Protein–RNA interactions for Protein: Q17RM4

CCDC142, Coiled-coil domain-containing protein 142, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC142Q17RM4 LITAF-220ENST00000620789 692 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
CCDC142Q17RM4 MTSS1L-204ENST00000616026 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
CCDC142Q17RM4 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CCDC142Q17RM4 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
CCDC142Q17RM4 ENDOV-225ENST00000522751 1475 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
CCDC142Q17RM4 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CCDC142Q17RM4 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CCDC142Q17RM4 PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 2537 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
CCDC142Q17RM4 ZNF274-212ENST00000617501 2538 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CCDC142Q17RM4 EVX1-202ENST00000496902 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CCDC142Q17RM4 MYLKP1-201ENST00000509077 1580 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
CCDC142Q17RM4 SDHAP2-201ENST00000455183 2001 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
CCDC142Q17RM4 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
CCDC142Q17RM4 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
CCDC142Q17RM4 PTTG1IP-204ENST00000445724 2497 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
CCDC142Q17RM4 AC007613.1-201ENST00000572811 2597 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
CCDC142Q17RM4 ASZ1-201ENST00000284629 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
CCDC142Q17RM4 SAMD11-216ENST00000620200 1874 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
CCDC142Q17RM4 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
CCDC142Q17RM4 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
CCDC142Q17RM4 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
CCDC142Q17RM4 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
CCDC142Q17RM4 ALDH5A1-201ENST00000348925 2266 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
CCDC142Q17RM4 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
CCDC142Q17RM4 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
CCDC142Q17RM4 AC011498.5-201ENST00000592027 486 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
CCDC142Q17RM4 AGPAT2-201ENST00000371694 1391 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
CCDC142Q17RM4 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
CCDC142Q17RM4 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
CCDC142Q17RM4 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
CCDC142Q17RM4 MAP2K5-202ENST00000340972 1491 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
CCDC142Q17RM4 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
CCDC142Q17RM4 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
CCDC142Q17RM4 SPAST-203ENST00000615843 5212 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
CCDC142Q17RM4 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
CCDC142Q17RM4 ASCC2-202ENST00000397771 2823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.71
CCDC142Q17RM4 AC011416.4-201ENST00000639283 2195 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CCDC142Q17RM4 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CCDC142Q17RM4 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CCDC142Q17RM4 TMEM177-204ENST00000424086 1738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CCDC142Q17RM4 AMDHD2-203ENST00000413459 2049 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CCDC142Q17RM4 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CCDC142Q17RM4 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CCDC142Q17RM4 TTTY14-203ENST00000447937 920 ntTSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CCDC142Q17RM4 PLXND1-205ENST00000504689 546 ntTSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CCDC142Q17RM4 AC106791.1-202ENST00000508281 1148 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CCDC142Q17RM4 REEP1-209ENST00000541910 969 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CCDC142Q17RM4 PTPRN2-204ENST00000404321 1374 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CCDC142Q17RM4 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CCDC142Q17RM4 FADS1-204ENST00000433932 1690 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CCDC142Q17RM4 IRAK3-202ENST00000457197 1853 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CCDC142Q17RM4 CYR61-201ENST00000451137 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CCDC142Q17RM4 EMX2-201ENST00000442245 2710 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CCDC142Q17RM4 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CCDC142Q17RM4 PPM1G-201ENST00000344034 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CCDC142Q17RM4 KIF1BP-204ENST00000626493 2337 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CCDC142Q17RM4 XYLT2-203ENST00000507602 2107 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CCDC142Q17RM4 C19orf25-207ENST00000588871 2128 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CCDC142Q17RM4 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CCDC142Q17RM4 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CCDC142Q17RM4 RGS3-231ENST00000613049 1726 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CCDC142Q17RM4 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CCDC142Q17RM4 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CCDC142Q17RM4 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CCDC142Q17RM4 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CCDC142Q17RM4 RAPH1-211ENST00000457812 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CCDC142Q17RM4 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CCDC142Q17RM4 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CCDC142Q17RM4 ZNF395-211ENST00000523202 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CCDC142Q17RM4 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CCDC142Q17RM4 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CCDC142Q17RM4 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CCDC142Q17RM4 AL390961.4-201ENST00000623958 2535 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
CCDC142Q17RM4 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CCDC142Q17RM4 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CCDC142Q17RM4 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CCDC142Q17RM4 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CCDC142Q17RM4 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CCDC142Q17RM4 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CCDC142Q17RM4 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CCDC142Q17RM4 MIR3180-4-201ENST00000582223 153 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
CCDC142Q17RM4 AC069148.1-201ENST00000608741 768 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
CCDC142Q17RM4 DGUOK-208ENST00000629438 1029 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CCDC142Q17RM4 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CCDC142Q17RM4 TP53I3-202ENST00000335934 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CCDC142Q17RM4 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CCDC142Q17RM4 AGER-205ENST00000375069 1538 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CCDC142Q17RM4 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CCDC142Q17RM4 AMACR-205ENST00000426255 1316 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CCDC142Q17RM4 UBC-206ENST00000538617 1303 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CCDC142Q17RM4 GSDMD-201ENST00000262580 1762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CCDC142Q17RM4 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CCDC142Q17RM4 EHMT1-204ENST00000462484 2707 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CCDC142Q17RM4 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CCDC142Q17RM4 LETM1P2-201ENST00000597330 2178 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
CCDC142Q17RM4 UBE2E1-202ENST00000346855 1398 ntTSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CCDC142Q17RM4 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
CCDC142Q17RM4 HSD17B10-201ENST00000168216 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CCDC142Q17RM4 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CCDC142Q17RM4 ZNF575-201ENST00000314228 1298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
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