Protein–RNA interactions for Protein: Q16595

FXN, Frataxin, mitochondrial, humanhuman

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Length 210 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FXNQ16595 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
FXNQ16595 PMPCB-201ENST00000249269 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
FXNQ16595 TRAM1-201ENST00000262213 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
FXNQ16595 TBXAS1-210ENST00000458722 2057 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
FXNQ16595 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
FXNQ16595 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
FXNQ16595 ZBTB32-201ENST00000262630 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
FXNQ16595 MSLNL-201ENST00000442466 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
FXNQ16595 SYTL3-201ENST00000297239 2292 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
FXNQ16595 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
FXNQ16595 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
FXNQ16595 PABPC1L-201ENST00000217073 1851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
FXNQ16595 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
FXNQ16595 UROS-202ENST00000368778 1556 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
FXNQ16595 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
FXNQ16595 FLOT2-202ENST00000394908 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
FXNQ16595 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
FXNQ16595 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
FXNQ16595 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
FXNQ16595 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
FXNQ16595 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
FXNQ16595 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
FXNQ16595 ADAMTS8-201ENST00000257359 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
FXNQ16595 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
FXNQ16595 INPP5J-207ENST00000405300 2515 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
FXNQ16595 AC124067.4-201ENST00000519691 2379 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
FXNQ16595 LUC7L-202ENST00000337351 2097 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
FXNQ16595 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
FXNQ16595 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
FXNQ16595 SCHIP1-205ENST00000482804 1799 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
FXNQ16595 CADPS2-202ENST00000334010 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
FXNQ16595 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
FXNQ16595 PTGDR-201ENST00000306051 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
FXNQ16595 ZNF302-202ENST00000446502 2635 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
FXNQ16595 GLRB-201ENST00000264428 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
FXNQ16595 CBFB-202ENST00000412916 2971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
FXNQ16595 MFSD2A-201ENST00000372809 2173 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
FXNQ16595 PARP16-202ENST00000444347 2352 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
FXNQ16595 CSTB-204ENST00000640406 2354 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
FXNQ16595 LINC01554-202ENST00000436592 2052 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
FXNQ16595 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
FXNQ16595 ZBTB44-201ENST00000357899 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
FXNQ16595 NFATC1-217ENST00000591814 4819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
FXNQ16595 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
FXNQ16595 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
FXNQ16595 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
FXNQ16595 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
FXNQ16595 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
FXNQ16595 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
FXNQ16595 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
FXNQ16595 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
FXNQ16595 AC020763.4-201ENST00000623414 4170 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
FXNQ16595 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
FXNQ16595 NAA60-201ENST00000360862 2522 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
FXNQ16595 ERBB2-205ENST00000578199 2526 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
FXNQ16595 SETD3-202ENST00000331768 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
FXNQ16595 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
FXNQ16595 TCTN1-204ENST00000397659 1885 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
FXNQ16595 AL163051.1-201ENST00000569214 1512 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
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FXNQ16595 CDH24-204ENST00000487137 3438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
FXNQ16595 AL138688.1-201ENST00000624851 1594 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
FXNQ16595 ZBTB45-202ENST00000594051 2541 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
FXNQ16595 KIFC3-203ENST00000445690 3379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
FXNQ16595 ERLEC1-201ENST00000185150 2433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
FXNQ16595 MMEL1-201ENST00000378412 2849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
FXNQ16595 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
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FXNQ16595 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
FXNQ16595 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
FXNQ16595 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
FXNQ16595 MIR149-201ENST00000384879 89 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
FXNQ16595 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
FXNQ16595 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
FXNQ16595 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
FXNQ16595 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
FXNQ16595 AC008771.1-201ENST00000508000 1151 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
FXNQ16595 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
FXNQ16595 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
FXNQ16595 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
FXNQ16595 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
FXNQ16595 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
FXNQ16595 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
FXNQ16595 PHLDA1-202ENST00000602540 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
FXNQ16595 AC022211.2-201ENST00000585075 2527 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
FXNQ16595 PITPNC1-201ENST00000299954 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
FXNQ16595 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
FXNQ16595 EIF4E1B-201ENST00000318682 1974 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
FXNQ16595 PLD3-205ENST00000409419 1966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
FXNQ16595 STRN4-204ENST00000539396 2608 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
FXNQ16595 BCR-201ENST00000305877 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
FXNQ16595 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
FXNQ16595 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
FXNQ16595 ZNF48-206ENST00000622647 2695 ntTSL 4 BASIC17.14■□□□□ 0.34
FXNQ16595 BBS5-202ENST00000392663 3107 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
FXNQ16595 PAX7-201ENST00000375375 2260 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
FXNQ16595 PRDM5-212ENST00000515109 2259 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
FXNQ16595 SCNN1D-206ENST00000400928 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
FXNQ16595 LINC01569-202ENST00000573042 2093 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
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