Protein–RNA interactions for Protein: Q1L6U9

MSMP, Prostate-associated microseminoprotein, humanhuman

Predictions only

Length 139 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MSMPQ1L6U9 SLC9A3R2-208ENST00000566198 1199 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
MSMPQ1L6U9 HOXB8-203ENST00000576562 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
MSMPQ1L6U9 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
MSMPQ1L6U9 AL592071.1-201ENST00000611956 408 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
MSMPQ1L6U9 UBE2C-208ENST00000617055 705 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
MSMPQ1L6U9 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
MSMPQ1L6U9 FAM228B-210ENST00000615575 1357 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
MSMPQ1L6U9 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
MSMPQ1L6U9 BCL11A-209ENST00000489516 1508 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
MSMPQ1L6U9 PHGDH-209ENST00000641074 1780 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
MSMPQ1L6U9 PLD3-205ENST00000409419 1966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
MSMPQ1L6U9 TOP1MT-218ENST00000523676 1982 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
MSMPQ1L6U9 HYOU1-212ENST00000532519 2162 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
MSMPQ1L6U9 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
MSMPQ1L6U9 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
MSMPQ1L6U9 CCNJ-202ENST00000403870 2830 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
MSMPQ1L6U9 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
MSMPQ1L6U9 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
MSMPQ1L6U9 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
MSMPQ1L6U9 AP003774.1-201ENST00000316124 2340 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
MSMPQ1L6U9 GNAS-AS1-202ENST00000443966 2341 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
MSMPQ1L6U9 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
MSMPQ1L6U9 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
MSMPQ1L6U9 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
MSMPQ1L6U9 ARHGEF2-204ENST00000368315 1645 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
MSMPQ1L6U9 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
MSMPQ1L6U9 COQ9-210ENST00000567072 1482 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
MSMPQ1L6U9 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
MSMPQ1L6U9 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
MSMPQ1L6U9 TAX1BP3-202ENST00000611779 1302 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
MSMPQ1L6U9 BOC-211ENST00000484034 1286 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
MSMPQ1L6U9 NDUFB9-202ENST00000517367 636 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
MSMPQ1L6U9 TNNT1-204ENST00000585321 995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
MSMPQ1L6U9 AC092329.2-201ENST00000598402 547 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
MSMPQ1L6U9 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
MSMPQ1L6U9 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
MSMPQ1L6U9 DBN1-201ENST00000292385 3072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
MSMPQ1L6U9 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
MSMPQ1L6U9 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
MSMPQ1L6U9 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
MSMPQ1L6U9 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
MSMPQ1L6U9 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
MSMPQ1L6U9 SOD2-206ENST00000452684 2045 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
MSMPQ1L6U9 KCNN4-209ENST00000615047 2029 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
MSMPQ1L6U9 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
MSMPQ1L6U9 ZBTB8A-201ENST00000316459 1943 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
MSMPQ1L6U9 ACOT7-202ENST00000377842 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
MSMPQ1L6U9 HTATSF1-204ENST00000535601 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
MSMPQ1L6U9 CDK10-202ENST00000353379 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
MSMPQ1L6U9 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
MSMPQ1L6U9 AC132938.6-201ENST00000623828 1655 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
MSMPQ1L6U9 IGF2-207ENST00000434045 1583 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
MSMPQ1L6U9 TADA3-202ENST00000343450 2554 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
MSMPQ1L6U9 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
MSMPQ1L6U9 GCSH-208ENST00000639169 2537 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
MSMPQ1L6U9 GJA8-201ENST00000369235 1302 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
MSMPQ1L6U9 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
MSMPQ1L6U9 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
MSMPQ1L6U9 DRAXINP1-201ENST00000437611 948 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
MSMPQ1L6U9 AC073111.4-202ENST00000486297 585 ntTSL 4 BASIC15.54■□□□□ 0.08
MSMPQ1L6U9 CIB2-208ENST00000560618 804 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
MSMPQ1L6U9 AP005901.3-202ENST00000581653 237 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
MSMPQ1L6U9 TMIGD2-202ENST00000595645 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
MSMPQ1L6U9 CLEC4GP1-201ENST00000596555 870 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
MSMPQ1L6U9 IGHV3-41-201ENST00000613121 348 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
MSMPQ1L6U9 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
MSMPQ1L6U9 AC124864.1-201ENST00000623408 392 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
MSMPQ1L6U9 EML2-AS1-203ENST00000623430 886 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
MSMPQ1L6U9 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
MSMPQ1L6U9 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
MSMPQ1L6U9 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
MSMPQ1L6U9 RGS9BP-201ENST00000334176 2894 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
MSMPQ1L6U9 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
MSMPQ1L6U9 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
MSMPQ1L6U9 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
MSMPQ1L6U9 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
MSMPQ1L6U9 TXNRD3-202ENST00000523403 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
MSMPQ1L6U9 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
MSMPQ1L6U9 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
MSMPQ1L6U9 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
MSMPQ1L6U9 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
MSMPQ1L6U9 CRYL1-202ENST00000382812 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
MSMPQ1L6U9 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
MSMPQ1L6U9 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
MSMPQ1L6U9 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
MSMPQ1L6U9 A4GALT-201ENST00000249005 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
MSMPQ1L6U9 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
MSMPQ1L6U9 PRODH-205ENST00000420436 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
MSMPQ1L6U9 AC135776.1-201ENST00000319817 2481 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
MSMPQ1L6U9 SPART-209ENST00000494062 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
MSMPQ1L6U9 DYNLL1-209ENST00000550845 1376 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
MSMPQ1L6U9 CIZ1-226ENST00000629610 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
MSMPQ1L6U9 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
MSMPQ1L6U9 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
MSMPQ1L6U9 INTS10-201ENST00000397977 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
MSMPQ1L6U9 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
MSMPQ1L6U9 CARHSP1-201ENST00000311052 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
MSMPQ1L6U9 KCNMB3-202ENST00000349697 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
MSMPQ1L6U9 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
MSMPQ1L6U9 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.6 ms