Protein–RNA interactions for Protein: Q15431

SYCP1, Synaptonemal complex protein 1, humanhuman

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Length 976 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYCP1Q15431 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
SYCP1Q15431 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
SYCP1Q15431 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
SYCP1Q15431 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
SYCP1Q15431 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
SYCP1Q15431 NOL4L-205ENST00000375678 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
SYCP1Q15431 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
SYCP1Q15431 POLR1D-220ENST00000637071 1943 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
SYCP1Q15431 CIZ1-226ENST00000629610 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
SYCP1Q15431 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
SYCP1Q15431 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SYCP1Q15431 TJP3-201ENST00000539908 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
SYCP1Q15431 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SYCP1Q15431 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SYCP1Q15431 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SYCP1Q15431 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
SYCP1Q15431 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SYCP1Q15431 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
SYCP1Q15431 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
SYCP1Q15431 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
SYCP1Q15431 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SYCP1Q15431 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SYCP1Q15431 PTGDR-201ENST00000306051 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SYCP1Q15431 TPBG-203ENST00000543496 2881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
SYCP1Q15431 SMG5-201ENST00000361813 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SYCP1Q15431 RAB8A-201ENST00000300935 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SYCP1Q15431 KDSR-202ENST00000406396 5447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SYCP1Q15431 SENP5-201ENST00000323460 6308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SYCP1Q15431 ISM1-201ENST00000262487 2593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
SYCP1Q15431 SAAL1-201ENST00000300013 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SYCP1Q15431 LMNA-207ENST00000368301 2461 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SYCP1Q15431 NELFA-216ENST00000542778 2465 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SYCP1Q15431 SYNPO-201ENST00000307662 5374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SYCP1Q15431 GUCA1A-205ENST00000541991 1921 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SYCP1Q15431 SNTB1-201ENST00000395601 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SYCP1Q15431 HS3ST2-201ENST00000261374 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SYCP1Q15431 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SYCP1Q15431 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SYCP1Q15431 CBL-204ENST00000634840 4813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SYCP1Q15431 ADIRF-AS1-201ENST00000418273 2627 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SYCP1Q15431 GNE-204ENST00000539208 2190 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SYCP1Q15431 AMN1-201ENST00000281471 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SYCP1Q15431 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SYCP1Q15431 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SYCP1Q15431 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SYCP1Q15431 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
SYCP1Q15431 ADGRD1-AS1-202ENST00000542980 1277 ntTSL 4 BASIC20.37■□□□□ 0.85
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SYCP1Q15431 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
SYCP1Q15431 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SYCP1Q15431 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
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SYCP1Q15431 ZBTB44-201ENST00000357899 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SYCP1Q15431 RRP7BP-201ENST00000357802 2375 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SYCP1Q15431 KRT23-201ENST00000209718 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SYCP1Q15431 TNIP1-211ENST00000521591 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SYCP1Q15431 PP7080-201ENST00000342584 1876 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SYCP1Q15431 ACAP1-201ENST00000158762 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
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SYCP1Q15431 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
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SYCP1Q15431 AC080080.1-201ENST00000625121 2420 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
SYCP1Q15431 PRKCD-201ENST00000330452 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SYCP1Q15431 ADAMTS16-203ENST00000511368 2682 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SYCP1Q15431 ZBTB32-201ENST00000262630 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
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SYCP1Q15431 ZADH2-201ENST00000322342 7732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
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SYCP1Q15431 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SYCP1Q15431 TPD52L1-213ENST00000534000 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SYCP1Q15431 CLDN9-201ENST00000445369 2050 ntAPPRIS P1 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SYCP1Q15431 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SYCP1Q15431 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SYCP1Q15431 POC1B-GALNT4-201ENST00000547474 2207 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SYCP1Q15431 DTX2-201ENST00000324432 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SYCP1Q15431 PTPRF-209ENST00000438120 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SYCP1Q15431 SRRM2-201ENST00000301740 9353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SYCP1Q15431 KANK1-204ENST00000382293 5249 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SYCP1Q15431 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SYCP1Q15431 EWSR1-222ENST00000629659 2446 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SYCP1Q15431 THOP1-205ENST00000586677 1872 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SYCP1Q15431 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SYCP1Q15431 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SYCP1Q15431 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SYCP1Q15431 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SYCP1Q15431 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
SYCP1Q15431 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SYCP1Q15431 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SYCP1Q15431 STXBP3-201ENST00000370008 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SYCP1Q15431 PSTK-201ENST00000368887 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SYCP1Q15431 FAM110A-203ENST00000381939 1737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SYCP1Q15431 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
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