Protein–RNA interactions for Protein: Q14563

SEMA3A, Semaphorin-3A, humanhuman

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Length 771 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA3AQ14563 AC138430.1-201ENST00000586064 5409 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SEMA3AQ14563 KMT2E-207ENST00000476671 2523 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SEMA3AQ14563 ABHD13-201ENST00000375898 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SEMA3AQ14563 CABIN1-202ENST00000337989 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SEMA3AQ14563 CD276-203ENST00000537340 2439 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SEMA3AQ14563 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SEMA3AQ14563 HNF1A-202ENST00000400024 2337 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SEMA3AQ14563 GPANK1-204ENST00000375900 1814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SEMA3AQ14563 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SEMA3AQ14563 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SEMA3AQ14563 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SEMA3AQ14563 AC131097.3-201ENST00000413820 1228 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SEMA3AQ14563 AC074183.1-201ENST00000439105 782 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SEMA3AQ14563 CR769775.1-204ENST00000439760 747 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SEMA3AQ14563 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SEMA3AQ14563 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SEMA3AQ14563 AL132780.2-201ENST00000557615 1021 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SEMA3AQ14563 MTHFS-202ENST00000559722 948 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SEMA3AQ14563 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
SEMA3AQ14563 MIR3180-4-201ENST00000582223 153 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
SEMA3AQ14563 AC015961.2-201ENST00000589281 701 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SEMA3AQ14563 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SEMA3AQ14563 AL157888.1-201ENST00000631930 593 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
SEMA3AQ14563 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SEMA3AQ14563 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SEMA3AQ14563 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SEMA3AQ14563 MCCC1-214ENST00000610757 2410 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SEMA3AQ14563 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SEMA3AQ14563 CSK-201ENST00000220003 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SEMA3AQ14563 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SEMA3AQ14563 AL590648.2-201ENST00000427949 2225 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SEMA3AQ14563 SLC37A2-203ENST00000403796 2910 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SEMA3AQ14563 LMNA-207ENST00000368301 2461 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SEMA3AQ14563 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SEMA3AQ14563 TSHZ3-201ENST00000240587 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SEMA3AQ14563 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SEMA3AQ14563 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SEMA3AQ14563 ZNRF2-201ENST00000323037 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SEMA3AQ14563 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SEMA3AQ14563 PANX1-201ENST00000227638 2769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SEMA3AQ14563 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SEMA3AQ14563 NFKB2-201ENST00000189444 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SEMA3AQ14563 TRABD-201ENST00000303434 2329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SEMA3AQ14563 LINC00574-201ENST00000420557 2318 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SEMA3AQ14563 APP-203ENST00000354192 3167 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SEMA3AQ14563 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SEMA3AQ14563 AZU1-201ENST00000233997 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SEMA3AQ14563 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SEMA3AQ14563 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SEMA3AQ14563 RUVBL1-202ENST00000464873 2126 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SEMA3AQ14563 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SEMA3AQ14563 WSCD1-209ENST00000574232 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SEMA3AQ14563 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SEMA3AQ14563 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SEMA3AQ14563 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SEMA3AQ14563 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
SEMA3AQ14563 CIAO1-203ENST00000488633 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SEMA3AQ14563 SLC39A5-201ENST00000266980 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SEMA3AQ14563 SLC23A3-207ENST00000455516 2048 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SEMA3AQ14563 FPGS-201ENST00000373225 2278 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SEMA3AQ14563 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SEMA3AQ14563 MBD1-208ENST00000398493 1845 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SEMA3AQ14563 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SEMA3AQ14563 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SEMA3AQ14563 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SEMA3AQ14563 HPS3-202ENST00000460120 2745 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.5
SEMA3AQ14563 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
SEMA3AQ14563 MECP2-205ENST00000453960 1729 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SEMA3AQ14563 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SEMA3AQ14563 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SEMA3AQ14563 DTX2-211ENST00000446600 2281 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SEMA3AQ14563 TRPV4-208ENST00000544971 2295 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SEMA3AQ14563 AC020763.4-201ENST00000623414 4170 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
SEMA3AQ14563 HAUS8-202ENST00000448593 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SEMA3AQ14563 PNLDC1-207ENST00000610273 1940 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SEMA3AQ14563 POLR1D-220ENST00000637071 1943 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SEMA3AQ14563 MAEA-201ENST00000264750 2058 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SEMA3AQ14563 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SEMA3AQ14563 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SEMA3AQ14563 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
SEMA3AQ14563 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SEMA3AQ14563 MAP3K13-213ENST00000454237 526 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SEMA3AQ14563 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SEMA3AQ14563 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SEMA3AQ14563 AL441883.1-201ENST00000566170 1045 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
SEMA3AQ14563 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SEMA3AQ14563 ARHGAP23-222ENST00000622683 5964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SEMA3AQ14563 ACADVL-205ENST00000543245 2227 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SEMA3AQ14563 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SEMA3AQ14563 C19orf57-208ENST00000591586 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SEMA3AQ14563 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SEMA3AQ14563 SLC23A3-203ENST00000409878 2010 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SEMA3AQ14563 NAP1L5-201ENST00000323061 2321 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SEMA3AQ14563 MEN1-203ENST00000337652 3162 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SEMA3AQ14563 IL17RC-201ENST00000295981 2621 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SEMA3AQ14563 EIPR1-201ENST00000382125 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SEMA3AQ14563 LPAR2-201ENST00000407877 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SEMA3AQ14563 ATRIP-203ENST00000357105 2403 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SEMA3AQ14563 PTPRJ-202ENST00000440289 3158 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SEMA3AQ14563 CDH23-212ENST00000616684 4814 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
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