Protein–RNA interactions for Protein: Q15034

HERC3, Probable E3 ubiquitin-protein ligase HERC3, humanhuman

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Length 1,050 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC3Q15034 STK11-201ENST00000326873 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
HERC3Q15034 RAB40C-203ENST00000535977 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
HERC3Q15034 FNBP1-201ENST00000355681 1977 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
HERC3Q15034 RNPS1-203ENST00000397086 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
HERC3Q15034 AP001476.1-201ENST00000451618 2198 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
HERC3Q15034 PMEPA1-202ENST00000341744 4845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
HERC3Q15034 RREB1-201ENST00000334984 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
HERC3Q15034 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
HERC3Q15034 FNBP1-202ENST00000420781 5410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
HERC3Q15034 MEST-201ENST00000223215 2465 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
HERC3Q15034 AGPAT3-201ENST00000291572 5546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
HERC3Q15034 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
HERC3Q15034 SPTBN4-204ENST00000392025 8671 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
HERC3Q15034 ZNF416-201ENST00000196489 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
HERC3Q15034 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
HERC3Q15034 ZNF420-201ENST00000304239 1945 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
HERC3Q15034 USP18-201ENST00000215794 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
HERC3Q15034 TMEM45B-201ENST00000281441 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
HERC3Q15034 SPPL2C-201ENST00000329196 2238 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
HERC3Q15034 TLE3-214ENST00000558939 6004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
HERC3Q15034 PIGQ-203ENST00000321878 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
HERC3Q15034 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
HERC3Q15034 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
HERC3Q15034 ABHD11-207ENST00000458339 890 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
HERC3Q15034 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
HERC3Q15034 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
HERC3Q15034 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
HERC3Q15034 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
HERC3Q15034 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
HERC3Q15034 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
HERC3Q15034 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
HERC3Q15034 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
HERC3Q15034 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
HERC3Q15034 MTMR1-208ENST00000445323 4516 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
HERC3Q15034 CLIP2-202ENST00000361545 5445 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
HERC3Q15034 HR-202ENST00000381418 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
HERC3Q15034 IL18BP-207ENST00000404792 2172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
HERC3Q15034 TRIM8-201ENST00000302424 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
HERC3Q15034 UBAP1-203ENST00000379186 2524 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
HERC3Q15034 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
HERC3Q15034 CIRBP-202ENST00000413636 1606 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
HERC3Q15034 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
HERC3Q15034 DVL2-209ENST00000575458 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
HERC3Q15034 SULT1A1-204ENST00000395609 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
HERC3Q15034 POR-209ENST00000439269 1858 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
HERC3Q15034 NRG2-205ENST00000361474 3020 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
HERC3Q15034 RGS20-203ENST00000344277 1667 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
HERC3Q15034 ULK3-220ENST00000569437 2611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
HERC3Q15034 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
HERC3Q15034 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
HERC3Q15034 ZNF133-210ENST00000535822 2341 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
HERC3Q15034 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
HERC3Q15034 ZNF865-201ENST00000568956 4005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
HERC3Q15034 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
HERC3Q15034 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
HERC3Q15034 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
HERC3Q15034 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
HERC3Q15034 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
HERC3Q15034 SIGLEC15-202ENST00000546268 1054 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
HERC3Q15034 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
HERC3Q15034 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
HERC3Q15034 WSCD1-209ENST00000574232 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
HERC3Q15034 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
HERC3Q15034 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
HERC3Q15034 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
HERC3Q15034 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
HERC3Q15034 C3orf18-201ENST00000357203 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
HERC3Q15034 OLFM1-201ENST00000252854 2591 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
HERC3Q15034 KCTD12-201ENST00000377474 6225 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
HERC3Q15034 FAM110A-203ENST00000381939 1737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
HERC3Q15034 C18orf8-201ENST00000269221 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
HERC3Q15034 STAMBPL1-203ENST00000371926 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
HERC3Q15034 WBP2-219ENST00000626827 1867 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
HERC3Q15034 AC008878.3-201ENST00000617428 4964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
HERC3Q15034 RWDD4-202ENST00000327570 2590 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
HERC3Q15034 PRODH-205ENST00000420436 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
HERC3Q15034 FZD10-202ENST00000539839 3282 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
HERC3Q15034 NOX4-201ENST00000263317 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
HERC3Q15034 BCL7A-203ENST00000538010 6247 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
HERC3Q15034 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
HERC3Q15034 AC139713.2-201ENST00000641328 2723 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
HERC3Q15034 EIF3B-201ENST00000360876 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
HERC3Q15034 C1orf159-205ENST00000421241 1841 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
HERC3Q15034 ZDHHC23-201ENST00000330212 3778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
HERC3Q15034 SLC27A2-202ENST00000380902 2181 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
HERC3Q15034 FAM129C-202ENST00000335393 2508 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
HERC3Q15034 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
HERC3Q15034 KIAA1522-204ENST00000401073 5438 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
HERC3Q15034 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
HERC3Q15034 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
HERC3Q15034 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
HERC3Q15034 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
HERC3Q15034 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
HERC3Q15034 AC006942.1-201ENST00000600669 520 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
HERC3Q15034 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
HERC3Q15034 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
HERC3Q15034 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
HERC3Q15034 GOLGA7-204ENST00000520817 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
HERC3Q15034 EHMT1-203ENST00000460843 5137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
HERC3Q15034 KCTD2-201ENST00000322444 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
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