Protein–RNA interactions for Protein: Q16363

LAMA4, Laminin subunit alpha-4, humanhuman

Predictions only

Length 1,823 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAMA4Q16363 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
LAMA4Q16363 FCGRT-201ENST00000221466 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
LAMA4Q16363 PTGES-201ENST00000340607 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
LAMA4Q16363 LMNA-207ENST00000368301 2461 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
LAMA4Q16363 AC008687.8-201ENST00000599795 1748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
LAMA4Q16363 DSCR9-201ENST00000454482 1644 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
LAMA4Q16363 TMEM82-201ENST00000375782 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
LAMA4Q16363 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
LAMA4Q16363 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
LAMA4Q16363 BAG3-201ENST00000369085 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
LAMA4Q16363 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
LAMA4Q16363 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
LAMA4Q16363 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC21.54■■□□□ 1.04
LAMA4Q16363 PCED1CP-201ENST00000419887 785 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
LAMA4Q16363 PLPP5-202ENST00000422581 853 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
LAMA4Q16363 CBR1-203ENST00000439427 1024 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
LAMA4Q16363 AL136038.3-201ENST00000561909 1096 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
LAMA4Q16363 ZIC4-212ENST00000484399 1774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
LAMA4Q16363 PLD3-207ENST00000409735 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
LAMA4Q16363 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
LAMA4Q16363 TRPV4-208ENST00000544971 2295 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
LAMA4Q16363 ACSM2B-208ENST00000565322 1834 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
LAMA4Q16363 SEC14L2-215ENST00000617837 2632 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
LAMA4Q16363 EVX1-202ENST00000496902 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
LAMA4Q16363 ACVRL1-202ENST00000419526 1356 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
LAMA4Q16363 PSRC1-201ENST00000369903 1710 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
LAMA4Q16363 PSRC1-206ENST00000409267 1730 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
LAMA4Q16363 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
LAMA4Q16363 KANK3-201ENST00000330915 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
LAMA4Q16363 C11orf58-201ENST00000228136 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
LAMA4Q16363 TMEM171-201ENST00000287773 1247 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
LAMA4Q16363 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
LAMA4Q16363 AC005865.2-201ENST00000505276 2303 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
LAMA4Q16363 PSRC1-205ENST00000409138 1826 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
LAMA4Q16363 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
LAMA4Q16363 USP18-201ENST00000215794 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
LAMA4Q16363 AC120049.1-201ENST00000592638 2065 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
LAMA4Q16363 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
LAMA4Q16363 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
LAMA4Q16363 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
LAMA4Q16363 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
LAMA4Q16363 DNAJA3-203ENST00000431375 2294 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
LAMA4Q16363 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
LAMA4Q16363 MFSD2A-203ENST00000420632 1914 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
LAMA4Q16363 ANKRD10-201ENST00000267339 2495 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
LAMA4Q16363 DNAAF4-202ENST00000348518 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
LAMA4Q16363 SH2D2A-201ENST00000368198 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
LAMA4Q16363 BAALC-202ENST00000306391 243 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
LAMA4Q16363 BAALC-204ENST00000330955 222 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
LAMA4Q16363 C16orf91-201ENST00000442039 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
LAMA4Q16363 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
LAMA4Q16363 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
LAMA4Q16363 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
LAMA4Q16363 AL358472.4-201ENST00000633140 710 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
LAMA4Q16363 AC063977.6-201ENST00000600074 1763 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
LAMA4Q16363 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
LAMA4Q16363 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
LAMA4Q16363 C12orf65-202ENST00000366329 1901 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
LAMA4Q16363 HOTAIR-201ENST00000424518 2421 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
LAMA4Q16363 BTNL9-202ENST00000376841 1626 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
LAMA4Q16363 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
LAMA4Q16363 ARSA-201ENST00000216124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
LAMA4Q16363 CSAD-209ENST00000453446 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
LAMA4Q16363 SLC22A4-201ENST00000200652 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
LAMA4Q16363 GBGT1-203ENST00000372040 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
LAMA4Q16363 TOP1MT-218ENST00000523676 1982 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
LAMA4Q16363 ZNF575-201ENST00000314228 1298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
LAMA4Q16363 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
LAMA4Q16363 BIRC7-203ENST00000395306 593 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
LAMA4Q16363 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
LAMA4Q16363 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
LAMA4Q16363 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
LAMA4Q16363 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
LAMA4Q16363 AC016582.2-201ENST00000591908 446 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
LAMA4Q16363 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
LAMA4Q16363 BCL2L12-210ENST00000611631 1259 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
LAMA4Q16363 GXYLT1P4-201ENST00000613576 1192 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
LAMA4Q16363 FBXL20-205ENST00000583610 1739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
LAMA4Q16363 HNF1A-202ENST00000400024 2337 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.03
LAMA4Q16363 MBD1-208ENST00000398493 1845 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
LAMA4Q16363 ECHDC1-214ENST00000474289 2443 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
LAMA4Q16363 DCST1-204ENST00000423025 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
LAMA4Q16363 NAA60-201ENST00000360862 2522 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
LAMA4Q16363 RAPH1-211ENST00000457812 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
LAMA4Q16363 ENTPD2-202ENST00000355097 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
LAMA4Q16363 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
LAMA4Q16363 CD14-201ENST00000302014 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
LAMA4Q16363 DLGAP1-222ENST00000639615 1898 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
LAMA4Q16363 TMSB4Y-201ENST00000284856 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
LAMA4Q16363 MHENCR-202ENST00000449500 801 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
LAMA4Q16363 AC106771.1-201ENST00000502209 372 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
LAMA4Q16363 TPSP2-201ENST00000561760 610 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
LAMA4Q16363 DCTN5-208ENST00000568589 772 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
LAMA4Q16363 NAA38-203ENST00000575071 553 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
LAMA4Q16363 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
LAMA4Q16363 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
LAMA4Q16363 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
LAMA4Q16363 PIP4K2C-202ENST00000422156 1558 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
LAMA4Q16363 MEST-201ENST00000223215 2465 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
LAMA4Q16363 MCOLN1-201ENST00000264079 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
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