Protein–RNA interactions for Protein: Q30201

HFE, Hereditary hemochromatosis protein, humanhuman

Predictions only

Length 348 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HFEQ30201 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
HFEQ30201 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
HFEQ30201 PRDM12-201ENST00000253008 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
HFEQ30201 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
HFEQ30201 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
HFEQ30201 SERPINE2-201ENST00000258405 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
HFEQ30201 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
HFEQ30201 EXTL3-201ENST00000220562 6483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
HFEQ30201 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
HFEQ30201 FAM219B-204ENST00000563119 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
HFEQ30201 SAMD11-212ENST00000617307 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
HFEQ30201 ALDH4A1-201ENST00000290597 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
HFEQ30201 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
HFEQ30201 RPL39L-203ENST00000455270 653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
HFEQ30201 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
HFEQ30201 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
HFEQ30201 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
HFEQ30201 YBX1P2-201ENST00000489612 999 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
HFEQ30201 MTHFS-202ENST00000559722 948 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
HFEQ30201 ELAC2-212ENST00000578071 579 ntTSL 4 BASIC15.87■□□□□ 0.13
HFEQ30201 NEK4P2-201ENST00000580004 1012 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
HFEQ30201 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
HFEQ30201 DTX2-201ENST00000324432 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
HFEQ30201 PDE4A-202ENST00000344979 2579 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
HFEQ30201 RAB8A-201ENST00000300935 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
HFEQ30201 ARID3A-201ENST00000263620 5941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
HFEQ30201 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
HFEQ30201 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
HFEQ30201 IFRD1-202ENST00000403825 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
HFEQ30201 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
HFEQ30201 KCNK4-205ENST00000538767 1389 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
HFEQ30201 FST-202ENST00000396947 2538 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
HFEQ30201 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
HFEQ30201 JADE3-204ENST00000614628 4934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
HFEQ30201 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
HFEQ30201 AEBP2-201ENST00000266508 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
HFEQ30201 AHCYL2-201ENST00000325006 5056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
HFEQ30201 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
HFEQ30201 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
HFEQ30201 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
HFEQ30201 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
HFEQ30201 PANX1-201ENST00000227638 2769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
HFEQ30201 APLP2-210ENST00000528499 2530 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
HFEQ30201 KCNN4-209ENST00000615047 2029 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
HFEQ30201 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
HFEQ30201 ARMC10P1-201ENST00000313754 855 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
HFEQ30201 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
HFEQ30201 TSPAN14-202ENST00000341863 1037 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
HFEQ30201 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
HFEQ30201 TSPY5P-201ENST00000426936 936 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
HFEQ30201 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
HFEQ30201 AC009947.2-201ENST00000444014 672 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
HFEQ30201 AC019068.1-202ENST00000483218 768 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
HFEQ30201 CCNJL-205ENST00000519673 940 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
HFEQ30201 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
HFEQ30201 BVES-AS1-203ENST00000580511 853 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
HFEQ30201 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
HFEQ30201 SDCBP-202ENST00000413219 2086 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
HFEQ30201 WDSUB1-203ENST00000392796 1812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
HFEQ30201 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
HFEQ30201 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
HFEQ30201 THOP1-201ENST00000307741 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
HFEQ30201 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
HFEQ30201 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
HFEQ30201 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
HFEQ30201 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
HFEQ30201 PJA1-201ENST00000361478 2755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
HFEQ30201 PLCG1-201ENST00000244007 5285 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
HFEQ30201 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
HFEQ30201 CRTC1-201ENST00000321949 2501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
HFEQ30201 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
HFEQ30201 CDC42EP3-201ENST00000295324 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
HFEQ30201 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
HFEQ30201 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
HFEQ30201 UBE2O-201ENST00000319380 5436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
HFEQ30201 MLLT1-201ENST00000252674 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
HFEQ30201 AL096870.2-201ENST00000565988 2108 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
HFEQ30201 AATF-208ENST00000619387 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
HFEQ30201 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
HFEQ30201 ZNF281-203ENST00000367353 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
HFEQ30201 NPRL3-201ENST00000399953 2784 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
HFEQ30201 JRK-211ENST00000615982 2823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
HFEQ30201 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
HFEQ30201 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
HFEQ30201 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
HFEQ30201 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
HFEQ30201 BHLHE41-201ENST00000242728 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
HFEQ30201 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
HFEQ30201 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
HFEQ30201 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
HFEQ30201 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
HFEQ30201 LY6E-210ENST00000521182 1079 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
HFEQ30201 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
HFEQ30201 AL132780.2-201ENST00000557615 1021 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
HFEQ30201 DCTN5-208ENST00000568589 772 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
HFEQ30201 MIR4674-201ENST00000582457 87 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
HFEQ30201 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
HFEQ30201 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
HFEQ30201 CR769767.2-201ENST00000622735 460 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
HFEQ30201 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.9 ms