Protein–RNA interactions for Protein: Q1ED39

KNOP1, Lysine-rich nucleolar protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 458 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KNOP1Q1ED39 ACSL6-205ENST00000379246 2622 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
KNOP1Q1ED39 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
KNOP1Q1ED39 STRA6-209ENST00000563965 2565 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
KNOP1Q1ED39 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
KNOP1Q1ED39 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
KNOP1Q1ED39 NECAB1-201ENST00000417640 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
KNOP1Q1ED39 FAM213B-202ENST00000378425 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
KNOP1Q1ED39 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
KNOP1Q1ED39 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
KNOP1Q1ED39 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
KNOP1Q1ED39 PVRIG2P-201ENST00000435460 978 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
KNOP1Q1ED39 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
KNOP1Q1ED39 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
KNOP1Q1ED39 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
KNOP1Q1ED39 SLC9A3R2-208ENST00000566198 1199 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
KNOP1Q1ED39 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
KNOP1Q1ED39 AC139887.4-201ENST00000607877 719 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
KNOP1Q1ED39 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
KNOP1Q1ED39 OGFOD2-212ENST00000538755 1949 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
KNOP1Q1ED39 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
KNOP1Q1ED39 PXK-206ENST00000463280 2825 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
KNOP1Q1ED39 KCNC4-203ENST00000413138 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
KNOP1Q1ED39 KANK3-201ENST00000330915 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
KNOP1Q1ED39 SLC9A6-201ENST00000370695 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
KNOP1Q1ED39 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
KNOP1Q1ED39 ABHD13-201ENST00000375898 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
KNOP1Q1ED39 AL031658.1-201ENST00000449519 2013 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
KNOP1Q1ED39 MAPK8IP3-202ENST00000356010 4456 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
KNOP1Q1ED39 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
KNOP1Q1ED39 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
KNOP1Q1ED39 DNAJA3-203ENST00000431375 2294 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
KNOP1Q1ED39 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.81
KNOP1Q1ED39 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
KNOP1Q1ED39 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
KNOP1Q1ED39 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.81
KNOP1Q1ED39 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
KNOP1Q1ED39 YBX1P2-201ENST00000489612 999 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
KNOP1Q1ED39 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
KNOP1Q1ED39 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
KNOP1Q1ED39 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
KNOP1Q1ED39 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
KNOP1Q1ED39 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
KNOP1Q1ED39 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
KNOP1Q1ED39 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
KNOP1Q1ED39 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
KNOP1Q1ED39 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
KNOP1Q1ED39 PTK6-201ENST00000217185 2401 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
KNOP1Q1ED39 POC1B-GALNT4-201ENST00000547474 2207 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
KNOP1Q1ED39 PLD3-205ENST00000409419 1966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
KNOP1Q1ED39 PTGES-201ENST00000340607 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
KNOP1Q1ED39 ISY1-201ENST00000273541 1704 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
KNOP1Q1ED39 BMS1P4-202ENST00000584747 1716 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
KNOP1Q1ED39 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
KNOP1Q1ED39 SLC23A3-207ENST00000455516 2048 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
KNOP1Q1ED39 PBK-203ENST00000522944 1499 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
KNOP1Q1ED39 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
KNOP1Q1ED39 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
KNOP1Q1ED39 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
KNOP1Q1ED39 KRT18P57-201ENST00000443599 1254 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
KNOP1Q1ED39 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
KNOP1Q1ED39 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
KNOP1Q1ED39 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
KNOP1Q1ED39 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
KNOP1Q1ED39 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
KNOP1Q1ED39 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
KNOP1Q1ED39 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
KNOP1Q1ED39 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
KNOP1Q1ED39 AC118553.2-203ENST00000639037 2590 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
KNOP1Q1ED39 ADAMTS19-201ENST00000274487 5234 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
KNOP1Q1ED39 MECP2-205ENST00000453960 1729 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
KNOP1Q1ED39 LHX8-201ENST00000294638 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
KNOP1Q1ED39 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
KNOP1Q1ED39 MEST-201ENST00000223215 2465 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
KNOP1Q1ED39 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
KNOP1Q1ED39 PSMG4-209ENST00000473000 4603 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
KNOP1Q1ED39 NPFFR2-201ENST00000308744 1922 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
KNOP1Q1ED39 CADPS2-208ENST00000615869 6066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
KNOP1Q1ED39 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
KNOP1Q1ED39 ACADVL-205ENST00000543245 2227 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
KNOP1Q1ED39 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
KNOP1Q1ED39 NADK-201ENST00000341426 3235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
KNOP1Q1ED39 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
KNOP1Q1ED39 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
KNOP1Q1ED39 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
KNOP1Q1ED39 ABHD14B-208ENST00000525795 980 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
KNOP1Q1ED39 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
KNOP1Q1ED39 AC011498.2-201ENST00000588798 540 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
KNOP1Q1ED39 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
KNOP1Q1ED39 SEC14L2-215ENST00000617837 2632 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
KNOP1Q1ED39 SHISA3-201ENST00000319234 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
KNOP1Q1ED39 AC138028.4-201ENST00000564984 1845 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
KNOP1Q1ED39 UBE2E1-202ENST00000346855 1398 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
KNOP1Q1ED39 NFATC1-217ENST00000591814 4819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
KNOP1Q1ED39 SLC44A3-201ENST00000271227 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
KNOP1Q1ED39 C12orf65-202ENST00000366329 1901 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
KNOP1Q1ED39 NPEPL1-204ENST00000525967 1917 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
KNOP1Q1ED39 PRDM12-201ENST00000253008 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
KNOP1Q1ED39 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
KNOP1Q1ED39 ACAP3-202ENST00000354700 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
KNOP1Q1ED39 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
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