Protein–RNA interactions for Protein: Q16658

FSCN1, Fascin, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 493 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FSCN1Q16658 PDLIM7-202ENST00000355841 1689 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
FSCN1Q16658 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
FSCN1Q16658 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
FSCN1Q16658 ABHD11-205ENST00000437775 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
FSCN1Q16658 TMEM25-225ENST00000533102 1410 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
FSCN1Q16658 SLC22A1-201ENST00000324965 1521 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
FSCN1Q16658 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
FSCN1Q16658 INTS4P1-201ENST00000438455 1935 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
FSCN1Q16658 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
FSCN1Q16658 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
FSCN1Q16658 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
FSCN1Q16658 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
FSCN1Q16658 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
FSCN1Q16658 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
FSCN1Q16658 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
FSCN1Q16658 TRABD2A-202ENST00000409133 1554 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
FSCN1Q16658 HNRNPDP1-201ENST00000439535 754 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
FSCN1Q16658 RPL13AP23-201ENST00000480739 586 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
FSCN1Q16658 POLD2P1-201ENST00000511220 997 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
FSCN1Q16658 RPL18-208ENST00000549920 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
FSCN1Q16658 RPL18-209ENST00000550645 463 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
FSCN1Q16658 RPL18-214ENST00000552588 559 ntTSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
FSCN1Q16658 ANKRD34C-AS1-205ENST00000560452 576 ntTSL 4 BASIC20.27■□□□□ 0.84
FSCN1Q16658 RPL27-206ENST00000589913 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
FSCN1Q16658 CIRBP-235ENST00000591935 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
FSCN1Q16658 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
FSCN1Q16658 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.83
FSCN1Q16658 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
FSCN1Q16658 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
FSCN1Q16658 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
FSCN1Q16658 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
FSCN1Q16658 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
FSCN1Q16658 TMED3-201ENST00000299705 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
FSCN1Q16658 CCDC188-201ENST00000439765 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
FSCN1Q16658 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
FSCN1Q16658 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
FSCN1Q16658 KCNK7-204ENST00000394217 1372 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
FSCN1Q16658 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
FSCN1Q16658 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
FSCN1Q16658 KRTAP1-1-201ENST00000306271 903 ntAPPRIS P1 BASIC20.26■□□□□ 0.83
FSCN1Q16658 AL359915.2-201ENST00000425884 745 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
FSCN1Q16658 HCG15-203ENST00000438190 1032 ntTSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
FSCN1Q16658 AC136604.3-201ENST00000508188 429 ntTSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
FSCN1Q16658 AP000688.1-201ENST00000535199 1221 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
FSCN1Q16658 DYNLL1-204ENST00000548214 616 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
FSCN1Q16658 PRSS8-206ENST00000568261 1214 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
FSCN1Q16658 FOXP1-223ENST00000622151 429 ntTSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
FSCN1Q16658 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
FSCN1Q16658 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
FSCN1Q16658 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
FSCN1Q16658 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
FSCN1Q16658 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
FSCN1Q16658 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
FSCN1Q16658 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
FSCN1Q16658 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
FSCN1Q16658 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
FSCN1Q16658 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
FSCN1Q16658 UBE2I-207ENST00000406620 1842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
FSCN1Q16658 ST8SIA5-202ENST00000536490 1499 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
FSCN1Q16658 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
FSCN1Q16658 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
FSCN1Q16658 HMGN1-204ENST00000380749 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
FSCN1Q16658 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
FSCN1Q16658 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
FSCN1Q16658 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
FSCN1Q16658 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC20.25■□□□□ 0.83
FSCN1Q16658 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
FSCN1Q16658 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
FSCN1Q16658 IGHV3-15-201ENST00000390603 437 ntAPPRIS P1 BASIC20.25■□□□□ 0.83
FSCN1Q16658 OTOS-202ENST00000391989 645 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
FSCN1Q16658 UPK3A-202ENST00000396082 627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
FSCN1Q16658 AP000688.4-201ENST00000436303 446 ntTSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
FSCN1Q16658 MTUS2-205ENST00000542829 1165 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
FSCN1Q16658 GABARAP-204ENST00000571253 837 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
FSCN1Q16658 AC011467.2-201ENST00000598425 242 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
FSCN1Q16658 AC114488.2-214ENST00000609033 813 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
FSCN1Q16658 CHST13-202ENST00000615522 1146 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
FSCN1Q16658 HNF1B-206ENST00000620125 1103 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
FSCN1Q16658 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
FSCN1Q16658 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
FSCN1Q16658 TRIB3-202ENST00000422053 1533 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
FSCN1Q16658 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
FSCN1Q16658 AC125634.1-201ENST00000438758 1403 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
FSCN1Q16658 LGALS12-201ENST00000255684 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
FSCN1Q16658 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
FSCN1Q16658 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
FSCN1Q16658 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
FSCN1Q16658 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
FSCN1Q16658 DHRS12-201ENST00000218981 1970 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
FSCN1Q16658 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
FSCN1Q16658 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
FSCN1Q16658 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
FSCN1Q16658 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
FSCN1Q16658 RPS2P28-201ENST00000314255 741 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
FSCN1Q16658 TRA2B-202ENST00000342294 288 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
FSCN1Q16658 HFE-210ENST00000470149 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
FSCN1Q16658 FIBP-212ENST00000533045 1173 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
FSCN1Q16658 AC021739.2-201ENST00000558375 964 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
FSCN1Q16658 AC107896.1-201ENST00000593212 548 ntTSL 4 BASIC20.24■□□□□ 0.83
FSCN1Q16658 ZNF772-206ENST00000600175 737 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
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