Protein–RNA interactions for Protein: Q2M2W7

C17orf58, UPF0450 protein C17orf58, humanhuman

Predictions only

Length 97 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C17orf58Q2M2W7 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
C17orf58Q2M2W7 AL441883.1-201ENST00000566170 1045 ntBASIC15.06■□□□□ 0
C17orf58Q2M2W7 AC140113.3-201ENST00000605663 199 ntBASIC15.06■□□□□ 0
C17orf58Q2M2W7 CYB561D2-210ENST00000607121 1004 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
C17orf58Q2M2W7 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
C17orf58Q2M2W7 CDH23-212ENST00000616684 4814 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
C17orf58Q2M2W7 ST3GAL3-205ENST00000347631 1324 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
C17orf58Q2M2W7 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
C17orf58Q2M2W7 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
C17orf58Q2M2W7 ZNF205-206ENST00000620094 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
C17orf58Q2M2W7 ADAMTS19-201ENST00000274487 5234 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
C17orf58Q2M2W7 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
C17orf58Q2M2W7 DAPK2-205ENST00000558069 1473 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
C17orf58Q2M2W7 PRDM12-201ENST00000253008 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
C17orf58Q2M2W7 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
C17orf58Q2M2W7 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
C17orf58Q2M2W7 PMEPA1-202ENST00000341744 4845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
C17orf58Q2M2W7 PTGES-201ENST00000340607 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
C17orf58Q2M2W7 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
C17orf58Q2M2W7 C12orf65-202ENST00000366329 1901 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
C17orf58Q2M2W7 SHISA3-201ENST00000319234 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
C17orf58Q2M2W7 SLC9A6-201ENST00000370695 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
C17orf58Q2M2W7 ZNF385A-202ENST00000352268 2076 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
C17orf58Q2M2W7 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
C17orf58Q2M2W7 PCDHA1-202ENST00000394633 2204 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
C17orf58Q2M2W7 BAG3-201ENST00000369085 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
C17orf58Q2M2W7 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
C17orf58Q2M2W7 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
C17orf58Q2M2W7 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
C17orf58Q2M2W7 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
C17orf58Q2M2W7 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC15.05■□□□□ -0
C17orf58Q2M2W7 AC019068.1-202ENST00000483218 768 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
C17orf58Q2M2W7 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
C17orf58Q2M2W7 SLC9A3R2-208ENST00000566198 1199 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
C17orf58Q2M2W7 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC15.05■□□□□ -0
C17orf58Q2M2W7 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
C17orf58Q2M2W7 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
C17orf58Q2M2W7 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
C17orf58Q2M2W7 AL031432.5-201ENST00000641059 760 ntBASIC15.05■□□□□ -0
C17orf58Q2M2W7 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC15.05■□□□□ -0
C17orf58Q2M2W7 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
C17orf58Q2M2W7 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
C17orf58Q2M2W7 AC138028.4-201ENST00000564984 1845 ntBASIC15.05■□□□□ -0
C17orf58Q2M2W7 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
C17orf58Q2M2W7 NPEPL1-204ENST00000525967 1917 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
C17orf58Q2M2W7 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
C17orf58Q2M2W7 ACADVL-205ENST00000543245 2227 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
C17orf58Q2M2W7 SLC44A3-201ENST00000271227 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
C17orf58Q2M2W7 MEST-201ENST00000223215 2465 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
C17orf58Q2M2W7 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
C17orf58Q2M2W7 AC018470.1-201ENST00000624790 3129 ntBASIC15.05■□□□□ -0
C17orf58Q2M2W7 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
C17orf58Q2M2W7 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
C17orf58Q2M2W7 ACAP3-202ENST00000354700 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
C17orf58Q2M2W7 KIFC3-201ENST00000379655 3427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
C17orf58Q2M2W7 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
C17orf58Q2M2W7 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
C17orf58Q2M2W7 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
C17orf58Q2M2W7 VIPR1-201ENST00000325123 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
C17orf58Q2M2W7 TTLL3-209ENST00000426895 2767 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
C17orf58Q2M2W7 AC022916.1-201ENST00000590478 2658 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
C17orf58Q2M2W7 KCNH2-203ENST00000430723 2648 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
C17orf58Q2M2W7 ULK3-220ENST00000569437 2611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
C17orf58Q2M2W7 CYP4F2-201ENST00000011989 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
C17orf58Q2M2W7 MAEA-201ENST00000264750 2058 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
C17orf58Q2M2W7 PLD3-205ENST00000409419 1966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
C17orf58Q2M2W7 NPFFR2-201ENST00000308744 1922 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
C17orf58Q2M2W7 POLR1D-220ENST00000637071 1943 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
C17orf58Q2M2W7 SLC25A48-201ENST00000274513 1880 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
C17orf58Q2M2W7 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
C17orf58Q2M2W7 TPRA1-204ENST00000450633 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
C17orf58Q2M2W7 AC093010.1-201ENST00000473625 1624 ntBASIC15.04■□□□□ -0
C17orf58Q2M2W7 SH2D2A-201ENST00000368198 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
C17orf58Q2M2W7 PBK-203ENST00000522944 1499 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
C17orf58Q2M2W7 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
C17orf58Q2M2W7 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
C17orf58Q2M2W7 ANKRD20A18P-201ENST00000359341 492 ntBASIC15.04■□□□□ -0
C17orf58Q2M2W7 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
C17orf58Q2M2W7 AC131097.3-201ENST00000413820 1228 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
C17orf58Q2M2W7 PVRIG2P-201ENST00000435460 978 ntBASIC15.04■□□□□ -0
C17orf58Q2M2W7 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
C17orf58Q2M2W7 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
C17orf58Q2M2W7 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
C17orf58Q2M2W7 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
C17orf58Q2M2W7 AC139887.4-201ENST00000607877 719 ntBASIC15.04■□□□□ -0
C17orf58Q2M2W7 AC011558.1-201ENST00000623459 338 ntBASIC15.04■□□□□ -0
C17orf58Q2M2W7 NFATC1-217ENST00000591814 4819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
C17orf58Q2M2W7 PSMG4-209ENST00000473000 4603 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
C17orf58Q2M2W7 NUTM2F-202ENST00000341207 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
C17orf58Q2M2W7 NUTM2G-202ENST00000372322 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
C17orf58Q2M2W7 TRPV4-208ENST00000544971 2295 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
C17orf58Q2M2W7 NRBP1-203ENST00000379852 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
C17orf58Q2M2W7 ARSA-201ENST00000216124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
C17orf58Q2M2W7 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
C17orf58Q2M2W7 SLC23A3-203ENST00000409878 2010 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
C17orf58Q2M2W7 MST1R-214ENST00000613534 2025 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
C17orf58Q2M2W7 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
C17orf58Q2M2W7 MAPK8IP3-202ENST00000356010 4456 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
C17orf58Q2M2W7 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
C17orf58Q2M2W7 LPAR2-201ENST00000407877 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.9 ms