 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
TWISTNBQ3B726 SPINK2-207ENST00000631082 392 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
TWISTNBQ3B726 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TWISTNBQ3B726 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TWISTNBQ3B726 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
TWISTNBQ3B726 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TWISTNBQ3B726 KRBOX1-AS1-201ENST00000447834 2134 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
TWISTNBQ3B726 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
TWISTNBQ3B726 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TWISTNBQ3B726 MADD-208ENST00000405573 1823 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
TWISTNBQ3B726 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
TWISTNBQ3B726 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TWISTNBQ3B726 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TWISTNBQ3B726 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TWISTNBQ3B726 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TWISTNBQ3B726 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TWISTNBQ3B726 MTMR12-201ENST00000264934 2215 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TWISTNBQ3B726 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TWISTNBQ3B726 SLC39A7-201ENST00000374675 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TWISTNBQ3B726 PTGER3-202ENST00000351052 1404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TWISTNBQ3B726 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TWISTNBQ3B726 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TWISTNBQ3B726 PTPRN2-204ENST00000404321 1374 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TWISTNBQ3B726 TBC1D3I-202ENST00000618620 1900 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TWISTNBQ3B726 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TWISTNBQ3B726 SUSD4-203ENST00000344029 1056 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TWISTNBQ3B726 UFSP1-201ENST00000388761 996 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TWISTNBQ3B726 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TWISTNBQ3B726 AP001625.2-201ENST00000442605 575 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TWISTNBQ3B726 MHENCR-202ENST00000449500 801 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TWISTNBQ3B726 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TWISTNBQ3B726 KRTCAP3-207ENST00000543753 956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TWISTNBQ3B726 AC009084.1-201ENST00000566869 317 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TWISTNBQ3B726 RABAC1-208ENST00000601078 728 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TWISTNBQ3B726 GPANK1-204ENST00000375900 1814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TWISTNBQ3B726 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TWISTNBQ3B726 RGS20-203ENST00000344277 1667 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TWISTNBQ3B726 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TWISTNBQ3B726 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TWISTNBQ3B726 P2RY6-207ENST00000538328 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TWISTNBQ3B726 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TWISTNBQ3B726 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TWISTNBQ3B726 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
TWISTNBQ3B726 AC008687.8-201ENST00000599795 1748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TWISTNBQ3B726 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TWISTNBQ3B726 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TWISTNBQ3B726 BAALC-202ENST00000306391 243 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TWISTNBQ3B726 BAALC-204ENST00000330955 222 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TWISTNBQ3B726 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TWISTNBQ3B726 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TWISTNBQ3B726 ISG15-201ENST00000379389 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TWISTNBQ3B726 INSL3-202ENST00000379695 899 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TWISTNBQ3B726 PAX3-208ENST00000409828 1254 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TWISTNBQ3B726 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TWISTNBQ3B726 UPK3BP1-201ENST00000428678 509 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
TWISTNBQ3B726 KRT8P26-201ENST00000534154 1276 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
TWISTNBQ3B726 ABCD4-228ENST00000557588 763 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TWISTNBQ3B726 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TWISTNBQ3B726 GCSH-208ENST00000639169 2537 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TWISTNBQ3B726 A4GALT-201ENST00000249005 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TWISTNBQ3B726 FAM131A-202ENST00000340957 2421 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TWISTNBQ3B726 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TWISTNBQ3B726 TXNRD3-202ENST00000523403 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TWISTNBQ3B726 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TWISTNBQ3B726 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TWISTNBQ3B726 CHPF-203ENST00000535926 2634 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TWISTNBQ3B726 KMT5B-206ENST00000405515 2869 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TWISTNBQ3B726 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
TWISTNBQ3B726 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TWISTNBQ3B726 AL353692.3-201ENST00000407031 1396 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
TWISTNBQ3B726 NPTX2-201ENST00000265634 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TWISTNBQ3B726 PPP1R7-201ENST00000234038 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TWISTNBQ3B726 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TWISTNBQ3B726 PIF1-205ENST00000559239 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TWISTNBQ3B726 AMACR-205ENST00000426255 1316 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TWISTNBQ3B726 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TWISTNBQ3B726 LY6E-209ENST00000521003 740 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TWISTNBQ3B726 CSRP1-214ENST00000531916 890 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TWISTNBQ3B726 AC092118.1-202ENST00000568697 718 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TWISTNBQ3B726 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TWISTNBQ3B726 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TWISTNBQ3B726 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TWISTNBQ3B726 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TWISTNBQ3B726 PDE6B-202ENST00000429163 2120 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.2 ms