Protein–RNA interactions for Protein: Q15651

HMGN3, High mobility group nucleosome-binding domain-containing protein 3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMGN3Q15651 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
HMGN3Q15651 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
HMGN3Q15651 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
HMGN3Q15651 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
HMGN3Q15651 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
HMGN3Q15651 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
HMGN3Q15651 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
HMGN3Q15651 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
HMGN3Q15651 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
HMGN3Q15651 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
HMGN3Q15651 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
HMGN3Q15651 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC15.49■□□□□ 0.07
HMGN3Q15651 ZNF667-AS1-208ENST00000594783 475 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
HMGN3Q15651 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
HMGN3Q15651 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
HMGN3Q15651 FAM135A-205ENST00000418814 6415 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
HMGN3Q15651 CDCP1-201ENST00000296129 6006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
HMGN3Q15651 GIT1-203ENST00000394869 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
HMGN3Q15651 TMEM198-201ENST00000344458 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
HMGN3Q15651 SLC27A2-202ENST00000380902 2181 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
HMGN3Q15651 PTPA-203ENST00000348141 2737 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
HMGN3Q15651 PTPA-207ENST00000393370 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
HMGN3Q15651 MIB2-201ENST00000355826 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
HMGN3Q15651 HHATL-201ENST00000310417 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
HMGN3Q15651 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
HMGN3Q15651 ARHGEF19-201ENST00000270747 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
HMGN3Q15651 RXRB-202ENST00000374685 2846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
HMGN3Q15651 FBXL5-202ENST00000412094 2837 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
HMGN3Q15651 EVPL-202ENST00000586740 6223 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HMGN3Q15651 DDX31-201ENST00000310532 2408 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
HMGN3Q15651 INTS11-249ENST00000618806 1523 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
HMGN3Q15651 PALM-201ENST00000264560 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.48■□□□□ 0.07
HMGN3Q15651 THOP1-205ENST00000586677 1872 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
HMGN3Q15651 ELN-207ENST00000380562 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HMGN3Q15651 CD248-201ENST00000311330 2558 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
HMGN3Q15651 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HMGN3Q15651 EGFL6-201ENST00000361306 2398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HMGN3Q15651 TMTC2-201ENST00000321196 5681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HMGN3Q15651 CASZ1-202ENST00000377022 7936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HMGN3Q15651 CADM3-201ENST00000368124 2546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HMGN3Q15651 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
HMGN3Q15651 COQ9-210ENST00000567072 1482 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
HMGN3Q15651 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HMGN3Q15651 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HMGN3Q15651 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HMGN3Q15651 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HMGN3Q15651 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
HMGN3Q15651 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
HMGN3Q15651 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HMGN3Q15651 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
HMGN3Q15651 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HMGN3Q15651 SYNE3-202ENST00000553340 2615 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HMGN3Q15651 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HMGN3Q15651 ZNF114-206ENST00000600687 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
HMGN3Q15651 WDFY4-202ENST00000360890 2193 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HMGN3Q15651 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
HMGN3Q15651 AL109659.2-201ENST00000606809 1674 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
HMGN3Q15651 RNF222-201ENST00000344001 2786 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HMGN3Q15651 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HMGN3Q15651 STRA6-209ENST00000563965 2565 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HMGN3Q15651 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HMGN3Q15651 PTPN6-204ENST00000456013 2389 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HMGN3Q15651 GABRB3-202ENST00000311550 5781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HMGN3Q15651 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HMGN3Q15651 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HMGN3Q15651 TADA1-201ENST00000367874 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HMGN3Q15651 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HMGN3Q15651 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HMGN3Q15651 NPNT-203ENST00000427316 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HMGN3Q15651 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HMGN3Q15651 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HMGN3Q15651 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HMGN3Q15651 KRT18P41-201ENST00000518924 1277 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
HMGN3Q15651 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HMGN3Q15651 NDUFS7-210ENST00000539480 1743 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HMGN3Q15651 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HMGN3Q15651 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
HMGN3Q15651 AC005498.3-201ENST00000596587 2045 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HMGN3Q15651 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
HMGN3Q15651 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HMGN3Q15651 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HMGN3Q15651 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HMGN3Q15651 ASB6-203ENST00000450050 4535 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HMGN3Q15651 DNAJB2-201ENST00000336576 3176 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HMGN3Q15651 SCRIB-202ENST00000356994 5218 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HMGN3Q15651 MBD1-206ENST00000382948 2434 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HMGN3Q15651 PTTG1IP-203ENST00000397887 2413 ntTSL 4 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HMGN3Q15651 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HMGN3Q15651 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HMGN3Q15651 DPYSL4-202ENST00000368627 1545 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HMGN3Q15651 PDE4D-204ENST00000358923 2969 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HMGN3Q15651 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HMGN3Q15651 PTPDC1-202ENST00000375360 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HMGN3Q15651 SH2B1-216ENST00000618521 2935 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HMGN3Q15651 PCDHGC5-202ENST00000610789 2763 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HMGN3Q15651 GSDMD-206ENST00000526406 2496 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
HMGN3Q15651 SOST-201ENST00000301691 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
HMGN3Q15651 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
HMGN3Q15651 PRSS23-209ENST00000533902 2043 ntTSL 4 BASIC15.46■□□□□ 0.07
HMGN3Q15651 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
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