Protein–RNA interactions for Protein: Q16549

PCSK7, Proprotein convertase subtilisin/kexin type 7, humanhuman

Predictions only

Length 785 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCSK7Q16549 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
PCSK7Q16549 AL162457.2-201ENST00000447909 937 ntTSL 3 BASIC18.64■□□□□ 0.57
PCSK7Q16549 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC18.64■□□□□ 0.57
PCSK7Q16549 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
PCSK7Q16549 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC18.64■□□□□ 0.57
PCSK7Q16549 NEK4P2-201ENST00000580004 1012 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
PCSK7Q16549 AC010240.3-201ENST00000607688 395 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
PCSK7Q16549 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
PCSK7Q16549 ITPK1-202ENST00000354313 2803 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
PCSK7Q16549 SHKBP1-201ENST00000291842 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
PCSK7Q16549 CHRNA4-201ENST00000370263 5577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
PCSK7Q16549 RNH1-201ENST00000354420 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
PCSK7Q16549 DBN1-201ENST00000292385 3072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
PCSK7Q16549 WNT5B-203ENST00000537031 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
PCSK7Q16549 TCP11-201ENST00000244645 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
PCSK7Q16549 AC009102.3-201ENST00000623118 1491 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
PCSK7Q16549 CTNNBL1-204ENST00000405275 2076 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
PCSK7Q16549 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
PCSK7Q16549 SLBP-201ENST00000318386 1635 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
PCSK7Q16549 GSEC-201ENST00000626810 2289 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
PCSK7Q16549 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
PCSK7Q16549 PTPRJ-202ENST00000440289 3158 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
PCSK7Q16549 ST3GAL3-201ENST00000262915 2470 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
PCSK7Q16549 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
PCSK7Q16549 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
PCSK7Q16549 GDF10-201ENST00000580279 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
PCSK7Q16549 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
PCSK7Q16549 AC060780.1-201ENST00000635600 1782 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
PCSK7Q16549 NOP14-204ENST00000502735 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
PCSK7Q16549 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
PCSK7Q16549 PTPA-201ENST00000337738 2845 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
PCSK7Q16549 PXK-206ENST00000463280 2825 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
PCSK7Q16549 ESPNP-201ENST00000270691 2015 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
PCSK7Q16549 ZNF395-211ENST00000523202 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
PCSK7Q16549 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
PCSK7Q16549 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
PCSK7Q16549 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
PCSK7Q16549 AP000523.1-201ENST00000398242 1049 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
PCSK7Q16549 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
PCSK7Q16549 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
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PCSK7Q16549 AL132780.2-201ENST00000557615 1021 ntTSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
PCSK7Q16549 NUDT16L1-203ENST00000586252 922 ntTSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
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PCSK7Q16549 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
PCSK7Q16549 CACNA1A-247ENST00000637769 8648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
PCSK7Q16549 TYRO3-201ENST00000263798 8207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
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PCSK7Q16549 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
PCSK7Q16549 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
PCSK7Q16549 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
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PCSK7Q16549 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
PCSK7Q16549 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
PCSK7Q16549 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
PCSK7Q16549 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
PCSK7Q16549 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
PCSK7Q16549 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
PCSK7Q16549 MAP3K13-213ENST00000454237 526 ntTSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
PCSK7Q16549 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
PCSK7Q16549 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
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PCSK7Q16549 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
PCSK7Q16549 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
PCSK7Q16549 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
PCSK7Q16549 AC140113.3-201ENST00000605663 199 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
PCSK7Q16549 DNAJB6-218ENST00000634080 1005 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
PCSK7Q16549 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
PCSK7Q16549 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
PCSK7Q16549 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
PCSK7Q16549 RPL32-202ENST00000396953 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
PCSK7Q16549 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
PCSK7Q16549 BICD1-207ENST00000551848 1962 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
PCSK7Q16549 SDHAP2-201ENST00000455183 2001 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
PCSK7Q16549 APBB1-215ENST00000608394 2128 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
PCSK7Q16549 APBB1-222ENST00000610474 2147 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
PCSK7Q16549 IFFO1-204ENST00000396840 2677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
PCSK7Q16549 LYSMD4-201ENST00000332728 2847 ntTSL 4 BASIC18.62■□□□□ 0.57
PCSK7Q16549 OXSR1-201ENST00000311806 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
PCSK7Q16549 CRKL-201ENST00000354336 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
PCSK7Q16549 MAP4K4-202ENST00000324219 7526 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
PCSK7Q16549 ADCY3-201ENST00000260600 5050 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
PCSK7Q16549 CLMP-201ENST00000448775 5072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
PCSK7Q16549 SNAP91-201ENST00000195649 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
PCSK7Q16549 SNAP91-204ENST00000369694 4449 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
PCSK7Q16549 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
PCSK7Q16549 LINC00461-203ENST00000504246 2300 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
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