Protein–RNA interactions for Protein: Q16610

ECM1, Extracellular matrix protein 1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ECM1Q16610 CLEC10A-201ENST00000254868 1797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
ECM1Q16610 SEPT2-208ENST00000407971 3267 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
ECM1Q16610 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
ECM1Q16610 PDLIM7-203ENST00000359895 1567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
ECM1Q16610 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
ECM1Q16610 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
ECM1Q16610 AGPAT2-201ENST00000371694 1391 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
ECM1Q16610 PLPPR2-208ENST00000591608 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
ECM1Q16610 BET1L-202ENST00000332865 533 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
ECM1Q16610 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
ECM1Q16610 ISCU-202ENST00000392807 1069 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
ECM1Q16610 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
ECM1Q16610 ISCU-203ENST00000431221 799 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
ECM1Q16610 PTX4-202ENST00000440447 1117 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
ECM1Q16610 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
ECM1Q16610 AP006284.1-202ENST00000527113 527 ntTSL 4 BASIC20.39■□□□□ 0.85
ECM1Q16610 C17orf49-208ENST00000552402 760 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
ECM1Q16610 MRPL52-215ENST00000556840 398 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
ECM1Q16610 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
ECM1Q16610 RNF126P1-202ENST00000569893 925 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
ECM1Q16610 AC024563.2-201ENST00000603282 481 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
ECM1Q16610 LITAF-220ENST00000620789 692 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
ECM1Q16610 AL590326.2-201ENST00000625139 305 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
ECM1Q16610 CORO1C-204ENST00000541050 2487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
ECM1Q16610 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC20.39■□□□□ 0.85
ECM1Q16610 GABRB1-201ENST00000295454 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
ECM1Q16610 RPS6KA1-204ENST00000374168 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
ECM1Q16610 FNBP1-201ENST00000355681 1977 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
ECM1Q16610 MFSD2A-203ENST00000420632 1914 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
ECM1Q16610 TDRKH-207ENST00000458431 2768 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
ECM1Q16610 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
ECM1Q16610 KCNH2-203ENST00000430723 2648 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
ECM1Q16610 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
ECM1Q16610 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
ECM1Q16610 ACADVL-205ENST00000543245 2227 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
ECM1Q16610 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
ECM1Q16610 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
ECM1Q16610 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
ECM1Q16610 KIFC3-201ENST00000379655 3427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
ECM1Q16610 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
ECM1Q16610 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
ECM1Q16610 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
ECM1Q16610 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
ECM1Q16610 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
ECM1Q16610 HES2-202ENST00000377836 507 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
ECM1Q16610 TTTY14-203ENST00000447937 920 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
ECM1Q16610 FAM86EP-206ENST00000510506 987 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
ECM1Q16610 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
ECM1Q16610 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
ECM1Q16610 GFOD2-207ENST00000602855 819 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
ECM1Q16610 C6orf48-210ENST00000614363 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
ECM1Q16610 ZNF274-212ENST00000617501 2538 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
ECM1Q16610 PCCA-202ENST00000376285 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
ECM1Q16610 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
ECM1Q16610 UBE2I-207ENST00000406620 1842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
ECM1Q16610 SAMD11-212ENST00000617307 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
ECM1Q16610 AC132938.6-201ENST00000623828 1655 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
ECM1Q16610 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
ECM1Q16610 TCP11-228ENST00000611141 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
ECM1Q16610 RNF121-201ENST00000361756 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
ECM1Q16610 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ECM1Q16610 PMAIP1-202ENST00000316660 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ECM1Q16610 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ECM1Q16610 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ECM1Q16610 SEPT8-216ENST00000620483 4335 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
ECM1Q16610 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ECM1Q16610 HIST2H2AB-201ENST00000331128 393 ntAPPRIS P1 BASIC20.37■□□□□ 0.85
ECM1Q16610 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ECM1Q16610 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ECM1Q16610 ACTN4-202ENST00000390009 2102 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ECM1Q16610 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC20.37■□□□□ 0.85
ECM1Q16610 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ECM1Q16610 AC107464.1-203ENST00000468356 2120 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ECM1Q16610 AC099518.3-201ENST00000564808 809 ntAPPRIS P5 TSL 4 BASIC20.37■□□□□ 0.85
ECM1Q16610 WDR6-223ENST00000627177 207 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
ECM1Q16610 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ECM1Q16610 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ECM1Q16610 FAM50B-201ENST00000380272 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ECM1Q16610 SLC23A3-203ENST00000409878 2010 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
ECM1Q16610 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ECM1Q16610 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ECM1Q16610 CSK-201ENST00000220003 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ECM1Q16610 GUCY1A2-201ENST00000282249 3047 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ECM1Q16610 APOA5-201ENST00000227665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ECM1Q16610 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
ECM1Q16610 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC20.37■□□□□ 0.85
ECM1Q16610 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ECM1Q16610 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
ECM1Q16610 IFFO1-202ENST00000356896 2680 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
ECM1Q16610 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
ECM1Q16610 RAVER1-207ENST00000615032 1952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
ECM1Q16610 DNAJA3-203ENST00000431375 2294 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
ECM1Q16610 AC093010.1-201ENST00000473625 1624 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
ECM1Q16610 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ECM1Q16610 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
ECM1Q16610 MRPL52-210ENST00000555345 895 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
ECM1Q16610 NDUFV2-AS1-203ENST00000608008 779 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
ECM1Q16610 SPEG-225ENST00000617028 815 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
ECM1Q16610 PSMD11-202ENST00000457654 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
ECM1Q16610 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
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