Protein–RNA interactions for Protein: Q14590

ZNF235, Zinc finger protein 235, humanhuman

Predictions only

Length 738 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF235Q14590 AC060780.1-201ENST00000635600 1782 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
ZNF235Q14590 EHMT1-204ENST00000462484 2707 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
ZNF235Q14590 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC18.67■□□□□ 0.58
ZNF235Q14590 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
ZNF235Q14590 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
ZNF235Q14590 MRM2-203ENST00000440306 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
ZNF235Q14590 NMRK1-203ENST00000376811 2050 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
ZNF235Q14590 PLBD2-201ENST00000280800 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
ZNF235Q14590 VASH1-201ENST00000167106 5728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
ZNF235Q14590 NUMBL-202ENST00000540131 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
ZNF235Q14590 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC18.66■□□□□ 0.58
ZNF235Q14590 ATP2A3-201ENST00000309890 4826 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
ZNF235Q14590 ZNF114-206ENST00000600687 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
ZNF235Q14590 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
ZNF235Q14590 NIPAL2-202ENST00000430223 4496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
ZNF235Q14590 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
ZNF235Q14590 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
ZNF235Q14590 LONP1-215ENST00000593119 2918 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
ZNF235Q14590 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
ZNF235Q14590 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
ZNF235Q14590 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
ZNF235Q14590 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
ZNF235Q14590 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
ZNF235Q14590 TSPY8-203ENST00000383005 435 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
ZNF235Q14590 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.66■□□□□ 0.58
ZNF235Q14590 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
ZNF235Q14590 AC114763.1-202ENST00000414911 867 ntTSL 3 BASIC18.66■□□□□ 0.58
ZNF235Q14590 PVRIG2P-201ENST00000435460 978 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
ZNF235Q14590 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC18.66■□□□□ 0.58
ZNF235Q14590 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
ZNF235Q14590 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
ZNF235Q14590 KRT18P38-201ENST00000449496 1282 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
ZNF235Q14590 IAH1-202ENST00000470914 2137 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
ZNF235Q14590 REEP1-209ENST00000541910 969 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
ZNF235Q14590 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC18.66■□□□□ 0.58
ZNF235Q14590 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
ZNF235Q14590 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
ZNF235Q14590 GMCL1P1-201ENST00000463439 1581 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
ZNF235Q14590 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
ZNF235Q14590 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
ZNF235Q14590 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
ZNF235Q14590 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
ZNF235Q14590 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
ZNF235Q14590 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
ZNF235Q14590 TBX18-202ENST00000369663 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
ZNF235Q14590 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
ZNF235Q14590 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
ZNF235Q14590 ADCY3-201ENST00000260600 5050 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
ZNF235Q14590 RPS6KA3-201ENST00000379565 7918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
ZNF235Q14590 FZR1-203ENST00000441788 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
ZNF235Q14590 KCNQ2-218ENST00000629676 2399 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
ZNF235Q14590 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
ZNF235Q14590 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
ZNF235Q14590 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
ZNF235Q14590 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
ZNF235Q14590 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
ZNF235Q14590 BMP2K-208ENST00000628286 3848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
ZNF235Q14590 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
ZNF235Q14590 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
ZNF235Q14590 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
ZNF235Q14590 LUC7L-221ENST00000629543 1520 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
ZNF235Q14590 CNNM3-202ENST00000377060 3308 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
ZNF235Q14590 SEMA3C-201ENST00000265361 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
ZNF235Q14590 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
ZNF235Q14590 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
ZNF235Q14590 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
ZNF235Q14590 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
ZNF235Q14590 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
ZNF235Q14590 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
ZNF235Q14590 AC112907.2-201ENST00000448639 330 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
ZNF235Q14590 AL136038.4-201ENST00000603606 1261 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
ZNF235Q14590 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
ZNF235Q14590 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
ZNF235Q14590 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
ZNF235Q14590 OARD1-202ENST00000424266 1337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
ZNF235Q14590 SNTB1-201ENST00000395601 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
ZNF235Q14590 RPL32-202ENST00000396953 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
ZNF235Q14590 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
ZNF235Q14590 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
ZNF235Q14590 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
ZNF235Q14590 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
ZNF235Q14590 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
ZNF235Q14590 SDK1-202ENST00000404826 10397 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
ZNF235Q14590 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.58
ZNF235Q14590 MAFF-207ENST00000538999 2365 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.58
ZNF235Q14590 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.58
ZNF235Q14590 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
ZNF235Q14590 HAUS8-202ENST00000448593 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.58
ZNF235Q14590 CIAO1-203ENST00000488633 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
ZNF235Q14590 BAZ1A-203ENST00000382422 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
ZNF235Q14590 SMC4-201ENST00000344722 5356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
ZNF235Q14590 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
ZNF235Q14590 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
ZNF235Q14590 NIFK-201ENST00000285814 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
ZNF235Q14590 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
ZNF235Q14590 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
ZNF235Q14590 DOC2A-208ENST00000564944 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
ZNF235Q14590 ABCD1-202ENST00000370129 1016 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
ZNF235Q14590 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
ZNF235Q14590 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.6 ms