Protein–RNA interactions for Protein: Q16543

CDC37, Hsp90 co-chaperone Cdc37, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 378 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDC37Q16543 AC008567.3-202ENST00000619671 859 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
CDC37Q16543 AC124864.1-201ENST00000623408 392 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
CDC37Q16543 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
CDC37Q16543 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
CDC37Q16543 CDK10-208ENST00000505473 1424 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
CDC37Q16543 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
CDC37Q16543 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
CDC37Q16543 NFATC4-228ENST00000556759 2025 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
CDC37Q16543 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
CDC37Q16543 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
CDC37Q16543 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
CDC37Q16543 ALDH5A1-201ENST00000348925 2266 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
CDC37Q16543 GSEC-201ENST00000626810 2289 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.95
CDC37Q16543 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
CDC37Q16543 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
CDC37Q16543 UBE2I-207ENST00000406620 1842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
CDC37Q16543 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
CDC37Q16543 CTNNBL1-204ENST00000405275 2076 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
CDC37Q16543 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
CDC37Q16543 PSTK-201ENST00000368887 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
CDC37Q16543 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
CDC37Q16543 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
CDC37Q16543 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
CDC37Q16543 SWI5-201ENST00000320188 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
CDC37Q16543 S100A14-201ENST00000344616 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
CDC37Q16543 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
CDC37Q16543 RASGRP2-208ENST00000394428 444 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
CDC37Q16543 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
CDC37Q16543 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
CDC37Q16543 FOXP3-205ENST00000518685 1213 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
CDC37Q16543 LINC02237-202ENST00000521904 477 ntTSL 3 BASIC21.01■□□□□ 0.95
CDC37Q16543 AP005717.1-202ENST00000523563 419 ntTSL 3 BASIC21.01■□□□□ 0.95
CDC37Q16543 AP000867.3-201ENST00000524675 377 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
CDC37Q16543 AC079385.1-201ENST00000551505 570 ntTSL 4 BASIC21.01■□□□□ 0.95
CDC37Q16543 AC005625.1-201ENST00000590304 472 ntTSL 3 BASIC21.01■□□□□ 0.95
CDC37Q16543 DHRS4L2-211ENST00000621761 1049 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
CDC37Q16543 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
CDC37Q16543 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
CDC37Q16543 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
CDC37Q16543 LRRC27-201ENST00000344079 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
CDC37Q16543 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
CDC37Q16543 LINC01700-201ENST00000433952 1598 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
CDC37Q16543 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
CDC37Q16543 LINC00960-201ENST00000463183 1333 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
CDC37Q16543 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
CDC37Q16543 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
CDC37Q16543 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
CDC37Q16543 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
CDC37Q16543 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
CDC37Q16543 CIAO1-203ENST00000488633 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
CDC37Q16543 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
CDC37Q16543 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC21■□□□□ 0.95
CDC37Q16543 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
CDC37Q16543 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
CDC37Q16543 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
CDC37Q16543 CORT-201ENST00000377049 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
CDC37Q16543 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
CDC37Q16543 RABL2B-209ENST00000435118 1126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
CDC37Q16543 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
CDC37Q16543 MRPL2-208ENST00000489623 570 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
CDC37Q16543 NPM2-204ENST00000518119 1190 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
CDC37Q16543 BRICD5-203ENST00000566018 555 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
CDC37Q16543 PRR29-207ENST00000580752 458 ntTSL 3 BASIC21■□□□□ 0.95
CDC37Q16543 H2BFWT-202ENST00000611083 528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
CDC37Q16543 TP53I11-223ENST00000627720 195 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
CDC37Q16543 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
CDC37Q16543 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
CDC37Q16543 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
CDC37Q16543 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
CDC37Q16543 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
CDC37Q16543 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
CDC37Q16543 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
CDC37Q16543 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
CDC37Q16543 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
CDC37Q16543 AL596442.1-201ENST00000429305 429 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
CDC37Q16543 PGAP2-206ENST00000459679 795 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
CDC37Q16543 PRELID1P1-202ENST00000567272 903 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
CDC37Q16543 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
CDC37Q16543 ARHGEF2-204ENST00000368315 1645 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
CDC37Q16543 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
CDC37Q16543 AC138028.1-201ENST00000333666 2137 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
CDC37Q16543 XYLT2-203ENST00000507602 2107 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
CDC37Q16543 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
CDC37Q16543 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
CDC37Q16543 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
CDC37Q16543 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
CDC37Q16543 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
CDC37Q16543 CRYL1-202ENST00000382812 1581 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
CDC37Q16543 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
CDC37Q16543 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
CDC37Q16543 INO80E-207ENST00000563197 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
CDC37Q16543 SH3BP2-202ENST00000435136 2318 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
CDC37Q16543 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
CDC37Q16543 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
CDC37Q16543 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
CDC37Q16543 FAM239B-201ENST00000381106 1099 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
CDC37Q16543 DDT-202ENST00000398344 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
CDC37Q16543 DDT-203ENST00000403754 569 ntTSL 3 BASIC20.98■□□□□ 0.95
CDC37Q16543 AC093585.1-201ENST00000425183 428 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
CDC37Q16543 DDT-206ENST00000430101 573 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.5 ms