Protein–RNA interactions for Protein: Q15744

CEBPE, CCAAT/enhancer-binding protein epsilon, humanhuman

Predictions only

Length 281 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CEBPEQ15744 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CEBPEQ15744 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CEBPEQ15744 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CEBPEQ15744 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CEBPEQ15744 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CEBPEQ15744 RCAN3-205ENST00000436717 2574 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CEBPEQ15744 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CEBPEQ15744 ARSA-201ENST00000216124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CEBPEQ15744 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CEBPEQ15744 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CEBPEQ15744 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CEBPEQ15744 TMSB4Y-201ENST00000284856 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CEBPEQ15744 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CEBPEQ15744 GPS1-201ENST00000306823 1842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CEBPEQ15744 SLC25A48-201ENST00000274513 1880 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CEBPEQ15744 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CEBPEQ15744 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CEBPEQ15744 MST1R-214ENST00000613534 2025 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CEBPEQ15744 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CEBPEQ15744 FERMT2-204ENST00000399304 2082 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CEBPEQ15744 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CEBPEQ15744 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CEBPEQ15744 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CEBPEQ15744 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CEBPEQ15744 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CEBPEQ15744 AC140504.1-202ENST00000568222 652 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CEBPEQ15744 AC011498.2-201ENST00000588798 540 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CEBPEQ15744 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CEBPEQ15744 AC140113.3-201ENST00000605663 199 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
CEBPEQ15744 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CEBPEQ15744 FBXL22-204ENST00000638704 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CEBPEQ15744 TTC34-201ENST00000401095 8814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CEBPEQ15744 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CEBPEQ15744 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CEBPEQ15744 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
CEBPEQ15744 CACNA1B-203ENST00000371355 9647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CEBPEQ15744 RNF121-201ENST00000361756 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CEBPEQ15744 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CEBPEQ15744 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CEBPEQ15744 ZNF302-206ENST00000505242 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CEBPEQ15744 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CEBPEQ15744 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CEBPEQ15744 SP100-208ENST00000427101 1922 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CEBPEQ15744 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CEBPEQ15744 SLC23A3-203ENST00000409878 2010 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CEBPEQ15744 TRPV4-208ENST00000544971 2295 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CEBPEQ15744 ZNF205-206ENST00000620094 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CEBPEQ15744 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CEBPEQ15744 ACSL6-205ENST00000379246 2622 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CEBPEQ15744 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CEBPEQ15744 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CEBPEQ15744 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CEBPEQ15744 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CEBPEQ15744 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CEBPEQ15744 AC113404.2-201ENST00000507884 177 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
CEBPEQ15744 C17orf62-221ENST00000581196 668 ntTSL 4 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CEBPEQ15744 RBM42-202ENST00000586618 771 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CEBPEQ15744 AC005625.1-201ENST00000590304 472 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CEBPEQ15744 NBPF14-202ENST00000593495 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CEBPEQ15744 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CEBPEQ15744 AC139887.4-201ENST00000607877 719 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
CEBPEQ15744 RNASET2-213ENST00000611959 1124 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CEBPEQ15744 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CEBPEQ15744 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CEBPEQ15744 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CEBPEQ15744 SDC2-202ENST00000518385 1583 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CEBPEQ15744 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CEBPEQ15744 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CEBPEQ15744 RNPS1-219ENST00000566397 1685 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CEBPEQ15744 MFSD2A-203ENST00000420632 1914 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CEBPEQ15744 AC008764.6-201ENST00000595909 2069 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
CEBPEQ15744 NRBP1-203ENST00000379852 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CEBPEQ15744 DNAJA3-203ENST00000431375 2294 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CEBPEQ15744 SLC44A3-201ENST00000271227 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CEBPEQ15744 ATRIP-203ENST00000357105 2403 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CEBPEQ15744 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CEBPEQ15744 FMN2-201ENST00000319653 6434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
CEBPEQ15744 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
CEBPEQ15744 AC022916.1-201ENST00000590478 2658 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
CEBPEQ15744 LHX8-201ENST00000294638 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
CEBPEQ15744 PPM1G-201ENST00000344034 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
CEBPEQ15744 LINC00574-201ENST00000420557 2318 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
CEBPEQ15744 ERI1-203ENST00000519292 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
CEBPEQ15744 ADRA1A-205ENST00000380582 2089 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
CEBPEQ15744 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
CEBPEQ15744 SLC2A8-202ENST00000373360 1937 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
CEBPEQ15744 PSRC1-205ENST00000409138 1826 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
CEBPEQ15744 TNFAIP1-202ENST00000544907 1656 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CEBPEQ15744 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CEBPEQ15744 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CEBPEQ15744 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CEBPEQ15744 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CEBPEQ15744 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CEBPEQ15744 TSPY8-203ENST00000383005 435 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CEBPEQ15744 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CEBPEQ15744 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
CEBPEQ15744 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CEBPEQ15744 DUTP2-201ENST00000519164 463 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
CEBPEQ15744 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CEBPEQ15744 TMEM114-203ENST00000620492 945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.2 ms