Protein–RNA interactions for Protein: Q15032

R3HDM1, R3H domain-containing protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,099 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
R3HDM1Q15032 ARMC7-204ENST00000582136 1204 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
R3HDM1Q15032 CITED2-204ENST00000618718 901 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
R3HDM1Q15032 AC009154.2-201ENST00000621177 724 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
R3HDM1Q15032 AC092902.2-205ENST00000622381 394 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
R3HDM1Q15032 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
R3HDM1Q15032 PSMD11-202ENST00000457654 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
R3HDM1Q15032 DHRS4L2-203ENST00000534993 1450 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
R3HDM1Q15032 RBFOX1-207ENST00000547338 1513 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
R3HDM1Q15032 POLR2M-206ENST00000494490 1648 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
R3HDM1Q15032 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
R3HDM1Q15032 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
R3HDM1Q15032 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
R3HDM1Q15032 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
R3HDM1Q15032 GOSR2-201ENST00000225567 1245 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
R3HDM1Q15032 LCE1D-201ENST00000326233 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
R3HDM1Q15032 IL32-205ENST00000396890 1067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
R3HDM1Q15032 YAE1D1-202ENST00000432096 968 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
R3HDM1Q15032 UGT1A2P-201ENST00000454886 866 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
R3HDM1Q15032 OST4-203ENST00000456793 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
R3HDM1Q15032 IL32-223ENST00000534507 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
R3HDM1Q15032 IL32-227ENST00000548652 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
R3HDM1Q15032 IL32-233ENST00000552664 731 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
R3HDM1Q15032 COX5A-202ENST00000562233 441 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
R3HDM1Q15032 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
R3HDM1Q15032 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
R3HDM1Q15032 SEH1L-202ENST00000399892 1846 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
R3HDM1Q15032 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
R3HDM1Q15032 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
R3HDM1Q15032 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
R3HDM1Q15032 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
R3HDM1Q15032 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
R3HDM1Q15032 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
R3HDM1Q15032 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
R3HDM1Q15032 IGLL3P-201ENST00000412472 434 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
R3HDM1Q15032 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
R3HDM1Q15032 AP000695.1-201ENST00000429588 893 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
R3HDM1Q15032 UFL1-AS1-201ENST00000430796 548 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
R3HDM1Q15032 AL391845.1-202ENST00000449154 437 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
R3HDM1Q15032 SMN2-210ENST00000511812 867 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
R3HDM1Q15032 BCAR1-209ENST00000546196 1340 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
R3HDM1Q15032 GNG2-209ENST00000555472 908 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
R3HDM1Q15032 Z94160.2-201ENST00000609322 910 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
R3HDM1Q15032 AC091812.2-201ENST00000619081 385 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
R3HDM1Q15032 LINC01666-201ENST00000623794 845 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
R3HDM1Q15032 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
R3HDM1Q15032 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
R3HDM1Q15032 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
R3HDM1Q15032 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
R3HDM1Q15032 PSMC5-202ENST00000375812 1494 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
R3HDM1Q15032 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
R3HDM1Q15032 HNRNPFP1-201ENST00000391730 1133 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
R3HDM1Q15032 AP1S3-203ENST00000396654 830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
R3HDM1Q15032 AC016735.2-201ENST00000438736 569 ntTSL 4 BASIC22.94■■□□□ 1.26
R3HDM1Q15032 CCDC159-201ENST00000458408 1062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
R3HDM1Q15032 GSTZ1-207ENST00000553586 979 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
R3HDM1Q15032 KRT19P2-202ENST00000557173 1012 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
R3HDM1Q15032 AC005544.2-201ENST00000579138 229 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
R3HDM1Q15032 AC008105.3-202ENST00000585471 1077 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
R3HDM1Q15032 AC004790.2-201ENST00000623588 572 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
R3HDM1Q15032 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
R3HDM1Q15032 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
R3HDM1Q15032 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
R3HDM1Q15032 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
R3HDM1Q15032 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
R3HDM1Q15032 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
R3HDM1Q15032 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
R3HDM1Q15032 GMPPA-202ENST00000341142 1524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
R3HDM1Q15032 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
R3HDM1Q15032 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
R3HDM1Q15032 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
R3HDM1Q15032 MRPL43-201ENST00000299179 747 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
R3HDM1Q15032 YIF1B-203ENST00000339413 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
R3HDM1Q15032 FBXO44-205ENST00000376768 959 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
R3HDM1Q15032 ELK2BP-201ENST00000415014 1224 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
R3HDM1Q15032 BASP1P1-201ENST00000430708 665 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
R3HDM1Q15032 AC024230.1-201ENST00000511431 889 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
R3HDM1Q15032 GRIFIN-202ENST00000614228 461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
R3HDM1Q15032 PUF60-201ENST00000313352 1804 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
R3HDM1Q15032 UBE2I-207ENST00000406620 1842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
R3HDM1Q15032 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
R3HDM1Q15032 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
R3HDM1Q15032 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
R3HDM1Q15032 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
R3HDM1Q15032 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
R3HDM1Q15032 OGFOD2-211ENST00000538628 1696 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
R3HDM1Q15032 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
R3HDM1Q15032 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
R3HDM1Q15032 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
R3HDM1Q15032 TMED3-201ENST00000299705 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
R3HDM1Q15032 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
R3HDM1Q15032 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
R3HDM1Q15032 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
R3HDM1Q15032 P2RY6-201ENST00000349767 1700 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
R3HDM1Q15032 DYNLL1-201ENST00000242577 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
R3HDM1Q15032 AL022341.1-201ENST00000455294 389 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
R3HDM1Q15032 CD4-210ENST00000541982 1187 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
R3HDM1Q15032 OAZ1-202ENST00000582888 969 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
R3HDM1Q15032 AC084346.2-201ENST00000607097 949 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
R3HDM1Q15032 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
R3HDM1Q15032 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.8 ms